Job Description P26458 Confidence 10.67% Date Thu Jan 5 11:42:54 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 295 % Identity 13% Template c2xq2A_ PDB info PDB header:transport protein Chain: A: PDB Molecule:sodium/glucose cotransporter; PDBTitle: structure of the k294a mutant of vsglt Resolution 2.73 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.							.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Y	E	T	L	R	F	I	W	W	L	L	I	G	V	I	L	V	V	F	M	I	S	D	G	F	D	M	G	I	G	C	L	L	P	L	V	A	R	N	D	D	E	R	R	I	V	I	N	S	V	G	A	H	W	E	G	N	Q	V	W	L	I	L	A	G	G	A	L	F	A	A	W	.	.	.	.	.	.	P
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	V	I	Q	V	F	F	L	V	L	G	G	F	M	T	T	Y	M	A	V	S	F	I	G	G	T	D	G	W	F	A	G	V	S	K	M	V	D	A	A	P	G	H	F	E	M	I	L	D	Q	S	N	P	Q	Y	M	N	L	P	G	I	A	V	L	I	G	G	L	W	V	A	N	L	Y	Y	W	G	F	N	Q
Template Known Secondary structure																										G	G	G														G	G	G	S		S	S			S	S	S	G	G	G	G	T	S		T	T					S	T										T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.				.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Query Sequence		R	V	Y	A	A	A	F	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Y	V	A	M	I	L	V	L	C	S	L	F	F	R	P	L	A	F	D	Y	R	.	.	.	G	K	I	A	D	A	R	W	R	K	M	W	D	A	G	L	V	I	G	S	L	V	P	P	V	V	F	G	I
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	I	I	Q	R	T	L	A	A	K	S	V	S	E	A	Q	K	G	I	V	F	A	A	F	L	A	L	I	V	P	F	L	V	V	L	P	G	I	A	A	Y	V	I	T	S	D	P	Q	L	M	A	S	L	G	N	L	P	S	A	A	N	A	D	K	A	Y	P	W	L	T	Q	F	L	P	V	G	V	K	G	V
Template Known Secondary structure		S							T	T	S																T	T	T						T											T														S	T	B	G	G	G								T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	G	N	L	L	L	G	V	P	F	A	F	T	P	Q	L	R	V	E	Y	L	G	S	F	W	Q	L	L	T	P	F	P	L	L	C	G	L	L	S	L	G	M	V	I	L	Q	G	G	V	W	L	Q	L	K	T	V	G	V	I	H	L	R	S	Q	L	A	T	K	R	A	A	L	L	V	M	L	C	F	L
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	F	A	A	L	A	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	S	S	L	A	S	M	L	N	S	T	A	T	I	F	T	M	D	I	Y	K	E	Y	I	S	P	D	S	G	D	H	K	L	V	N	V	G	R	T	A	A	V	V	A	L	I	I	A	A
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				T					T		S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	G	Y	W	L	W	V	G	I	D	G	F	V	L	L	A	Q	D	A	N	G	P	S	N	P	L	M	K	L	V	A	V	L	P	G	A	W	M	N	N	F	V	E	S	P	V	L	W	I	F	P	L	L	G	F	F	C	P	L	L	T	V	M	A	I	Y	R	G	R	P	G	W	G	F	L	M	A	S	L
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	A	P	M	L	G	G	I	G	Q	C	F	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Q	E	Y	T	G	L	V	S	P	G	I	L	A	V	F	L	L	G	L	F	W	K	K	T	T	S	K	G	A	I	I	G	V
Template Known Secondary structure				G	G	G	G	G	G		B						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	Q	F	G	V	I	F	T	A	G	I	T	L	F	P	F	V	M	P	S	S	V	S	P	I	S	S	L	T	L	W	D	S	T	S	S	Q	L	T	L	S	I	M	L	V	I	V	L	I	F	L	P	I	V	L	L	Y	T	L	W	S	Y	Y	K	M	W	G	R	M	T	T	E	T	L	R	R	N	E	N
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	S	I	P	F	A	L	F	L	K	F	M	P	L	S	M	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	D	Q	M	L	Y	T	L	L	F	T	M	V	V	I	A	F	T	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	S	I	N	D	D	D	P	K	G	I	S	V	T
Template Known Secondary structure														S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.										480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions