Job Description P0A953 Confidence 99.68% Date Thu Jan 5 11:09:24 GMT 2012 Rank 75 Aligned Residues 314 % Identity 14% Template c2h84A_ PDB info PDB header:biosynthetic protein, transferase Chain: A: PDB Molecule:steely1; PDBTitle: crystal structure of the c-terminal type iii polyketide synthase (pks2 iii) domain of 'steely1' (a type i/iii pks hybrid from dictyostelium) Resolution 2.90 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.														.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	R	A	V	I	T	G	L	G	I	V	S	S	I	G	.	N	N	Q	Q	E	V	L	A	S	L	R	E	G	R	S	G	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	S	Q	E	L	K	D	S	G	M	R	S	H	V	W	G	N	V	K	L	D	T	T	G	L	I	D	R	K	V	V	R	F
Query Conservation																	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	N	S	F	V	L	G	I	G	I	S	V	P	G	E	P	I	S	Q	Q	S	L	K	D	S	I	S	N	D	F	S	D	K	A	E	T	N	E	K	V	K	R	I	F	E	Q	S	Q	I	K	T	R	H	L	V	R	D	Y	T	K	P	E	N	S	I	K	F	R	H	L	E	T	I	T	D	V	N	N	Q	F
Template Known Secondary structure														S	S	S															S		S														T	T								S	S		T	T	S	G	G	G		G	G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2785	.	.	.	.	2790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2860	.	.	.	.
		68	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	D	A	S	I	Y	A	F	L	S	M	E	Q	A	I	A	D	A	G	L	S	P	E	A	Y	Q	N	N	P	R	V	G	L	I	A	G	S	G	G	G	S	P	R	F	Q	V	F	G	A	D	A	M	R	G	P	R	G	L	K	A	V	G	P	Y	V	V	T	K	A	M	A	S	G	V	S	A	C	L	A
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	K	V	V	P	D	L	A	Q	Q	A	C	L	R	A	L	K	D	W	G	G	D	K	G	D	I	T	H	.	.	.	.	.	I	V	S	V	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	I	I	I	P	D	V	N	F	K	L	I
Template Known Secondary structure																						S		G	G	G				.	.	.	.	.						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2865	.	.	.	.	2870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2890	.	.						.	.	.	.	.	.																													.	2900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2910	.
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160				.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.
Query SS confidence															.	.	.
Query Sequence		T	P	F	K	I	H	G	V	N	Y	S	I	S	.	.	.	S	A	C	A	T	S	A	H	C	I	G	N	A	V	E	Q	I	Q	L	G	K	Q	D	I	V	F	A	G	G	G	E	E	L	C	W	E	M	A	C	E	F	D	A	M	G	A	L	S	T	K	Y	N	D	T	P	E	K	A	S	R	T	Y	D	A
Query Conservation															.	.	.
Alig confidence															.	.	.																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	L	G	L	N	K	D	V	E	R	V	S	L	N	L	M	G	C	L	A	G	L	S	S	L	R	T	A	A	S	L	A	K	A	S	P	R	N	R	I	L	V	V	C	T	E	V	C	S	L	H	F	S	N	T	D	G	G	D	Q	M	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T			T	T								S		G	G	G														T	T		T	T												G	G	G				S	S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2912	.	.	.	.	.	.	.	2920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2970	.	.	.	.	.
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	R	D	G	F	V	I	A	G	G	G	G	M	V	V	V	E	E	L	E	H	A	L	A	R	G	A	H	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	S	D	G	A	D	M	V	A	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	G	A	V	R	C	M	K	M	A
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																		.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	S	S	I	F	A	D	G	S	A	A	Y	I	I	G	C	N	P	.	.	.	R	I	E	E	T	P	L	Y	E	V	M	C	S	I	N	R	S	F	P	N	T	E	N	A	M	V	W	D	L	E	K	E	G	W	N	L	G	L	D	A	S	I	P	I	V	I	G	S	G	I	E	A	F	V	D	T	L
Template Known Secondary structure		.	.	.				B											S	S		.	.	.		T	T																S	S		T	T	S							T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																		.	.	.
Template SS confidence
					2976	.	.	.	2980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	2990	.	.				.	.	.	.	.	.	.	3000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3040	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.									290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.				.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Query Sequence		M	H	G	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	I	D	Y	L	N	S	H	G	T	S	T	P	V	G	D	V	K	E	L	A	A	I	R	E	V	F	G	D	K	S	P	A	I	S	A	.	.	.	T	K	A	M	T	G	H	S	L	G	A	A	G	V	Q	E	A	I	Y	S	L	L	M	L	E	H	G
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	K	A	K	L	Q	T	S	T	A	I	S	A	K	D	C	E	F	L	I	H	T	G	G	K	S	I	L	M	N	I	E	.	.	.	.	.	N	S	L	G	I	D	P	K	Q	T	K	N	T	W	D	V	Y	H	A	Y	G	N	M	S	S	A	S	V	I	F	V	M	D	H	A	R	K	S	K	S	L	P
Template Known Secondary structure						T	T	T	S		S				S	S	S	S																	.	.	.	.	.			T	T			G	G	G	G												B		T	T												T		S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3080	.	.						.	.	.	.	.	.	.	3090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3120	.	.	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	I	A	P	S	I	N	I	E	E	L	D	E	Q	A	A	G	L	N	I	V	T	E	T	T	D	R	E	L	T	T	V	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	V	M	R	K	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	S	I	S	L	A	F	G	P	G	L	A	F	E	G	C	F	L	K	N	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																															3125	.	.	.	.	3130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	3140	.	.	.	.	.	.