Job Description P0A953 Confidence 99.79% Date Thu Jan 5 11:09:24 GMT 2012 Rank 72 Aligned Residues 307 % Identity 18% Template c3aleB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:os07g0271500 protein; PDBTitle: a type iii polyketide synthase that produces diarylheptanoid Resolution 2.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.		.	.	20	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.
Predicted Secondary structure																		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query SS confidence																		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query Sequence		K	R	A	V	I	T	G	L	G	I	V	S	S	I	G	N	.	N	Q	Q	E	V	L	A	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	R	S	G	I	T	F	S	Q	E	L	K	D	S	G	M	R	S	H	V	W	G	N	V	K	L	D	T	T	G	L	.	I	D
Query Conservation																		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Alig confidence																		.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.																							.
Template Conservation																																																							.	.
Template Sequence		G	L	A	A	V	L	A	I	G	T	A	N	P	P	N	C	V	T	Q	E	E	I	P	D	F	Y	F	R	V	T	N	S	D	H	L	T	A	L	K	D	K	F	K	R	I	C	Q	E	M	G	V	Q	R	.	.	R	Y	L	H	H	T	E	E	M	L	S	A	H	P	E	F	V	D	R	D	A	P	S	L	D
Template Known Secondary structure		S													S					T	T	T									T	T		T	T														T	S			S		.	.				S								T							T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.			.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
		62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	K	V	V	R	F	M	S	D	A	S	I	Y	A	F	L	S	M	E	Q	A	I	A	D	A	G	L	S	P	E	A	Y	Q	N	N	P	R	V	G	L	I	A	G	S	G	G	G	S	P	R	F	Q	V	F	G	A	D	A	M	R	G	P	R	G	L	K	A	V	G	P	Y	V	V	T	K	A	M	A	S	G
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	L	D	I	A	A	D	A	V	P	E	L	A	A	E	A	A	K	K	A	I	A	E	W	G	R	P	A	A	D	I	T	H	.	.	.	.	.	L	V	V	T	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	A	H	V	P	G
Template Known Secondary structure																												S		G	G	G				.	.	.	.	.						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.						.	.	.	140	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160				.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.
Query Sequence		V	S	A	C	L	A	T	P	F	K	I	H	G	V	N	Y	S	I	S	.	.	.	S	A	C	A	T	S	A	H	C	I	G	N	A	V	E	Q	I	Q	L	G	K	Q	D	I	V	F	A	G	G	G	E	E	L	C	W	E	M	A	C	E	F	D	A	M	G	A	L	S	T	K	Y	N	D	T	P	E	K	A
Query Conservation																					.	.	.
Alig confidence																					.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	F	R	L	V	P	L	L	G	L	R	P	S	V	R	R	T	M	L	H	L	N	G	C	F	A	G	C	A	A	L	R	L	A	K	D	L	A	E	N	S	R	G	A	R	V	L	V	V	A	A	E	L	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Y
Template Known Secondary structure											T			T	T										G	G	G															T	S	T	T											G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.																							.	.
		219	220	.	.	.	.	.	.						.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	T	Y	D	A	H	R	.	.	.	.	.	D	G	F	V	I	A	G	G	G	G	M	V	V	V	E	E	L	E	H	A	L	A	R	G	A	H	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	S	D	G	A	D	M	V	A	P	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																			.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.
Template Sequence		F	T	G	P	D	E	G	C	F	R	T	L	L	V	Q	G	L	F	G	D	G	A	A	A	V	I	V	G	A	D	A	.	.	.	D	D	V	E	R	P	L	F	E	I	V	S	A	A	Q	T	I	I	P	E	S	D	H	A	L	N	M	R	F	T	E	R	R	L	D	G	V	L	G	R	Q	V	P	G	L	I
Template Known Secondary structure							T	T											B											S	S		.	.	.		S	S	S															T	T		T	T	T							S	S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.				.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
			275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.				.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure		.																																																					.	.	.
Query SS confidence		.																																																					.	.	.
Query Sequence		.	E	G	A	V	R	C	M	K	M	A	M	H	G	V	D	T	P	I	D	Y	L	N	S	H	G	T	S	T	P	V	G	D	V	K	E	L	A	A	I	R	E	V	F	G	D	K	S	P	A	I	S	A	.	.	.	T	K	A	M	T	G	H	S	L	G	A	A	G	V	Q	E	A	I	Y	S	L	L	M	L
Query Conservation		.																																																					.	.	.
Alig confidence		.																																				.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	N	V	E	R	C	L	L	D	M	F	G	P	G	G	W	N	D	L	F	W	A	V	H	P	G	S	S	T	I	M	D	Q	V	D	.	.	.	.	.	A	A	L	G	L	E	P	G	K	L	A	A	S	R	R	V	L	S	D	Y	G	N	M	S	G	A	T	V	I	F	A	L	D	E	L	R	R	Q	R
Template Known Secondary structure																		G	G	G	S																	.	.	.	.	.				T			G	G	G	G												B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320						.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	G	F	I	A	P	S	I	N	I	E	E	L	D	E	Q	A	A	G	L	N	I	V	T	E	T	T	D	R	E	L	T	T	V	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	V	M	R
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	W	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	G	V	M	M	A	F	G	P	G	M	T	V	D	A	M	L	L	H
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		367	.	.																														370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.