Job Description P30845 Confidence 99.79% Date Thu Jan 5 11:46:29 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 250 % Identity 14% Template c2xr9A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family PDBTitle: crystal structure of autotaxin (enpp2) Resolution 2.05 Å

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		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.			.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.															.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.															.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	P	L	M	Q	N	E	K	R	K	N	L	T	I	L	I	V	G	E	T	S	R	A	E	N	F	S	L	N	G	Y	P	R	E	T	N	P	R	L	A	K	.	.	D	N	V	V	Y	F	P	N	T	A	S	C	G	T	.	A	T	A	V	S	V	P	C	M	F	S	D	M	P	R	E	.	.	.	.	.
Query Conservation																																												.	.															.																	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.											.	.															.																	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.
Template Sequence		K	V	P	E	C	P	A	G	F	V	R	P	P	L	I	I	F	S	V	D	G	F	R	A	S	Y	M	K	K	.	.	.	G	S	K	V	M	P	N	I	E	K	L	R	S	C	G	T	H	A	P	Y	M	R	P	V	Y	P	T	K	T	F	P	N	L	Y	T	L	A	T	G	L	Y	P	E	S	H	G	I	V
Template Known Secondary structure			S					T	T		S	S										T			G	G	G	G	G	G	.	.	.		T	T	T											S				S						S	S		S											S							S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180				.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
																				297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Y	K	E	E	L	A	Q	H	Q	E	G	V	L	D	I	I	Q	R	A	G	I	N	V	L	W	N	D	N	D	G	G	C	K	G	A	C	D	R	V	P	H	Q	N	V	T	A	L	N	L	P	D	Q	C	I	N	G	E	C	Y	D	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	S	M	Y	D	P	V	F	D	A	S	F	H	L	R	G	R	E	K	F	N	H	R	W	W	G	G	Q	P	L	W	I	T	A	T	K	Q	G	V	R	A	G	T	F	F	W	S	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	H	E
Template Known Secondary structure			S	S				T	T	T	T					S	S	S	S	G	G	G	S	G	G	G			S										T	T			B							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	280	.	.
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.			370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.							.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure													.	.																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	F	H	G	L	E	E	Y	I	N	.	.	N	L	Q	G	D	G	V	I	V	L	H	T	I	G	S	.	.	.	.	.	.	H	G	P	T	Y	Y	N	R	Y	P	P	Q	F	R	K	F	T	P	T	C	D	T	N	E	I	Q	T	C	T	K	E	Q	L	V	N	T	Y	D	N	T	L	V	Y	V	D	Y
Query Conservation													.	.																.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	R	I	L	T	I	L	Q	W	L	S	L	P	D	N	E	R	P	S	V	Y	A	F	Y	S	E	Q	P	D	F	S	G	H	K	Y	G	P	F	G	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	T	N	P	L	R	E	I	D	K
Template Known Secondary structure												T	S		T	T	T			S																		T	T		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	V	D	K	A	I	N	L	L	K	E	H	Q	D	K	F	T	T	S	L	V	Y	L	S	D	H	G	E	S	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	G	Q	L	M	D	G	L	K	Q	L	R	L	H	R	C	V	N	V	I	F	V	G	D	H	G	M	E	D	V	T	C	D	R	T	E	F	L	S	N	Y	L	T	N	V	D	D	I	T	L	V	P	G	T	L	G	R	I	R	A	K	S	I	Y	D	P	K	T	I	I	A	A	L	T	C	K	K	P	D
Template Known Secondary structure													T	T		T	T	T								S								T	T	S				G	G	G	T		S		G	G	G						B	S							S												T	S	S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		334	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
																																							462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	N	G	I	Y	L	H	G	L	P	Y	A	I	A	P	D	S	Q	K	Q	V	P	M	L	L	W	L	S	E	D	Y	Q	K	R	Y	Q	V	D	Q	N	C	L	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	H	F	K	P	Y	M	K	Q	H	L	P	K	R	L	H	Y	A	N	N	R	R	I	E	D	I	H	L	L	V	D	R	R	W	H	V	A	R	K	P	C	F	F	Q	G	D	H	G	F	D	N	K	V	N	S	M	Q	T	V	F	V	G	Y	G	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	K
Template Known Secondary structure									G	G	G	S		G	G	G				S	S	T	T	S		S							T	T					S											S		T	T	S	G	G	G		B						S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.													.	.
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Q	A	Q	T	Q	H	Y	S	Q	D	N	L	F	S	T	L	L	G	L	T	G	V	E	T	K	Y	Y	Q	A	A	D	D	I	L	Q	T	C	R	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	R	T	K	V	P	P	F	E	N	I	E	L	Y	N	V	M	C	D	L	L	G	L	K	P	A	P	N	N	G	T	H	G	S	L	N	H	L	L	R
Template Known Secondary structure		S	S								G	G	G										T					S		S	S		T	T	T	T	G	G	G	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		496	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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