Job Description P0A953 Confidence 99.90% Date Thu Jan 5 11:09:24 GMT 2012 Rank 58 Aligned Residues 324 % Identity 15% Template c3a5qA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:benzalacetone synthase; PDBTitle: benzalacetone synthase from rheum palmatum Resolution 1.80 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query SS confidence														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Query Sequence		V	I	T	G	L	G	I	V	S	S	I	G	.	N	N	Q	Q	E	V	L	A	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	R	S	G	I	T	F	S	Q	E	L	K	D	S	G	M	R	S	H	V	W	G	N	V	K	L	D	T	T	G	L	.	I	D	R	K	V
Query Conservation														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Alig confidence														.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.																							.
Template Conservation																																																				.	.
Template Sequence		T	V	M	A	I	G	T	A	N	P	P	N	C	Y	Y	Q	A	D	F	P	D	F	Y	F	R	V	T	N	S	D	H	L	I	N	L	K	Q	K	F	K	R	L	C	E	N	S	R	I	E	K	.	.	R	Y	L	H	V	T	E	E	I	L	K	E	N	P	N	I	A	A	Y	E	A	T	S	L	N	V	R	H
Template Known Secondary structure												S					G	G	G									T	T		T	T														T	T	T				.	.				S														S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60			.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	F	M	S	D	A	S	I	Y	A	F	L	S	M	E	Q	A	I	A	D	A	G	L	S	P	E	A	Y	Q	N	N	P	R	V	G	L	I	A	G	S	G	G	G	S	P	R	F	Q	V	F	G	A	D	A	M	R	G	P	R	G	L	K	A	V	G	P	Y	V	V	T	K	A	M	A	S	G	V	S	A
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	M	Q	V	K	G	V	A	E	L	G	K	E	A	A	L	K	A	I	K	E	W	G	Q	P	K	S	K	I	T	H	.	.	.	.	.	L	I	V	C	C	L	A	G	V	D	M	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	Y
Template Known Secondary structure																									S		G	G	G				.	.	.	.	.						S	S				S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.						120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.																													.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160				.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.
Query Sequence		C	L	A	T	P	F	K	I	H	G	V	N	Y	S	I	S	.	.	.	S	A	C	A	T	S	A	H	C	I	G	N	A	V	E	Q	I	Q	L	G	K	Q	D	I	V	F	A	G	G	G	E	E	L	C	W	E	M	A	C	E	F	D	A	M	G	A	L	S	T	K	Y	N	D	T	P	E	K	A	S	R	T
Query Conservation																		.	.	.
Alig confidence																		.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	L	T	K	L	L	D	L	D	P	S	V	K	R	F	M	F	Y	H	L	G	C	Y	A	G	G	T	V	L	R	L	A	K	D	I	A	E	N	N	K	G	A	R	V	L	I	V	C	S	E	M	T	T	T	C	F	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	S	E	T	H
Template Known Secondary structure							T	T			T	T								S			T	T																S	T	T												T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.																		.	.	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	A	H	R	D	G	F	V	I	A	G	G	G	G	M	V	V	V	E	E	L	E	H	A	L	A	R	G	A	H	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	S	D	G	A	D	M	V	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	G	A	V	R	C	M	K	M
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	S	M	I	G	Q	A	I	L	G	D	G	A	A	A	V	I	V	G	A	D	P	D	L	T	V	E	R	P	I	F	E	L	V	S	T	A	Q	T	I	V	P	E	S	H	G	A	I	E	G	H	L	L	E	S	G	L	S	F	H	L	Y	K	T	V	P	T	L	I	S	N	N	I	K	T	C	L	S	D
Template Known Secondary structure			S								B											S	S			T	T	T																T	T		T	T	S							T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290				.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.				.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.																													.	.	.
Query SS confidence									.	.	.																													.	.	.
Query Sequence		A	M	H	G	V	D	T	.	.	.	P	I	D	Y	L	N	S	H	G	T	S	T	P	V	G	D	V	K	E	L	A	A	I	R	E	V	F	G	.	.	.	D	K	S	P	A	I	S	A	T	K	A	M	T	G	H	S	L	G	A	A	G	V	Q	E	A	I	Y	S	L	L	M	L	E	H	G	F	I	A	P
Query Conservation									.	.	.																													.	.	.
Alig confidence									.	.	.																				.	.	.	.	.					.	.	.																										.	.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template Sequence		A	F	T	P	L	N	I	S	D	W	N	S	L	F	W	I	A	H	P	G	G	P	A	I	L	D	Q	V	T	.	.	.	.	.	A	K	V	G	L	E	K	E	K	L	K	V	T	R	Q	V	L	K	D	Y	G	N	M	S	S	A	T	V	F	F	I	M	.	.	.	D	E	M	R	K	K	S	L	E	N	G
Template Known Secondary structure				G	G	G	T				G	G	G	S							S										.	.	.	.	.				T			T	T	T	T												B		G	G	G							.	.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.																																	.	.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.						.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	I	N	I	E	E	L	D	E	Q	A	A	G	L	N	I	V	T	E	T	T	D	R	E	L	T	T	V	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	V	M	R	K	L	K
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	L	E	W	G	V	L	F	G	F	G	P	G	I	T	V	E	T	V	V	L	R	S	V	P
Template Known Secondary structure			S	B	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S									T	T	T											B
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		351	.	.	.	.																		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.