Job Description P39407 Confidence 99.03% Date Thu Jan 5 12:00:43 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 188 % Identity 15% Template d1cjya2 SCOP info FabD/lysophospholipase-like FabD/lysophospholipase-like Lysophospholipase Resolution 2.50

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.		.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.		.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.		.	.	.	.	.	70	.
Predicted Secondary structure																					.																		.												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.																		.												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	P	F	Q	P	G	R	I	A	L	V	C	E	G	G	G	Q	R	G	.	I	F	T	A	G	V	L	D	E	F	M	R	A	Q	F	N	P	.	F	D	L	Y	L	G	T	S	A	G	A	.	Q	N	L	S	A	F	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.																		.												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.																		.												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	A	R	D	V	P	V	V	A	I	L	G	S	G	G	G	F	R	A	M	V	G	F	S	G	V	M	K	A	L	Y	E	S	G	I	L	D	C	A	T	Y	V	A	G	L	S	G	S	T	W	Y	M	S	T	L	Y	S	H	P	D	F	P	E	K	G	P	E	E	I	N	E	E	L	M	K	N	V	S	H	N
Template Known Secondary structure		S		S	S																													T	S		G	G	G																					T	T	T	T	T	S															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
					72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																																																											.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																																																											.	.	.
Query Sequence		.	.	.	C	N	Q	P	G	Y	A	R	K	V	I	M	R	Y	T	T	K	R	E	F	F	D	P	L	R	F	V	R	G	G	N	L	I	D	L	D	W	L	V	E	A	T	A	S	Q	M	P	L	Q	M	D	T	A	A	R	L	F	D	S	G	K	S	F	Y	M	C	A	C	R	Q	D	D	Y	A	.	.	.
Query Conservation		.	.	.																																																																											.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																																																.											.	.	.
Template Conservation																																																																				.
Template Sequence		P	L	L	L	L	T	P	Q	K	V	K	R	Y	V	E	S	L	W	K	K	K	S	S	G	Q	P	V	T	F	T	D	I	F	G	M	L	I	G	E	T	L	I	H	N	R	M	N	T	T	L	S	S	L	K	E	K	V	N	T	A	Q	C	P	L	P	L	.	F	T	C	L	H	V	K	P	D	V	S	E	L
Template Known Secondary structure		G	G	G	G																			T	T																			G	G	G	T	T		B	S	G	G	G	G	G	G	T	T	T	S		S					.								S	S				G
Template Predicted Secondary structure																																																																				.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
				146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	160	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	P	N	Y	F	L	P	T	K	Q	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	V	I	R	A	S	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	F	A	D	W	V	E	F	S	P	Y	E	I	G	M	A	K	Y	G	T	F	M	A	P	D	L	F	G	S	K	F	F	M	G	T	V	V	K	K	Y	E	E	N	P	L	H	F	L	M	G	V	W	G	S	A	F	S	I	L	F	N	R	V	L	S	T	M	E	E	E	L	E	N	I	T	T	K	H	I	V
Template Known Secondary structure		G	G	S							S	S					T	T	T	T					G	G	G	T	T	S				T	T										B									T	T					T																					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
																																					166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.			.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	G	F	Y	R	S	G	V	S	L	E	G	I	N	Y	L	D	G	G	I	S	D	A	I	P	V	K	E	A	A	R	.	.	Q	G	A	K	T	L	V	V	I	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.																											.	.
Template Conservation																																										.
Template Sequence		S	N	N	Q	A	S	W	I	H	R	M	I	M	A	L	V	S	D	S	A	L	F	N	T	R	E	G	R	A	G	K	V	H	N	F	M	L	G	L	N	.	L	D	V	K	S	K	K	I	H	V	V	D	S	G	L	T	F	N	L	P	Y	P	L	I	L	R	P	Q	R	G	V	D	L	I	I	S	F	D
Template Known Secondary structure		T			T	T															T	S	S		T	T	S		S	S						T	T	T	T			.				S		S							G	G	G	T		S	S								G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																										.
Template SS confidence
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470		.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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