Job Description P11988 Confidence 98.23% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 132 Aligned Residues 272 % Identity 14% Template c2c8nD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:alpha-l-arabinofuranosidase; PDBTitle: the structure of a family 51 arabinofuranosidase, araf51,2 from clostridium thermocellum in complex with 1,3-linked3 arabinoside of xylobiose. Resolution 2.9 Å

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		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	P
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	D	V	I	E	L	V	K	E	L	N	V	P	I	I	R	Y	P	G	G	N	F	V	S	N	Y	F	W	E	D	G	V	G	P	V	E	D	R	P	R	R	L	D	L	A	W	K	S	I	E	P	N	Q	V	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	F	A	K	W	C	K	K	V	N	A	E	I
Template Known Secondary structure												T							S		S	G	G	G	G	G			G	G	G	G	S	S		T	T	T							T	T	T	T							S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.											.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.									.	.	.	.	.	160	.	.	.					.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Query Sequence		L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K	.	.	.	.	V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	M	A	V	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	R	G	I	S	D	A	C	N	L	L	E	Y	C	N	H	P	G	G	S	K	Y	S	D	M	R	I	K	H	G	V	K	E	P	H	N	I	K	V	W	C	L	G	N	A	M	D	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	W	Q	V	G
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																	S	S	S									T	T			S										S					.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.													.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.									.	.	.	.	180	.
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q	A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	K	T	M	D	E	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	R	I	A	E	E	T	A	R	A	M	K	M	I	D	P	S	I	E	L	V	A	C	G	S	S	S	K	D	M	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.																	T	T									S		T	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		182	.	.	.	.	.								.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I	P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	Q	W	E	A	T	V	L	D	Y	A	Y	D	Y	V	D	Y	I	S	L	H	Q	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	K	E	N	D	T	A	D	F	L	A	K	S	D	D	L	D	D	F	I	R	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											G	G	G											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T								T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		349	350	.	.	.	.												.	.	.	.	.	360	.	.	.	.															.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	W	D	R	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.
Template Sequence		V	I	A	T	C	D	Y	I	K	A	K	K	R	S	K	K	D	I	Y	L	S	F	D	E	W	N	V	W	Y	H	S	N	N	E	D	A	N	I	Q	N	E	P	W	R	I	A	P	P	L	L	E	D	I	Y	T	F	E	D	A	L	L	V	G	L	M	L	I	T	L	M	K	.	.	.	H	A	D	R	I	K
Template Known Secondary structure														T		S															T	T										S				S	S				S					B																	.	.	.	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.	.
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I	K	T	R	G
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Sequence		I	A	C	L	A	Q	L	I	N	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	P	I	V	T	E	R	N	.	.	.	.	.	G	G	A	A	W	R	Q	T	I	F	Y	P	F	M	H	A	S	K	Y	G	R
Template Known Secondary structure								S	B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S					S	S	.	.	.	.	.	S							T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.												.	.	.	360	.	.	.	.	.						.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.