Job Description P0A953 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:09:24 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 400 % Identity 24% Template c2uv8C_ PDB info PDB header:transferase Chain: C: PDB Molecule:fatty acid synthase subunit alpha (fas2); PDBTitle: crystal structure of yeast fatty acid synthase with stalled2 acyl carrier protein at 3.1 angstrom resolution Resolution 3.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.			.	.	.	.	.	.	.	.	40																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.			.	.	.	.	.	.		60
Predicted Secondary structure															.																	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.							.
Query SS confidence															.																	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.							.
Query Sequence		R	A	V	I	T	G	L	G	I	V	S	S	I	.	G	N	N	Q	Q	E	V	L	A	S	L	R	E	G	R	S	.	.	G	I	T	F	S	Q	E	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	G	M	R	S	H	V	W	G	N	V	K	.	.	L	D	T	T	G	L	.	I
Query Conservation															.																	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.							.
Alig confidence															.																	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.							.
Template Conservation
Template Sequence		M	I	Q	E	V	I	V	E	E	D	L	E	P	F	E	A	S	K	E	T	A	E	Q	F	K	H	Q	H	G	D	K	V	D	I	F	E	I	P	E	T	G	E	Y	S	V	K	L	L	K	G	A	T	L	Y	I	P	K	A	L	R	F	D	R	L	V	A	G	Q	I	P	T	G	W	N	A	K	T	Y	G	I
Template Known Secondary structure									S	S																				G	G	G							T	T	T	S								T	T												S									T	T			T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1121	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90					.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.
Query Sequence		D	R	K	V	V	R	F	M	S	D	A	S	I	Y	A	F	L	S	M	E	Q	A	I	A	D	A	G	L	S	P	.	.	.	.	E	A	Y	Q	N	N	P	R	V	G	L	I	A	G	S	G	G	G	S	P	R	F	Q	V	F	G	A	D	A	M	R	G	P	R	G	L	K	A	V	G	P	Y	V	V	T	K
Query Conservation																																.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.
Template Sequence		S	D	D	I	I	S	Q	V	D	P	I	T	L	F	V	L	V	S	V	V	E	A	F	I	A	S	G	I	T	D	P	Y	E	M	Y	K	Y	V	H	V	S	E	V	G	N	C	S	G	S	G	M	G	G	V	S	A	L	R	.	.	.	G	M	F	K	D	R	F	K	D	E	P	V	Q	N	D	I	L	Q	E
Template Known Secondary structure									S																		T	T			S	G	G	G					S		G	G	G								S	S								.	.	.				T	T	T	T	T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.
Template SS confidence
		1201	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.				.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.		.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.						.	210
Predicted Secondary structure													.																																																														.	.	.	.	.
Query SS confidence													.																																																														.	.	.	.	.
Query Sequence		A	M	A	S	G	V	S	A	C	L	A	.	T	P	F	K	I	H	G	V	N	Y	S	I	S	S	A	C	A	T	S	A	H	C	I	G	N	A	V	E	Q	I	Q	L	G	K	Q	D	I	V	F	A	G	G	G	E	E	L	C	W	E	M	A	C	E	F	D	A	M	G	A	L	S	.	.	.	.	.	T	K
Query Conservation													.																																																														.	.	.	.	.
Alig confidence													.																																																														.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	F	I	N	T	M	S	A	W	V	N	M	L	L	I	S	S	S	G	P	I	K	T	P	V	G	A	C	A	T	S	V	E	S	V	D	I	G	V	E	T	I	L	S	G	K	A	R	I	C	I	V	G	G	Y	D	D	F	Q	E	E	G	S	F	E	F	G	N	M	K	A	T	S	N	T	L	E	E	F	E
Template Known Secondary structure			S	T	T										T	T				S								G	G	G															T	T	S		S																					T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1278	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	N	D	T	P	E	K	A	S	R	T	Y	D	A	H	R	D	G	F	V	I	A	G	G	G	G	M	V	V	V	E	E	L	E	H	A	L	A	R	G	A	H	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	S	D	G	A	D	M	V	A	P	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	G	R	T	P	A	E	M	S	R	P	A	T	T	T	R	N	G	F	M	E	A	Q	G	A	G	I	Q	I	I	M	Q	A	D	L	A	L	K	M	G	V	P	I	Y	G	I	V	A	M	A	A	T	A	T	D	K	I	G	R	S	V	P	A	P	G	K	G	I	L	T	T	A	R	E	H	H	S	S	V	K
Template Known Secondary structure		T	T			G	G	G	S			T	T	B	T	T			S	B		B	B																		T																	S		S		T	T				S	G	G	G	G	G	G					S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1358	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.
																																																																																275	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	S	P	N	L	N	M	K	Y	R	K	R	Q	L	V	T	R	E	A	Q	I	K	D	W	V	E	N	E	L	E	A	L	K	L	E	A	E	E	I	P	S	E	D	Q	N	E	F	L	L	E	R	T	R	E	I	H	N	E	A	E	S	Q	L	R	A	A	Q	Q	Q	W	G	N	D	F	Y	K	R	D	P
Template Known Secondary structure		S			G	G	G																																T	T	S			S																													T	T	S	T	T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1438	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290				.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.							320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	V	R	C	M	K	M	A	M	H	G	V	D	T	.	.	.	P	I	D	Y	L	N	S	H	G	T	S	T	P	V	G	D	V	K	E	L	A	A	I	R	E	V	F	G	D	.	.	.	.	.	.	K	S	P	A	I	S	A	T	K	A	M	T	G	H	S	L	G	A	A	G	V	Q	E	A	I	Y	S	L
Query Conservation																.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	I	A	P	L	R	G	A	L	A	T	Y	G	L	T	I	D	D	L	G	V	A	S	F	H	G	T	S	T	K	A	N	D	K	N	E	S	A	T	I	N	E	M	M	K	H	L	G	R	S	E	G	N	P	V	I	G	V	F	Q	K	F	L	T	G	H	P	K	G	A	A	G	A	W	M	M	N	G	A	L
Template Known Secondary structure		S	S									T	T	T			G	G	G										S																				T			T	T								T						B		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1518	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.					370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.
Query Sequence		L	M	L	E	H	G	F	I	A	P	S	I	N	I	E	E	L	D	E	Q	A	A	.	.	.	.	G	L	N	I	V	T	E	T	T	D	R	E	L	T	T	V	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	V	M	R	K	L	K
Query Conservation																								.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	I	L	N	S	G	I	I	P	G	N	R	N	A	D	N	V	D	K	I	L	E	Q	F	E	Y	V	L	Y	P	S	K	T	L	K	T	D	G	V	R	A	V	S	I	T	S	F	G	F	G	Q	K	G	G	Q	A	I	V	V	H	P	D
Template Known Secondary structure					T	T							T	T		S	S	B		G	G	G	G	G		T	T					S	S					S												T	T	T										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1598	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.	.	.	.