Job Description P30845 Confidence 99.90% Date Thu Jan 5 11:46:29 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 267 % Identity 22% Template c3q3qA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: crystal structure of spap: an novel alkaline phosphatase from2 bacterium sphingomonas sp. strain bsar-1 Resolution 1.95 Å

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		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.			.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280			.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure																																								.	.															.	.																						.	.	.
Query SS confidence																																								.	.															.	.																						.	.	.
Query Sequence		M	Q	N	E	K	R	K	N	L	T	I	L	I	V	G	E	T	S	R	A	E	N	F	S	L	N	G	Y	P	R	E	T	N	P	R	L	A	K	.	.	D	N	V	V	Y	F	P	N	T	A	S	C	G	T	.	.	A	T	A	V	S	V	P	C	M	F	S	D	M	P	R	E	H	Y	K	E	E	.	.	.
Query Conservation																																								.	.															.	.																						.	.	.
Alig confidence																																.	.							.	.															.	.																						.	.	.
Template Conservation																																.	.
Template Sequence		S	I	A	A	T	P	P	K	L	I	V	A	I	S	V	D	Q	F	S	A	D	L	F	S	E	Y	R	Q	Y	Y	.	.	T	G	G	L	K	R	L	T	S	E	G	A	V	F	P	R	G	Y	Q	S	H	A	A	T	E	T	C	P	G	H	S	T	I	L	T	G	S	R	P	S	R	T	G	I	I	A	N	N
Template Known Secondary structure			T	T	S	S			S								T	T										G	G	G		.	.		S									S										S	S			S									T	T	S										S	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.			.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
																																			302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	Q	H	Q	E	G	V	L	D	I	I	Q	R	A	G	I	N	V	L	W	N	D	N	D	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	F	D	L	D	A	K	R	E	D	K	N	L	Y	C	A	E	D	E	S	Q	P	G	S	S	S	D	K	Y	E	A	S	P	L	H	L	K	V	P	T	L	G	G	R	M	K	A	A	N	P	A	T	R	V	V	S	V	A	G	K	D	R	A	A	I	M	M	G	G	A	T	A	D	Q	V	W	W	L	G	G
Template Known Secondary structure					T	T		S	S	S						T	T	B		T	T	S	T	T		B	T	T	B			B		S	T	T			S												T	T								S	S										T	T		S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
																																																	329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	K	G	A	C	D	R	V	P	H	Q	N	V	T	A	L	N	L	P	D	Q	C	I	N	G	E	C	Y	D	E	V	L	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	Q	G	Y	V	S	Y	K	G	V	A	P	T	P	L	V	T	Q	V	N	Q	A	F	A	Q	R	L	A	Q	P	N	P	G	F	E	L	P	A	Q	C	V	S	K	D	F	P	V	Q	A	G	N	R	T	V	G	T	G	R	F	A	R	D	A	G	D	Y	K	G	F	R	I	S	P	E	Q	D	A	M	T	L
Template Known Secondary structure		T	T					S	T	T																			T	S		B							G	G	G	G	G	G							T	T				S						B		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		362	.	.	.	.	.	.	.						370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.					.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.																.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.																.	.	.	.
Query Sequence		H	G	L	E	E	Y	I	N	.	.	.	.	.	N	L	Q	G	D	G	V	I	V	L	H	T	I	G	S	.	.	.	.	H	G	P	T	Y	Y	N	R	Y	P	P	Q	F	R	K	F	T	P	T	C	D	T	N	E	I	Q	T	C	T	K	E	Q	L	V	N	T	Y	D	N	T	L	V	Y	V	D	Y	I	V
Query Conservation										.	.	.	.	.																.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	A	A	A	A	I	E	N	M	Q	L	G	K	Q	A	Q	T	D	I	I	S	I	G	L	S	A	T	D	Y	V	G	H	T	F	G	T	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	S	C	I	Q	V	D	R	L	D	T	E	L
Template Known Secondary structure											T	T	T	T	S	S	S	S																				S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	A	I	N	L	L	K	E	H	Q	D	K	F	T	T	S	L	V	Y	L	S	D	H	G	E	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		G	A	F	F	D	K	L	D	K	D	G	.	.	I	D	Y	V	V	V	L	T	A	D	H	G	G	H	D	L	P	E	R	H	R	M	N	A	M	P	M	E	Q	R	V	D	M	A	L	T	P	K	A	L	N	A	T	I	A	E	K	A	G	L	P	G	K	K	V	I	W	S	D	G	P	S	G	D	I	Y	Y
Template Known Secondary structure											T	T	.	.										S											T	T	T	T		T	T						G	G	G	S													T		T	T	S						S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.			.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
																																																																															461	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	K	G	L	T	A	A	Q	R	A	R	V	E	T	E	A	L	K	Y	L	R	A	H	P	Q	V	Q	T	V	F	T	K	A	E	I	A	A	T	P	S	P	S	G	P	P	E	S	W	S	L	I	Q	E	A	R	A	S	F	Y	P	S	R	S	G	D	L	L	L	L	L	K	P	R	V	M	S	I	P	E	Q
Template Known Secondary structure			T	T																				S	T	T												T	S					S		G	G	G										T			T	T	T	S		S							T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530		.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.
Query SS confidence																																																																					.
Query Sequence		G	I	Y	L	H	G	L	P	Y	A	I	A	P	D	S	Q	K	Q	V	P	M	L	L	W	L	S	E	D	Y	Q	K	R	Y	Q	V	D	Q	N	C	L	Q	K	Q	A	Q	T	Q	H	Y	S	Q	D	N	L	F	S	T	L	L	G	L	T	G	V	E	T	K	.	Y	Y	Q	A	A	D	D	I
Query Conservation																																																																					.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	M	G	S	V	A	T	H	G	S	P	W	D	T	D	R	R	V	P	I	L	F	W	R	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Q	H	F	E	Q	P	L	G	V	E	T	V	D	I	L	P	S	L	A	A	L	I	K	L	P	V	P	K	D	Q	I	D	G	R	C	L
Template Known Secondary structure		S	S		S								S	S													T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S				G	G	G									T	T					G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.													510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.