Job Description P67444 Confidence 55.96% Date Thu Jan 5 12:10:37 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 425 % Identity 11% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.		.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.
Query SS confidence																																															.
Query Sequence		M	S	D	I	N	H	A	G	S	D	L	I	F	E	L	E	D	R	P	P	F	H	Q	A	L	V	G	A	I	T	H	L	L	A	I	F	V	P	M	V	T	P	A	L	I	.	V	G	A	A	L	Q	L	S	A	E	T	T	A	Y	L	V	S	M	A	M	I	A	S	G	I	G	T	W	L	Q	V	N	R	Y
Query Conservation																																															.
Alig confidence																																															.
Template Conservation
Template Sequence		A	P	H	K	A	R	L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G	S	V	S
Template Known Secondary structure											S																													T	S								T	T	S	S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	V	G	S	G	L	L	S	I	Q	S	V	N	F	S	F	V	T	V	M	I	A	L	G	S	S	M	K	S	D	G	F	H	E	E	L	I	M	S	S	L	L	G	V	S	F	V	G	A	F	L	V	V	G	S	S	F	I	L	P	Y	L	R	R	V	I	T	P	T	V	S	G	I	V	V	L	M	I	G
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	S	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	T	S	S	I	A	V	.	.	.	.	.	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N
Template Known Secondary structure				S																												S	S	S	S		.	.	.	.	.															T										T	T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.						.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	S	L	I	K	V	G	I	I	D	F	G	G	G	F	A	A	K	S	S	G	T	F	G	N	Y	E	H	L	G	V	G	L	L	V	L	I	V	V	I	G	F	N	C	C	R	S	P	L	L	R	M	G	G	I	A	I	G	L	C	V	G	Y	I	A	S	L	C	L	G	M	V	D	F	S	S	M	R	N	L
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	A	H	N	V	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	C	G	L	P
Template Known Secondary structure									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S												T			S	T	T		T																					S	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	I	T	I	P	H	P	F	K	Y	G	F	S	F	S	F	H	Q	F	L	V	V	G	T	I	Y	L	L	S	V	L	E	A	V	G	D	I	T	A	T	A	M	V	S	R	R	P	I	Q	G	E	E	Y	Q	S	R	L	K	G	G	V	L	A	D	G	L	V	S	V	I	A	S	A	V	G	S	L	P	L
Query Conservation
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	E	E	Y	K	N	D	T	A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I
Template Known Secondary structure		S		T	T	T						T							T	S	S																													B	T	T	B	S					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.									.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		T	T	F	A	Q	N	N	G	V	I	Q	M	T	G	V	A	S	R	Y	V	G	R	T	I	A	V	M	L	V	I	L	G	L	F	P	M	I	G	G	F	F	T	T	I	P	S	A	V	L	G	G	A	M	T	L	M	F	S	M	I	A	I	A	G	I	R	I	I	I	T	N	G	L	.	K	R	R	E	T	L
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence																																																																											.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N	R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	A	A	G	T
Template Known Secondary structure														T	S	T	T																				T	T	S			T	T																	T													T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		399	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.			.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.			.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.												.	.
Query SS confidence																	.	.												.	.
Query Sequence		I	V	A	T	S	L	G	L	G	L	G	V	S	Y	D	.	.	P	E	I	F	K	I	L	P	A	S	I	.	.	Y	V	L	V	E	N	P	I	C	A	G	G	L	T	A	I	L	L	N	I	I	L	P	G	G	Y	R	Q	E	N	V	L	P	G	I	T	S	A
Query Conservation																	.	.												.	.
Alig confidence																	.	.												.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A	S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	F	G	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q	E	L	V	P
Template Known Secondary structure																												S	S		S																															G	G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.