Job Description P76464 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:08 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 1125 % Identity 14% Template c2b39B_ PDB info PDB header:immune system Chain: B: PDB Molecule:c3; PDBTitle: structure of mammalian c3 with an intact thioester at 3a resolution Resolution 3.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		E	I	Y	N	T	R	L	Y	I	F	T	D	R	P	L	Y	R	A	G	D	R	V	D	V	K	V	I	G	R	E	F	H	D	P	L	H	S	S	P	I	V	S	A	P	A	K	L	S	V	L	D	A	N	G	S	L	L	Q	T	V	N	.	V	T	L	D	A	R	N	G	G	Q	G	S	F	R	L	P	E	N
Query Conservation																																																															.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		S	L	Q	S	G	Y	L	F	I	Q	T	D	K	T	I	Y	T	P	G	S	T	V	L	Y	R	V	F	T	V	D	H	K	L	L	.	.	.	.	.	P	V	G	Q	T	V	F	I	T	I	E	T	P	D	G	I	P	V	K	R	D	S	K	S	S	Q	N	Q	F	G	I	L	T	L	S	W	N	I	P	E	L
Template Known Secondary structure													S		S				T	T												T	T	T		.	.	.	.	.													T	T											T	T	T	T	T	S										S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.						.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.				.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.			.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.		.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure																.	.	.																																.	.																				.
Query SS confidence																.	.	.																																.	.																				.
Query Sequence		A	V	A	G	G	Y	E	L	R	L	A	Y	R	N	.	.	.	Q	V	Y	S	S	S	F	R	V	A	N	Y	I	K	P	H	F	E	I	G	L	A	L	A	K	K	E	F	K	T	G	.	.	E	A	V	S	G	K	L	Q	L	L	Y	P	D	G	E	P	V	K	N	.	A	R	V	Q	L	S	L	R	A	Q
Query Conservation																.	.	.																																.	.																				.
Alig confidence																.	.	.																																.	.																				.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	M	G	V	W	K	I	K	A	Y	Y	E	D	S	P	Q	Q	V	F	S	A	E	F	E	V	K	E	Y	V	L	P	S	F	E	V	Q	L	E	P	E	E	K	F	Y	Y	I	D	D	P	D	G	L	K	V	N	I	I	A	R	F	L	Y	G	E	Q	V	D	G	T	A	F	V	I	F	G	V	Q	D	G
Template Known Secondary structure														T	T			S	S		B													S								S	S	S	S			S			S	S											T	T	S		B														S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.												.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.			.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query Sequence		Q	L	S	M	V	G	N	D	L	R	Y	A	G	R	F	P	V	S	L	E	G	S	E	T	V	S	D	A	S	G	H	V	A	L	N	L	P	A	A	D	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	Y	L	L	T	V	S	A	S	D	.	.	G	A	A	Y	R	V	T	T	T	K	E	I	L	I
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	R	I	S	L	T	H	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	R	V	P	I	N	D	G	N	G	E	A	I	L	K	R	Q	V	L	L	N	G	V	Q	P	S	R	A	D	A	L	V	G	K	S	I	Y	V	S	A	T	V	I	L	Q	S	G	S	D	M	V	E	A	E	R	T	G	I	P	I
Template Known Secondary structure		S						G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S								G	G	G	T	S	S	T	T		S		S	S	S	T	T	T	T												T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.											.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
		559	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.		.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.
Query SS confidence																																																																				.
Query Sequence		E	R	G	L	A	H	Y	S	L	S	T	A	A	Q	Y	S	N	S	G	E	S	V	V	F	R	Y	A	A	L	E	S	S	K	Q	V	P	V	T	Y	E	W	L	R	L	E	D	R	T	S	H	S	G	E	L	P	S	G	G	K	S	F	T	V	N	F	A	.	K	P	G	N	Y	N	L	T	L	R	D	K	D
Query Conservation																																																																				.
Alig confidence																															.																																					.
Template Conservation																															.
Template Sequence		V	T	S	P	Y	Q	I	H	F	T	K	T	P	K	F	F	K	P	A	M	P	F	D	L	M	V	Y	V	T	.	N	P	D	G	S	P	A	R	H	I	P	V	V	T	Q	G	S	N	V	Q	S	L	T	Q	D	D	G	V	A	K	L	S	I	N	T	Q	N	K	R	D	P	L	T	I	T	V	R	T	K	K
Template Known Secondary structure			S	S	S						S	S	S		S				T	T	S										.	B	T	T	T	B			S	S	B					T	T			B			B		S	S	S	S	B									S			S		B
Template Predicted Secondary structure																															.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.		.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
							638	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.								.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	G	L	I	L	A	G	L	S	H	A	V	S	G	K	G	S	T	A	H	T	G	T	V	D	I	V	A	D	K	T	L	Y	Q	P	G	E	T	A	K	M	L	I	T	F	P	E	P	I	D	.	.	.	.	.	.	.	E	A	L	L	T	L	E	R	D	R	V	E	Q	Q	S	L	L	S	H
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	N	I	P	E	G	R	Q	A	T	R	T	M	Q	A	L	P	Y	N	T	Q	G	N	S	N	N	Y	L	H	L	S	V	P	R	V	E	L	K	P	G	E	T	L	N	V	N	F	H	L	R	T	D	P	G	E	Q	A	K	I	R	Y	Y	T	Y	M	I	M	N	K	G	K	L	L	K	V	G	R	Q	Y	R
Template Known Secondary structure		T	T	S		T	T	S								B						S	S	S																S	S	S												S	S	G	G	G	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
		706	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.						.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.					.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query Sequence		P	A	N	W	L	T	L	Q	R	L	N	D	T	Q	Y	E	A	R	V	P	V	S	N	S	F	A	P	N	I	T	F	S	V	L	Y	T	R	N	G	.	.	.	.	.	Q	Y	S	F	Q	N	A	G	I	K	V	A	V	P	.	.	.	.	Q	L	D	I	R	V	K	T	D	K	T	H	Y	Q	P	G	E	L
Query Conservation																																									.	.	.	.	.															.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	Q	D	L	V	V	L	P	L	T	I	T	S	D	F	I	P	S	F	R	L	V	A	Y	Y	T	L	I	N	A	K	G	Q	R	E	V	V	A	D	S	V	W	V	D	V	K	D	S	C	M	G	T	L	V	V	K	N	G	G	K	E	E	K	H	H	R	P	G	Q	Q
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S										S	T	T	S	S											B		T	T	S		B													S			S	S							S	S				S		B		T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		507									.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
		777	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	N	V	E	L	T	S	S	L	K	G	K	P	V	S	A	Q	L	T	V	G	V	V	D	E	M	I	Y	A	L	Q	P	E	I	A	P	N	I	G	K	F	F	Y	P	L	G	R	N	N	V	R	T	S	S	S	L	S	F	I	S	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	L	K	I	E	A	D	Q	G	.	.	.	.	.	A	R	V	G	L	V	A	V	D	K	G	V	F	V	L	N	K	K	N	K	L	T	Q	R	K	I	W	D	V	V	E	K	A	D	I	G	C	T	P	G	S	G	R	N	Y	A	G	V	F	T	D	A	G	L	T	L	K	T	S	Q	G	L	E	T	Q
Template Known Secondary structure										T	T	.	.	.	.	.									B					T	T	S	G	G	G	S												T	T	T	S		S		S	S			S										T	B					T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		579	580	.	.	.	.	.	.	.	.						.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.
																																																																						839	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	L	S	S	E	P	V	A	P	G	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	R	A	D	P	Q	C	P	Q	S	V	Q	L	M	E	K	R	M	D	K	A	G	Q	Y	S	S	D	L	R	K	C	C	E	D	G	M	R	D	N	P	M	K	F	P	C	Q	R	R	A	Q	F	I	L	Q	G	D	A	C	V	K	A	F	L	D	C	C	E	Y	I	T	Q	L	R	Q	Q	H	S	R	D	G
Template Known Secondary structure						S	S						S	S										S			G	G	G						T	T	S	S			S	S								G	G	G	B		S																						T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		654	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.
		851	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.						.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.		.	.	.	920	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.																																											.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.																																											.
Query Sequence		T	N	R	S	E	R	R	V	K	M	L	E	R	P	R	R	E	E	V	D	T	A	A	W	.	.	.	.	.	M	P	S	L	T	T	D	K	Q	G	K	A	Y	F	T	F	L	M	P	D	S	L	T	R	W	R	I	T	A	R	G	M	N	G	D	G	L	V	G	Q	G	R	.	A	Y	L	R	S	E	K	N
Query Conservation																										.	.	.	.	.																																											.
Alig confidence																										.	.	.	.	.																																											.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	D	D	D	I	I	P	E	E	D	I	I	S	R	S	Q	F	P	E	S	W	L	W	T	V	I	E	D	L	K	Q	A	D	K	N	G	I	S	T	K	L	M	N	V	F	L	K	D	S	I	T	T	W	E	I	L	A	V	S	L	S	D	K	K	G	I	C	V	A	D	P	Y	E	V	T	V	M	Q	D
Template Known Secondary structure						S					S	S																					S			S	S	S												S	S	S												T	T	T												B			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		741	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820
		925	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.		.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.											.	.	970	.	.	.	.	.	.		.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.
Predicted Secondary structure																														.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query SS confidence																														.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Query Sequence		L	Y	M	K	W	S	M	P	T	V	Y	R	V	G	D	K	P	A	A	G	L	F	I	F	S	Q	Q	D	.	N	E	P	V	A	L	V	T	K	F	A	G	A	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	T	L	T	L	H	K	G	.	A	N	Y	I	S	L	T	Q	N	I	Q	Q	S	G	L	L
Query Conservation																														.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Alig confidence																														.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation
Template Sequence		F	F	I	D	L	R	L	P	Y	S	V	V	R	N	E	Q	V	E	I	R	A	I	L	Y	N	Y	R	E	A	E	N	L	K	V	R	V	E	L	L	Y	N	P	A	F	C	S	L	A	T	A	K	K	R	H	Q	Q	T	I	T	I	P	A	R	S	S	V	A	V	P	Y	V	I	V	P	L	K	I	G	L	H
Template Known Secondary structure										S				S	S														S	S													T	T				S	S		S	S											S	S													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		828	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.
		993	.	.	.	.	.				.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	E	L	Q	Q	.	.	.	N	G	Q	V	Q	D	S	I	S	T	K	L	S	F	V	D	N	S	W	P	V	E	Q	Q	K	N	V	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	D	N	A	L	M	L	P	E	Q	A	S	N	I	R	L	Q	S	S	E	T	P	Q	E
Query Conservation								.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	E	V	K	A	A	V	Y	N	H	F	I	S	D	G	V	K	K	T	L	K	V	V	P	E	G	V	R	V	N	K	T	V	A	V	R	T	L	N	P	E	H	L	G	Q	G	G	V	Q	R	E	E	V	P	A	A	D	L	S	D	Q	V	P	D	T	E	S	E	T	K	I	L	L	Q	G	T	P	V	A
Template Known Secondary structure										T	T	S															S	S																			B	T	T	B											T	T	B		T	T											S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		908	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.
		1054	.	.							.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.							.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	F	R	.	.	.	.	.	.	N	N	L	D	A	L	V	D	E	P	W	G	G	V	I	N	T	G	S	R	L	I	P	L	S	L	A	W	R	S	L	A	D	H	Q	S	A	A	.	.	.	.	.	.	A	N	D	I	R	Q	M	I	Q	D	N	R	L	R	L	M	Q	L	A	G	P	G	A	R	F	T	W
Query Conservation					.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	M	T	E	D	A	I	D	G	E	R	L	K	H	L	I	Q	T	P	S	G	C	G	E	Q	N	M	I	G	M	T	P	T	V	I	A	V	H	Y	L	D	S	T	D	Q	W	E	K	F	G	L	E	K	R	Q	E	S	L	E	L	I	R	K	G	Y	T	Q	Q	L	A	F	R	Q	K	S	S	A	Y	A	A
Template Known Secondary structure									S	T	T	T	G	G	G	S		S	S				S	T	T	G	G	G	G	G	T														T		G	G	G	S		T	T																		T	T	B		T	T	S		B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		988	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.
		1122	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.		.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.																									.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	E	D	G	N	G	D	A	F	L	T	A	W	A	W	Y	A	D	W	Q	A	S	Q	A	I	G	V	T	Q	Q	P	E	Y	W	Q	H	M	L	D	S	Y	.	A	E	Q	A	D	N	M	P	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	R	A
Query Conservation																																												.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.																					.	.																.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.																					.	.
Template Sequence		F	Q	Y	R	.	P	P	S	T	W	L	T	A	Y	V	V	K	V	F	A	L	A	A	N	L	.	.	I	A	I	D	S	K	D	L	C	E	T	V	K	W	L	I	L	E	K	Q	K	P	D	G	I	F	Q	E	D	G	P	V	I	H	Q	E	M	I	G	G	F	R	D	T	R	E	K	D	V	S	L	T	A
Template Known Secondary structure		S	T	T	S	.																		T	T	T	.	.	S																		T	B		T	T	S		B				S				S	G	G	G	S			T	T			S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure						.																					.	.
Template SS confidence
		1068	.	1070	.		.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.			.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.
		1177	.	.	1180	.	.	.	.	.	.					.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.
Query Sequence		L	V	L	A	W	A	Q	E	M	N	.	.	.	.	L	P	C	K	T	L	L	K	G	L	D	E	A	I	A	R	R	G	T	K	T	E	D	F	S	E	E	D	T	R	D	I	N	D	S	L	I	L	D	T	P	E	S	P	L	A	D	A	V	A	N	V	L	T	M	T	L	L	K	K	A	Q	L	K	S	T
Query Conservation												.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.																																														.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	L	I	A	L	H	E	A	K	D	I	C	E	A	Q	V	N	S	L	G	R	S	I	A	K	A	G	D	F	L	E	N	H	Y	R	E	L	R	R	P	Y	T	V	A	I	A	A	Y	A	L	A	L	L	G	K	L	E	G	.	.	.	.	.	D	R	L	T	K	F	L	N	T	A	K	E	K	N	R	W
Template Known Secondary structure										T	T	T	T	T	T	T	T		S	S																G	G	G			S														T	T				T	.	.	.	.	.									T		B	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1145	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.						.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1253	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.								.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	M	P	Q	V	Q	Q	Y	A	W	D	K	A	A	N	S	N	Q	P	L	A	H	T	V	V	L	L	N	S	G	G	D	A	T	Q	T	A	A	I	L	S	G	L	.	.	.	.	.	.	.	T	A	E	Q	S	T	I	E	R	A	L	A	M	N	W	L	A	K	Y	M	A	T	M	P	P	V	V	L	P	A
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	E	E	P	N	Q	K	L	Y	N	V	E	A	T	S	Y	A	L	L	A	L	L	A	R	K	D	Y	D	T	T	P	P	V	V	R	W	L	N	E	Q	R	Y	Y	G	G	G	Y	G	S	T	Q	A	T	F	M	V	F	Q	A	L	A	Q	Y	Q	K	D	V	P	D	H	K	E	L	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.			S	S																			T	T		G	G	G														B	T	T	B	B		S																		S			S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.
		1326	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.													1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	G	A	W	A	K	H	K	L	T	G	G	G	E	D	W	R	W	V	G	Q	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	I	L	S	F	G	D	E	L	S	P	Q	N	V	Q	V	R	W	R	E	P	A	K	M	A	Q	Q	S	N	I	P	V	T	V	E	R	Q	L	Y	R	L	I	P
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.												.	.
Template Conservation																																																																				.												.	.
Template Sequence		L	D	V	S	I	Q	L	P	S	R	N	S	A	V	R	H	R	I	L	W	E	S	A	S	L	L	R	S	E	E	T	K	E	N	E	R	F	T	V	K	A	E	G	K	G	Q	G	T	L	S	V	V	T	V	Y	H	A	K	L	K	G	K	V	S	C	K	.	K	F	D	L	R	V	S	I	R	P	A	.	.
Template Known Secondary structure									S	S	S	S	S								S	S	S	S		S							S	S										S	S																	T	T	S	S		B	.	S											.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																				.												.	.
Template SS confidence
		1293	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1394	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	E	E	M	S	F	I	L	Q	P	V	T	S	N	E	I	D	S	D	A	L	Y	L	D	E	I	T	L	T	S	E	Q	D	A	V	L	R	Y	G	Q	V	E	V	P	L	P	P	G	A	D	V	E	R	T	T	W	G	I	S	V	N	K	P	N	A	A	K	Q	Q	G	Q	L	L	E	K	A	R	N	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	T	V	K	K	P	Q	D	A	K	G	S	M	I	L	D	I	C	T	K	Y	L	G	D	Q	D	A	T	M	S	I	L	D	I	S	M	M	T	G	F	S	P	D	V	E	D	L	K	T	L	S	T	G	V	D	R	Y	I	S	K	Y	E	M	N	R	.	D	S	N	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S				T	T	S	S													S	S	S		B		S									T	T														S	S	B		S		S						S	.	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																			.
Template SS confidence
											1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.		.	.	.	.
		1474	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.		1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		M	G	E	L	A	Y	M	V	P	V	K	E	L	T	G	T	V	T	F	R	H	L	L	R	F	S	Q	K	G	Q	F	V	L	P	P	A	.	R	Y	V	R	S	Y	A	P	A	Q	Q	S
Query Conservation																																						.
Alig confidence														.																								.
Template Conservation														.
Template Sequence		N	T	L	I	I	Y	L	D	K	V	S	H	.	T	V	E	D	C	L	S	F	K	V	H	Q	Y	F	N	V	G	L	I	Q	P	G	A	V	K	V	Y	S	Y	Y	N	L	D	E	T	C
Template Known Secondary structure									S		B		S	.	S	S												S				S											T	T
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.		.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.