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Summary |   |
Top model | ||||||||||||||
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Sequence analysis |   |
Secondary structure and disorder prediction |   |
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  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | M | S | D | I | N | H | A | G | S | D | L | I | F | E | L | E | D | R | P | P | F | H | Q | A | L | V | G | A | I | T | H | L | L | A | I | F | V | P | M | V | T | P | A | L | I | V | G | A | A | L | Q | L | S | A | E | T | T | A | Y | L | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | V | S | M | A | M | I | A | S | G | I | G | T | W | L | Q | V | N | R | Y | G | I | V | G | S | G | L | L | S | I | Q | S | V | N | F | S | F | V | T | V | M | I | A | L | G | S | S | M | K | S | D | G | F | H | E | E | L | I | M | S | S | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | L | L | G | V | S | F | V | G | A | F | L | V | V | G | S | S | F | I | L | P | Y | L | R | R | V | I | T | P | T | V | S | G | I | V | V | L | M | I | G | L | S | L | I | K | V | G | I | I | D | F | G | G | G | F | A | A | K | S | S | G | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | T | F | G | N | Y | E | H | L | G | V | G | L | L | V | L | I | V | V | I | G | F | N | C | C | R | S | P | L | L | R | M | G | G | I | A | I | G | L | C | V | G | Y | I | A | S | L | C | L | G | M | V | D | F | S | S | M | R | N | L | P | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | L | I | T | I | P | H | P | F | K | Y | G | F | S | F | S | F | H | Q | F | L | V | V | G | T | I | Y | L | L | S | V | L | E | A | V | G | D | I | T | A | T | A | M | V | S | R | R | P | I | Q | G | E | E | Y | Q | S | R | L | K | G | G | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | V | L | A | D | G | L | V | S | V | I | A | S | A | V | G | S | L | P | L | T | T | F | A | Q | N | N | G | V | I | Q | M | T | G | V | A | S | R | Y | V | G | R | T | I | A | V | M | L | V | I | L | G | L | F | P | M | I | G | G | F | F | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | T | T | I | P | S | A | V | L | G | G | A | M | T | L | M | F | S | M | I | A | I | A | G | I | R | I | I | I | T | N | G | L | K | R | R | E | T | L | I | V | A | T | S | L | G | L | G | L | G | V | S | Y | D | P | E | I | F | K | I | L | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 430 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 440 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 450 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 460 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |   | P | A | S | I | Y | V | L | V | E | N | P | I | C | A | G | G | L | T | A | I | L | L | N | I | I | L | P | G | G | Y | R | Q | E | N | V | L | P | G | I | T | S | A | E | E | M | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Confidence Key | |||||||||||
High(9) |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   | Low (0) |
? | Disordered |
![]() ![]() | Alpha helix |
![]() ![]() | Beta strand |
Domain analysis |   |
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Please note, only up to the top 20 hits are modelled to reduce computer load
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Detailed template information |   |
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Binding site prediction |   |
Due to computational demand, binding site predictions are not run for batch jobs
If you want to predict binding sites, please manually submit your model of choice to 3DLigandSite
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||||||||
  | ||||||||||||||
If you use the binding site predictions from 3DLigandSite, please also cite: | ||||||||||||||
3DLigandSite: predicting ligand-binding sites using similar structures. | ||||||||||||||
Wass MN, Kelley LA and Sternberg MJ Nucleic Acids Research 38, W469-73 (2010) [PubMed] | ||||||||||||||
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