Job Description B8YM76 Confidence 99.41% Date Thu Jan 5 10:55:43 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 339 % Identity 21% Template c3q3qA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: crystal structure of spap: an novel alkaline phosphatase from2 bacterium sphingomonas sp. strain bsar-1 Resolution 1.95 Å

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		35	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100		.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.
Query SS confidence																																																																				.
Query Sequence		R	D	S	L	S	D	K	P	A	K	N	I	I	L	L	I	G	D	G	M	G	D	S	E	I	T	A	A	R	N	Y	A	E	G	A	G	G	F	F	K	G	I	D	A	L	P	L	T	G	Q	Y	T	H	Y	A	L	N	K	K	T	G	K	P	D	Y	V	.	T	D	S	A	A	S	A	T	A	W	S	T	G
Query Conservation																																																																				.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	S	I	A	A	T	P	P	K	L	I	V	A	I	S	V	D	Q	F	S	A	D	L	F	S	E	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	Y	T	G	G	L	K	R	L	T	S	E	G	A	V	F	P	R	G	Y	Q	S	H	A	A	T	E	T	C	P	G	H	S	T	I	L	T	G
Template Known Secondary structure					T	T	S	S			S								T	T										G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G			S									S										S	S			S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60													.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																			114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	T	Y	N	G	A	L	G	V	D	I	H	E	K	D	H	P	T	I	L	E	M	A	K	A	A	G	L	A	T	G	N	V	S	T	A	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	R	P	S	R	T	G	I	I	A	N	N	W	F	D	L	D	A	K	R	E	D	K	N	L	Y	C	A	E	D	E	S	Q	P	G	S	S	S	D	K	Y	E	A	S	P	L	H	L	K	V	P	T	L	G	G	R	M	K	A	A	N	P	A	T	R	V	V	S	V	A	G	K	D	R	A	A	I	M	M	G
Template Known Secondary structure											S	S					T	T		S	S	S						T	T	B		T	T	S	T	T		B	T	T	B			B		S	T	T			S												T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
										153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	A	T	P	A	A	L	E	A	H	V	T	S	R	K	C	Y	G	P	S	A	T	S	E	K	C	P	G	N	A	L	E	K	G	G	K	G	S	I	T	E	Q	L	L	N	A	R	A	D	V	T	L	G	G	G	A	K	T	F	A	E	T	A	T	A	G	E	W	Q	G	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	T	A	D	Q	V	W	W	L	G	G	P	Q	G	Y	V	S	Y	K	G	V	A	P	T	P	L	V	T	Q	V	N	Q	A	F	A	Q	R	L	A	Q	P	N	P	G	F	E	L	P	A	Q	C	V	S	K	D	F	P	V	Q	A	G	N	R	T	V	G	T	G	R	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T		S							S	T	T					S	T	T																			T	S		B							G	G	G	G	G	G							T	T				S						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	R	E	Q	A	Q	A	R	G	Y	Q	L	V	S	D	A	A	S	L	N	S	V	T	E	A	N	Q	Q	K	P	L	L	G	L	F	A	D	G	N	M	P	V	R	W	L	G	P	K	A	T	Y	H	G	N	I	D	K	P	A	V	T	C	T	P	N	P	Q	R	N	D	S	V	P	T	L	A	Q	M	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	A	G	D	Y	K	G	F	R	I	S	P	E	Q	D	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	A	F	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T							S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		270	.	.	.	.
		305	.	.	.	.	310			.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.		.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.																							.	.																														.
Query SS confidence								.	.																							.	.																														.
Query Sequence		D	K	A	I	E	L	.	.	L	S	K	N	E	K	G	F	F	L	Q	V	E	G	A	S	I	D	K	Q	D	H	.	.	A	A	N	P	C	G	Q	I	G	E	T	V	D	L	D	E	A	V	Q	R	A	L	E	F	A	K	K	E	G	.	N	T	L	V	I	V	T	A	D	H	A	H	A	S	Q	I	V	A
Query Conservation								.	.																							.	.																														.
Alig confidence								.	.																							.	.																														.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	A	I	E	N	M	Q	L	G	K	Q	A	Q	T	D	I	I	S	I	G	L	S	A	T	D	Y	V	G	H	T	F	G	T	E	G	T	E	S	C	I	Q	V	D	R	L	D	T	E	L	G	A	F	F	D	K	L	D	K	D	G	I	D	Y	V	V	V	L	T	A	D	H	G	G	H	D	L	P	E	R
Template Known Secondary structure								T	T	T	T	S	S	S	S																				S	S	S																								T	T										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	R	M	N	A	M	P	M	E	Q	R	V	D	M	A	L	T	P	K	A	L	N	A	T	I	A	E	K	A	G	L	P	G	K	K	V	I	W	S	D	G	P	S	G	D	I	Y	Y	D	K	G	L	T	A	A	Q	R	A	R	V	E	T	E	A	L	K	Y	L	R	A	H	P	Q	V	Q	T	V	F	T	K
Template Known Secondary structure			T	T	T	T		T	T						G	G	G	S													T		T	T	S						S	S	S	S							T	T																				S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
																									380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.						.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.												.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.												.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	T	K	A	P	G	L	T	Q	A	L	N	T	K	D	G	A	V	M	V	M	S	Y	G	N	S	E	E	D	S	Q	E	H	T	G	.	.	.	.	.	S	Q	L	R	I	A	A	Y	G	P	H	.	.	A	A	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	I	A	A	T	P	S	P	S	G	P	P	E	S	W	S	L	I	Q	E	A	R	A	S	F	Y	P	S	R	S	G	D	L	L	L	L	L	K	P	R	V	M	S	I	P	E	Q	A	V	M	G	S	V	A	T	H	G	S	P	W	D	T	D	R	R	V	P	I	L	F	W	R	K	G	M	Q	H	F	E
Template Known Secondary structure						T	S					S		G	G	G										T			T	T	T	S		S							T	T			S	S				S	S		S								S	S													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	G	L	T	D	Q	T	D	L	F	Y	T	M	K	A	A	L	G	L	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	P	L	G	V	E	T	V	D	I	L	P	S	L	A	A	L	I	K	L	P
Template Known Secondary structure				S				G	G	G									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.