Job Description P11988 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:02 GMT 2012 Rank 35 Aligned Residues 305 % Identity 14% Template c1xyzA_ PDB info PDB header:glycosyltransferase Chain: A: PDB Molecule:1,4-beta-d-xylan-xylanohydrolase; PDBTitle: a common protein fold and similar active site in two2 distinct families of beta-glycanases Resolution 1.40 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	T	F	L	W	G	G	A	T	A	A	N	Q	V	E	G	A	W	Q	E	D	G	K	G	I	S	T	S	D	L	Q	P	H	G	V	M	G	K	M	E	P	R	I	L	G	K	E	N	I	K	D	V	A	I	D	F	Y	H	R	Y	P	E	D	I	A	L	F	A	E	M	G	F	T	C	L	R	I	S	I	A
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	I	K	I	G	T	C	V	N	Y	P	F	Y	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	P	T	Y	N	S	I	.	.	.	.	.	L	Q	R	E	F	S	M	V	V	C	E	N	E	M	K
Template Known Secondary structure		T	T									T					T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.						S					S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540																																					.	.	.	.	.	.	.	.						.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.			120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		W	A	R	I	F	P	Q	G	D	E	V	E	P	N	E	A	G	L	A	F	Y	D	R	L	F	D	E	M	A	Q	A	G	I	K	.	.	P	L	V	T	L	S	H	Y	E	M	P	Y	G	L	V	K	N	Y	G	G	W	A	N	R	A	V	I	D	H	F	E	H	Y	A	R	T	V	F	T	R	Y	Q	H	K
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.																	.	.																	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.																																			.	.
Template Sequence		F	D	A	L	Q	P	R	Q	N	V	F	D	F	.	.	.	.	.	S	K	G	D	Q	L	L	A	F	A	E	R	N	G	M	Q	M	R	G	H	T	L	I	W	H	N	Q	N	P	S	W	L	T	N	.	.	G	N	W	N	R	D	S	L	L	A	V	M	K	N	H	I	T	T	V	M	T	H	Y	K	G	K
Template Known Secondary structure							S	B	T	T	B				.	.	.	.	.													T	T											S	S	S							T	.	.	S																						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.																																			.	.
Template SS confidence
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.						.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610			.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	L	W	L	T	F	N	E	I	N	M	S	L	H	A	P	F	T	G	V	G	L	A	E	E	S	G	E	A	E	V	Y	Q	A	I	H	H	Q	L	V	A	S	A	R	A	V	K	A	C	H	S	L	L	P	E	A	K	I	G	N	M	L	L	G	G	L	V	Y	P	L	T	C	Q	P	Q	D	M	L	Q
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	E	W	D	V	A	N	E	C	M	D	D	S	G	N	G	L	R	S	S	I	W	R	N	V	I	G	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	D	Y	A	F	R	Y	A	R	E	A	D	P	D	A	L	L	F	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S							S		B		T	T	S	S	S	B											T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		637	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.												.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	M	E	E	N	R	R	W	M	F	F	G	D	V	Q	A	R	G	Q	Y	P	G	Y	M	Q	R	F	F	R	D	H	N	I	T	I	E	M	T	E	S	D	A	E	D	L	K	H	T	V	D	F	I	S	F	S	Y	Y	M	T	G	C	V	S	H	D	E	S	I	N	K	N	A	Q	G	N	I	L	N	M	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	N	I	E	D	L	G	P	K	S	N	A	V	F	N	M	I	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	K	E	R	G	V	P	I	D	G	V	G	F	Q	C	H	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S		S	S	S	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												688	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.												.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	N	P	H	L	K	S	S	E	W	G	W	Q	I	D	P	V	G	L	R	V	L	L	N	T	L	W	D	R	Y	Q	K	P	L	F	I	V	E	N	G	L	G	A	K	D	S	V	E	A	D	G	S	I	Q	D	D	Y	R	I	A	Y	L	N	D	H	L	V	Q	V	N	E	A	I	A	D	G	V	D	I	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																				.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																				.																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	I	N	G	M	S	P	E	Y	L	A	S	I	D	Q	N	I	K	R	Y	.	A	E	I	G	V	I	V	S	F	T	E	I	D	I	R	I	P	Q	S	E	.	.	.	.	.	.	N	P	A	T	A	F	Q	V	Q	A	N	N	Y	K	E	L	M	K	I	C	L	A	N	P	N	C	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.		S	S																	.			T	T														T	T	S	.	.	.	.	.	.																								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																				.																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									725	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.		.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.							.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.				.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.
Query Sequence		G	Y	T	S	W	G	P	I	D	L	V	S	A	S	H	S	Q	M	S	K	R	.	.	.	Y	G	F	I	Y	V	D	R	D	D	N	G	E	G	S	L	T	R	T	R	K	K	S	F	G	W	Y	A	E	V	I
Query Conservation																							.	.	.
Alig confidence																		.					.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	F	V	M	W	G	F	T	D	K	Y	T	W	I	P	G	.	T	F	P	G	Y	G	N	P	L	I	Y	D	S	N	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	P	A	Y	N	A	I	K	E	A	L
Template Known Secondary structure						S		S	B	T	T	S		S				.		S	T	T					S	S	B		T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																		.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		791	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.		.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.											.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.