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Summary |   |
Top model | ||||||||||||||
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Sequence analysis |   |
Secondary structure and disorder prediction |   |
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  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | M | S | H | Q | H | T | T | Q | T | S | G | Q | G | M | L | E | R | V | F | K | L | R | E | H | G | T | T | A | R | T | E | V | I | A | G | F | T | T | F | L | T | M | V | Y | I | V | F | V | N | P | Q | I | L | G | V | A | G | M | D | T | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | S | A | V | F | V | T | T | C | L | I | A | A | F | G | S | I | M | M | G | L | F | A | N | L | P | V | A | L | A | P | A | M | G | L | N | A | F | F | A | F | V | V | V | Q | A | M | G | L | P | W | Q | V | G | M | G | A | I | F | W | G | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | A | I | G | L | L | L | L | T | I | F | R | V | R | Y | W | M | I | A | N | I | P | V | S | L | R | V | G | I | T | S | G | I | G | L | F | I | G | M | M | G | L | K | N | A | G | V | I | V | A | N | P | E | T | L | V | S | I | G | N | L | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | T | S | H | S | V | L | L | G | I | L | G | F | F | I | I | A | I | L | A | S | R | N | I | H | A | A | V | L | V | S | I | V | V | T | T | L | L | G | W | M | L | G | D | V | H | Y | N | G | I | V | S | A | P | P | S | V | M | T | V | V | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | G | H | V | D | L | A | G | S | F | N | L | G | L | A | G | V | I | F | S | F | M | L | V | N | L | F | D | S | S | G | T | L | I | G | V | T | D | K | A | G | L | A | D | E | K | G | K | F | P | R | M | K | Q | A | L | Y | V | D | S | I | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | S | S | V | T | G | S | F | I | G | T | S | S | V | T | A | Y | I | E | S | S | S | G | V | S | V | G | G | R | T | G | L | T | A | V | V | V | G | L | L | F | L | L | V | I | F | L | S | P | L | A | G | M | V | P | G | Y | A | A | A | G | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | A | L | I | Y | V | G | V | L | M | T | S | S | L | A | R | V | N | W | Q | D | L | T | E | S | V | P | A | F | I | T | A | V | M | M | P | F | S | F | S | I | T | E | G | I | A | L | G | F | I | S | Y | C | V | M | K | I | G | T | G | R | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 430 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 440 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |   | L | R | D | L | S | P | C | V | I | I | V | A | L | L | F | I | L | K | I | V | F | I | D | A | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Confidence Key | |||||||||||
High(9) |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   | Low (0) |
? | Disordered |
![]() ![]() | Alpha helix |
![]() ![]() | Beta strand |
Domain analysis |   |
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Please note, only up to the top 20 hits are modelled to reduce computer load
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Detailed template information |   |
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Binding site prediction |   |
Due to computational demand, binding site predictions are not run for batch jobs
If you want to predict binding sites, please manually submit your model of choice to 3DLigandSite
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||||||||
  | ||||||||||||||
If you use the binding site predictions from 3DLigandSite, please also cite: | ||||||||||||||
3DLigandSite: predicting ligand-binding sites using similar structures. | ||||||||||||||
Wass MN, Kelley LA and Sternberg MJ Nucleic Acids Research 38, W469-73 (2010) [PubMed] | ||||||||||||||
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