Job Description P76464 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:08 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 1169 % Identity 13% Template c2pn5A_ PDB info PDB header:immune system Chain: A: PDB Molecule:thioester-containing protein i; PDBTitle: crystal structure of tep1r Resolution 2.70 Å

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		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.				.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.			310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.																.	.
Query SS confidence																																	.	.	.																.	.
Query Sequence		V	S	G	K	E	L	L	V	W	T	A	G	K	K	Q	G	E	A	K	P	G	S	E	I	L	W	T	D	G	L	G	.	.	.	V	M	T	R	G	V	T	D	D	S	G	T	L	Q	L	.	.	Q	H	I	S	P	E	R	S	Y	I	L	G	K	D	A	E	G	G	V	F	V	S	E	N	F	F	Y	E	S
Query Conservation																																	.	.	.																.	.
Alig confidence																																	.	.	.																.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	A	N	Q	E	Y	T	L	V	I	S	N	F	N	S	Q	L	S	K	V	D	L	L	L	K	L	E	L	S	V	L	N	V	T	K	M	V	D	V	R	R	N	M	N	R	M	I	N	F	N	M	P	E	D	L	T	A	G	N	Y	K	I	T	I	D	G	Q	R	G	F	S	F	H	K	E	A	E	L	V	Y
Template Known Secondary structure			S	S	S											S	S	S	S											T	T											T	T											S				S											S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	I	Y	N	T	R	L	Y	I	F	T	D	R	P	L	Y	R	A	G	D	R	V	D	V	K	V	I	G	R	E	F	H	D	P	L	H	S	S	P	I	V	S	A	P	A	K	L	S	V	L	D	A	N	G	S	L	L	Q	T	V	N	V	T	L	D	A	R	N	G	G	Q	G	S	F	R	L	P	E	N	A
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.
Template Sequence		L	S	K	S	I	S	G	L	I	Q	V	D	K	P	V	F	K	P	G	D	T	V	N	F	R	V	I	V	L	D	T	E	L	K	P	P	.	.	.	A	R	V	K	S	V	Y	V	T	I	R	D	P	Q	R	N	V	I	R	K	W	S	T	A	K	L	Y	A	G	V	F	E	S	D	L	Q	I	A	P	T	P
Template Known Secondary structure			S		S								S		S				T	T												T	T	S	S			.	.	.	S	S											T	T													B	T	T										S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.
Template SS confidence
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.				.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.
		419	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.
Query SS confidence													.
Query Sequence		V	A	G	G	Y	E	L	R	L	A	Y	.	R	N	Q	V	Y	S	S	S	F	R	V	A	N	Y	I	K	P	H	F	E	I	G	L	A	L	A	K	K	E	F	K	T	G	E	A	V	S	G	K	L	Q	L	L	Y	P	D	G	E	P	V	K	N	A	R	V	Q	L	S	L	R	A	Q	Q	L	S	M	V	G
Query Conservation													.
Alig confidence													.																																																					.											.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.											.	.	.	.	.
Template Sequence		M	L	G	V	W	N	I	S	V	E	V	E	G	E	E	L	V	S	K	T	F	E	V	K	E	Y	V	L	S	T	F	D	V	Q	V	M	P	S	V	I	P	L	E	E	H	Q	A	V	N	L	T	I	E	A	N	Y	H	F	G	K	P	V	Q	G	.	V	A	K	V	E	L	Y	L	D	D	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	T													S												S	S			B	G	G	G												S	S	S		B				.									T	T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		173	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.		.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.				530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.		.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.																		.
Query SS confidence																																		.	.	.																		.
Query Sequence		N	D	L	R	Y	A	G	R	F	P	V	S	L	E	G	S	E	T	V	S	D	A	S	G	H	V	A	L	N	L	P	A	.	.	.	A	D	K	P	S	R	Y	L	L	T	V	S	A	S	D	G	A	.	A	Y	R	V	T	T	T	K	E	I	L	I	E	R	G	L	A	H	Y	S	L	S	T	A	A	Q	Y
Query Conservation																																		.	.	.																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.																		.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	L	K	L	K	K	E	L	T	V	Y	G	K	G	Q	V	E	L	R	F	D	N	F	A	M	D	A	D	Q	Q	D	V	P	V	K	V	S	F	V	E	Q	Y	T	N	R	T	V	V	K	Q	S	Q	I	T	V	Y	R	Y	A	Y	R	V	E	L	I	K	E	S	P	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T											S									S	S				S	S	S													T	T	T														S	S	S								S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		574	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.					.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.		.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.																						.
Query SS confidence																																		.	.	.	.																						.
Query Sequence		S	N	S	G	E	S	V	V	F	R	Y	A	A	L	E	S	S	K	Q	V	P	V	T	Y	E	W	L	R	L	E	D	R	.	.	.	.	T	S	H	S	G	E	L	P	S	G	G	K	S	F	T	V	N	F	A	K	P	.	G	N	Y	N	L	T	L	R	D	K	D	G	L	I	L	A	G	L	S	H	A	V
Query Conservation																																		.	.	.	.																						.
Alig confidence																.																		.	.	.	.																						.																				.	.	.
Template Conservation																.																																																															.	.	.
Template Sequence		F	R	P	G	L	P	F	K	C	A	L	Q	F	T	.	H	H	D	G	T	P	A	K	G	I	S	G	K	V	E	V	S	D	V	R	F	E	T	T	T	T	S	D	N	D	G	L	I	K	L	E	L	Q	P	S	E	G	T	E	Q	L	S	I	H	F	N	A	V	D	G	F	F	F	Y	E	D	V	.	.	.
Template Known Secondary structure		B		T	T	S										.		T	T	S		B		T	T								G	G	G	T									T	T	S										T	T											T	T	S								.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																																																															.	.	.
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.		.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.		.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		S	G	K	G	S	T	A	H	T	G	T	V	D	I	V	A	D	K	T	L	Y	Q	P	G	E	T	A	K	M	L	I	T	F	P	E	P	.	I	D	E	A	L	L	T	L	E	R	D	R	V	E	Q	Q	S	L	L	S	H	P	A	N	W	L	T	L	Q	R	L	N	D	T	Q	Y	E	A	R	V	P	V	S
Query Conservation																																						.
Alig confidence		.	.																																			.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	N	K	V	E	T	V	T	D	A	Y	I	K	L	E	L	K	S	P	I	K	R	N	K	L	M	R	F	M	V	T	C	T	E	R	M	T	F	F	V	Y	Y	V	M	S	K	G	N	I	I	D	A	G	F	M	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	N	K	Q	P	K	Y	L	L	Q	L	N	A	T
Template Known Secondary structure		.	.		B			T	T	T	T									S				T	T	S													S								S	S	S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.										.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
		728	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	S	F	A	P	N	I	T	F	S	V	L	Y	T	R	N	G	Q	Y	S	F	Q	N	A	G	I	K	V	A	V	P	Q	L	D	I	R	V	K	T	D	K	T	H	Y	Q	P	G	E	L	V	N	V	E	L	T	S	S	L	K	G	K	P	V	S	A	Q	L	T	V	G	V	V	D	E	M	I	Y	A	L	Q
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	M	I	P	R	A	K	I	L	I	A	T	V	A	G	R	T	V	V	Y	D	F	A	D	L	A	F	Q	E	L	R	N	N	F	D	L	S	I	D	E	Q	E	I	K	P	G	R	Q	I	E	L	S	M	S	G	R	P	G	.	.	.	.	.	A	Y	V	G	L	A	A	Y	D	K	A	L	L	L	F	N
Template Known Secondary structure		G	G	G		S											T	T												G	G	G	S									S	S				T	T	S								S		T	T	.	.	.	.	.																T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.						.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
		808	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	I	A	P	N	I	G	K	F	F	Y	P	L	G	R	N	N	V	R	T	S	S	S	L	S	F	I	S	Y	D	Q	A	L	S	S	E	P	V	A	P	G	A	T	N	R	S	E	R	R	V	K	M	L	E	R	P	R	R	E	E	V	D	T	A	A	W	M	P	S	L	T	T	D	K	Q	G	K	A	Y
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Sequence		K	N	H	D	L	F	W	E	D	I	G	Q	V	F	D	G	F	H	E	N	E	F	D	I	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	S	L	G	L	F	A	R	T	L	D	D	I	L	F	D	S	Q	E	S	W	L	W	K	N	.	V	S	I	G	R	S	G	S	R	K
Template Known Secondary structure			S	S												S						S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T							T	T									B					.				T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template SS confidence
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.		.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
		888	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.			.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.
Query SS confidence																												.	.
Query Sequence		F	T	F	L	M	P	D	S	L	T	R	W	R	I	T	A	R	G	M	N	G	D	G	L	V	G	.	.	Q	G	R	A	Y	L	R	S	E	K	N	L	Y	M	K	W	S	M	P	T	V	Y	R	V	G	D	K	P	A	A	G	L	F	I	F	S	Q	Q	D	N	E	P	V	A	L	V	T	K	F	A	G	A
Query Conservation																												.	.
Alig confidence																												.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	E	V	V	P	D	T	T	T	S	W	Y	L	T	G	F	S	I	D	P	V	Y	G	L	G	I	I	K	K	P	I	Q	F	T	T	V	Q	P	F	Y	I	V	E	N	L	P	Y	S	I	K	R	G	E	A	V	V	L	Q	F	T	L	F	N	N	L	G	A	E	Y	I	A	D	V	T	L	Y	N	V	A
Template Known Secondary structure								S	S													T	T	T						S	S									S									S				T	T													S	S	S											G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		627	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.
		966	.														.	.	970	.	.	.	.	.	.		.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.				.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																							.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																							.	.	.
Query Sequence		E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	T	L	T	L	H	K	G	.	A	N	Y	I	S	L	T	Q	N	I	Q	Q	S	G	L	L	S	A	E	L	Q	Q	.	.	.	N	G	Q	V	Q	D	S	I	S	T	K	L	S	F	V	D	N	S	W	P	V	E	Q	Q	K	N	V	M	L	G
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																							.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	Q	T	E	F	V	G	R	P	N	T	D	L	S	Y	T	K	S	V	S	V	P	P	K	V	G	V	P	I	S	F	L	I	K	A	R	K	L	G	E	M	A	V	R	V	K	A	S	I	M	L	G	H	E	T	D	A	L	E	K	V	I	R	V	M	P	E	S	L	V	Q	P	R	M	D	T	R	F	F	C
Template Known Secondary structure		G					T	T	S		T	T												T	T													S	S											S	S	T	T	S	S													S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		707	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.
		1029	1030												.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Query Sequence		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	A	L	M	L	P	E	Q	A	S	N	I	R	L	Q	S	S	E	T	P	Q	E	I	F	R	N	N	L	D	A	L	V	D	E	P	W	G	G	V	I	N	T	G	S	R	L	I	P	L	S	L	A	W	R	S	L	A	D	H	Q	S	A	A	A	N	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	D	H	K	N	Q	T	F	P	I	N	L	D	I	N	K	K	A	D	S	G	S	T	K	I	E	F	R	L	N	P	N	L	L	T	T	V	I	K	N	L	D	H	L	L	G	V	P	T	G	C	G	E	Q	N	M	V	K	F	V	P	N	I	L	V	L	D	Y	L	H	A	I	G	S	K	E	Q	H	L
Template Known Secondary structure																			S	S			S										S	S	T	T						T	T	T				S	S				S	T	T	G	G	G	G	G	T													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		787	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.
				1097	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	D	I	R	Q	M	I	Q	D	N	R	L	R	L	M	Q	L	A	G	P	G	A	R	F	T	W	W	G	E	D	G	N	G	D	A	F	L	T	A	W	A	W	Y	A	D	W	Q	A	S	Q	A	I	G	V	T	Q	Q	P	E	Y	W	Q	H	M	L	D	S	Y	A	E	Q	A	D	N	M	P	L	L	H
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.																														.																	.
Template Conservation																																	.																	.
Template Sequence		I	D	K	A	T	N	L	L	R	Q	G	Y	Q	N	Q	M	R	Y	R	Q	T	D	G	S	F	G	L	W	E	T	T	.	N	G	S	V	F	L	T	A	F	V	G	T	S	M	Q	T	.	A	V	K	Y	I	S	D	I	D	A	A	M	V	E	K	A	L	D	W	L	A	S	K	Q	H	F	S	G	R	F	D
Template Known Secondary structure																	G	G	G	B		T	T	S		B		S	S	S	S	S	.																	.		T	T	T		S		S															T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																	.																	.
Template SS confidence
		867	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.		.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.		.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.
																						1175	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	A	L	V	L	A	W	A	Q	E	M	N	L	P	C	K	T	L	L	K	G	L	D	E	A	I	A	R	R	G	T	K	T	E	D	F	S	E	E	D	T	R	D	I	N	D	S	L	I	L	D	T	P	E	S	P	L	A	D	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	A	G	A	E	Y	H	K	E	M	Q	G	G	L	R	N	G	V	A	L	T	S	Y	V	L	M	A	L	L	E	N	D	I	A	K	A	K	H	A	E	V	I	Q	K	G	M	T	Y	L	S	N	Q	F	G	S	I	N	N	A	Y	D	L	S	I	A	T	Y	A	M	M	L	N	G	H	T	M	K	E	E	A
Template Known Secondary structure				S			S								S	S	T	T													T								T															G	G	G																		T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		945	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.
		1235	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.								.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	N	V	L	T	M	T	L	L	K	K	A	Q	L	K	S	T	V	M	P	Q	V	Q	Q	Y	A	W	D	K	A	A	N	S	N	Q	P	L	A	H	T	V	V	L	L	N	S	G	G	D	A	T	Q	T	A	A	I	L	S	G	L	.	.	.	.	.	.	.	T	A	E	Q	S	T	I	E	R	A	L	A
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	N	K	L	I	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	I	D	A	D	K	N	E	R	F	W	N	T	T	N	P	I	E	T	T	A	Y	A	L	L	S	F	V	M	A	E	K	Y	T	D	G	I	P	V	M	N	W	L	V	N	Q	R	Y	V	T	G	S	F	P	S	T	Q	D	T	F	V	G
Template Known Secondary structure								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T	T						S	S	S															T	T														T	T			T	T	S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1025	.	.	.	.	1030	.											.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.
		1308	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	N	W	L	A	K	Y	M	A	T	M	P	P	V	V	L	P	A	P	A	G	A	W	A	K	H	K	L	T	G	G	G	E	D	W	R	W	V	G	Q	G	V	P	D	I	L	S	F	G	D	E	L	S	P	Q	N	V	Q	V	R	W	R	E	P	A	K	M	A	Q	Q	S	N	I	P	V	T	V	E	R	Q
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	A	L	T	K	M	A	E	K	I	S	P	S	R	N	D	Y	T	V	Q	L	K	Y	K	K	S	A	.	.	.	.	K	Y	F	K	I	N	S	E	Q	I	D	V	E	N	F	V	D	I	P	E	D	T	K	K	L	E	I	N	V	G	G	I	G	F	G	L	L	E	V	V	Y	Q	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													S		S											T	T			.	.	.	.								S	S			S									S		S																				.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1095	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.					.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.
		1388	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.				.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.
Query Sequence		L	Y	R	L	I	P	G	E	E	E	M	S	F	I	L	Q	P	V	T	S	N	E	I	D	S	D	A	L	Y	L	D	E	I	T	L	T	S	.	.	.	E	Q	D	A	V	L	R	Y	G	Q	V	E	V	P	L	P	P	G	A	D	V	E	R	T	T	W	G	I	S	V	N	K	P	N	A	A	K	Q	Q	G
Query Conservation																																							.	.	.
Alig confidence		.																				.																	.	.	.																																.	.	.	.	.
Template Conservation		.																				.																																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		.	F	N	L	N	L	V	N	F	E	N	R	F	Q	L	D	L	E	K	Q	.	N	T	G	S	D	Y	E	L	R	L	K	V	C	A	S	Y	I	P	Q	L	T	D	R	R	S	N	M	A	L	I	E	V	T	L	P	S	G	Y	V	V	D	R	N	P	I	S	E	Q	T	K	.	.	.	.	.	V	N	P	I
Template Known Secondary structure		.											S									.			S	S	T	T													B	T	T	B		S		S	S									T	T										S			S	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure		.																				.																																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
			1165	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.		.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.						.	.	.	.
		1465	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.		.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.
Predicted Secondary structure																																													.
Query SS confidence																																													.
Query Sequence		Q	L	L	E	K	A	R	N	E	M	G	E	L	A	Y	M	V	P	V	K	E	L	T	G	T	V	T	F	R	H	L	L	R	F	S	Q	K	G	Q	F	V	L	P	.	P	A	R	Y	V	R	S	Y	A	P	A	Q	Q	S
Query Conservation																																													.
Alig confidence																							.	.																					.
Template Conservation																							.	.
Template Sequence		Q	K	T	E	I	R	Y	G	G	T	S	V	V	L	Y	Y	D	N	M	G	S	.	.	E	R	N	C	F	T	L	T	A	Y	R	R	F	K	V	A	L	K	R	P	A	Y	V	V	V	Y	D	Y	Y	N	T	N	L	N	A
Template Known Secondary structure								T	T	T	T							S				S	.	.	S												S				S											T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.
Template SS confidence
		1238	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.			.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.