Job Description B8YM76 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 10:55:43 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 310 % Identity 20% Template c3m8yC_ PDB info PDB header:isomerase Chain: C: PDB Molecule:phosphopentomutase; PDBTitle: phosphopentomutase from bacillus cereus after glucose-1,6-bisphosphate2 activation Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.													.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	K	N	I	I	L	L	I	G	D	G	M	G	D	S	E	I	T	A	A	R	N	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	A	G	G	F	F	K	G	I	D	A	L	P	L	T	G	Q	Y	T	H	Y	A	L	N	K	K	T	G	K	P	D	Y	V	T	D	S	A	A	S	A	T	A
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		K	Y	K	R	I	F	L	V	V	M	D	S	V	G	I	G	E	A	P	D	A	E	Q	F	G	D	L	G	S	D	T	I	G	H	I	A	E	H	M	N	G	L	Q	M	P	N	M	V	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	G	N	I	R	E	M	K	.	.	.	G	I	S	K	V	E	K	P	L
Template Known Secondary structure				S								T	T				S	B		T	T	T	T	T	T	T		T	T												T	S										.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							B	T	.	.	.	T	B				S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.										.	.	.	.	.	.	.	60	.				.	.	.	.	.	.	.	.	70
		110	.	.	.														.	.	.	.	.	.	120						.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150																					.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	S	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	T	Y	N	G	A	.	.	.	.	.	L	G	V	D	I	H	E	K	D	H	P	T	I	L	E	M	A	K	A	A	G	L	A	T	G	N	V	S	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Y	Y	T	K	M	Q	E	K	S	T	G	K	D	M	T	G	H	W	E	I	M	G	L	Y	I	D	T	P	F	Q	V	F	P	E	G	F	P	K	E	L	L	D	E	L	E	E	K	T	G	R	K	I	I	G	N	K	P	A	S	G	T	E	I	L	D	E	L	G	Q	E	Q	M	E	T	G	S	L	I	V
Template Known Secondary structure		S									S	S											T	T					S						T	T															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		152	.	.	.	.	.	.	.		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Q	D	A	T	P	A	A	.	L	E	A	H	V	T	S	R	K	C	Y	G	P	S	A	T	S	E	K	C	P	G	N	A	L	E	K	G	G	K	G	S	I	T	E	Q	L	L	N	A	R	A	D	V	T	L	G	G	G	A	K	T	F	A	E	T	A	T	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	S	A	D	S	V	L	Q	I	A	A	H	E	E	V	V	P	L	D	E	L	Y	K	I	C	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	R	E	L	T	L	D	E	K	Y	M	V	G	R	V	I	A	R	P	F	V	G	E	P	G	N	F	T	R	T	P	N	R	H	D	Y	A	L
Template Known Secondary structure					S	S	S								T	T	T	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S	G	G	G			S											T	T						S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.															.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	W	Q	G	K	T	L	R	E	Q	A	Q	A	R	G	Y	Q	L	V	S	D	A	A	S	L	N	S	V	T	E	A	N	Q	Q	K	P	L	L	G	L	F	A	D	G	N	M	P	V	R	W	L	G	P	K	A	T	Y	H	G	N	I	D	K	P	A	V	T	C	T	P	N	P	Q	R	N	D	S	V	P	T
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	P	F	G	R	T	V	M	N	E	L	K	D	S	D	Y	D	V	I	A	I	G	K	I	S	D	I	Y	D	G	E	G	V	T	E	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	K	S
Template Known Secondary structure				S	S										T	T							T	T					T	T	T	T	T		S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.																																								.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.
Query SS confidence																																.
Query Sequence		L	A	Q	M	T	D	K	A	I	E	L	L	S	K	N	E	K	G	F	F	L	Q	V	E	G	A	S	I	D	K	.	Q	D	H	A	A	N	P	C	G	Q	I	G	E	T	V	D	L	D	E	A	V	Q	R	A	L	E	F	A	K	K	E	G	N	T	L	V	I	V	T	A	D	H	A	H	A	S	Q	I	V
Query Conservation																																.
Alig confidence															.																	.																														.	.																	.	.
Template Conservation															.																																															.	.																	.	.
Template Sequence		N	M	D	G	M	D	K	L	V	D	T	L	N	.	M	D	F	T	G	L	S	F	L	N	L	V	D	F	D	A	L	F	G	H	R	R	D	P	Q	G	Y	G	E	A	L	Q	E	Y	D	A	R	L	P	E	V	F	A	K	L	K	.	.	E	D	D	L	L	L	I	T	A	D	H	G	N	D	P	I	.	.
Template Known Secondary structure														T	.	S																T	T	T	T	T	T														T	T										.	.	T	T								S	S	B			T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure															.																																															.	.																	.	.
Template SS confidence
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.			.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.					.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.
Query Sequence		A	P	D	T	K	A	P	G	L	T	Q	A	L	N	T	K	D	G	A	V	M	V	M	S	Y	G	N	S	E	E	D	S	Q	E	H	T	G	S	Q	L	R	I	A	A	Y	G	P	H	A	.	.	.	.	A	N	V	V	G	L	T	D	Q	T	D	L	F	Y	T	M	K	A	A	L	G	L	K
Query Conservation																																																			.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	G	T	D	H	T	R	E	Y	V	P	L	L	A	Y	S	P	S	M	K	E	G	G	Q	E	L	P	L	R	Q	T	F	A	D	I	G	A	T	V	A	E	N	F	G	V	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S	S		B		B									T	T		T	T				B				B	S	S	T												T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																															334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380