Job Description P0A953 Confidence 99.96% Date Thu Jan 5 11:09:24 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 328 % Identity 13% Template c2d3mA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:pentaketide chromone synthase; PDBTitle: pentaketide chromone synthase complexed with coenzyme a Resolution 1.60 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.		.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.								.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.										.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.																					.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Query SS confidence																	.																					.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Query Sequence		R	A	V	I	T	G	L	G	I	V	S	S	I	G	N	.	N	Q	Q	E	V	L	A	S	L	R	E	G	R	S	G	I	T	F	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	E	L	K	D	S	G	M	R	S	H	V	W	G	N	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	T	T	G	L	.	I	D	R	K	V
Query Conservation																	.																					.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Alig confidence																	.																					.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	T	V	M	A	I	G	T	A	H	P	P	H	I	F	P	Q	D	T	Y	A	D	V	Y	F	R	A	T	N	S	E	H	K	V	E	L	K	K	K	F	D	H	I	C	K	K	T	M	I	G	K	R	Y	F	N	Y	D	E	E	F	L	K	K	Y	P	N	I	T	S	Y	D	E	P	S	L	N	D	R	Q
Template Known Secondary structure														S					G	G	G									T	T		T	T															S								S							T	T		T	T	T	S	S	S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	F	M	S	D	A	S	I	Y	A	F	L	S	M	E	Q	A	I	A	D	A	G	L	S	P	E	A	Y	Q	N	N	P	R	V	G	L	I	A	G	S	G	G	G	S	P	R	F	Q	V	F	G	A	D	A	M	R	G	P	R	G	L	K	A	V	G	P	Y	V	V	T	K	A	M	A	S	G	V	S	A
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	I	C	V	P	G	V	P	A	L	G	T	E	A	A	V	K	A	I	E	E	W	G	R	P	K	S	E	I	T	H	.	.	.	.	.	L	V	F	C	T	S	C	G	V	D	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	D	F
Template Known Secondary structure																									S		G	G	G				.	.	.	.	.						S	S				S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.						140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.																													.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.			.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure												.	.
Query SS confidence												.	.
Query Sequence		C	L	A	T	P	F	K	I	H	G	.	.	V	N	Y	S	I	S	S	A	C	A	T	S	A	H	C	I	G	N	A	V	E	Q	I	Q	L	G	K	Q	D	I	V	F	A	G	G	G	E	E	L	C	W	E	M	A	C	E	F	D	A	M	G	A	L	S	T	K	Y	N	D	T	P	E	K	A	S	R	T	Y
Query Conservation												.	.
Alig confidence												.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	C	A	K	L	L	G	L	H	A	N	V	N	K	Y	C	I	Y	M	Q	G	Y	A	G	G	T	V	M	R	Y	A	K	D	L	A	E	N	N	R	G	A	R	V	L	V	V	C	A	E	L	T	I	M	M	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	N	E	T	H	L
Template Known Secondary structure								T			T	T								S																		T	S	T	T											G	G	G	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.																		.	.	.	.	.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	H	R	D	G	F	V	I	A	G	G	G	G	M	V	V	V	E	E	L	E	H	A	L	A	R	G	A	H	I	Y	A	E	I	V	G	Y	G	A	T	S	D	G	A	D	M	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	S	G	E	G	A	V	R	C	M	K	M	A
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	N	A	I	G	I	S	L	F	G	D	G	A	A	A	L	I	I	G	S	D	P	I	I	G	V	E	K	P	M	F	E	I	V	C	T	K	Q	T	V	I	P	N	T	E	D	V	I	H	L	H	L	R	E	T	G	M	M	F	Y	L	S	K	G	S	P	M	T	I	S	N	N	V	E	A	C	L	I	D	V
Template Known Secondary structure								T	T	B											S	S			T	T	T																T	T		T	T	T							T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		285	.	.	.	.	290							.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.				.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Query Sequence		M	H	G	V	D	T	.	.	.	.	.	.	P	I	D	Y	L	N	S	H	G	T	S	T	P	V	G	D	V	K	E	L	A	A	I	R	E	V	F	G	.	.	.	D	K	S	P	A	I	S	A	T	K	A	M	T	G	H	S	L	G	A	A	G	V	Q	E	A	I	Y	S	L	L	M	L	E	H	G	F	I
Query Conservation								.	.	.	.	.	.																													.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.					.	.	.																																				.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.																																											.	.
Template Sequence		F	K	S	V	G	I	T	P	P	E	D	W	N	S	L	F	W	I	P	H	P	G	G	R	A	I	L	D	Q	V	E	.	.	.	.	.	A	K	L	K	L	R	P	E	K	F	R	A	A	R	T	V	L	W	D	Y	G	N	M	V	S	A	S	V	G	Y	I	L	D	E	M	R	R	K	S	A	A	K	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	T					S	S	G	G	G	S							S										.	.	.	.	.			T	T			T	T	T	T												B		G	G	G																T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.																																											.	.
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330						.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	P	S	I	N	I	E	E	L	D	E	Q	A	A	G	L	N	I	V	T	E	T	T	D	R	E	L	T	T	V	M	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	T	L	V	M	R	K	L	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	E	T	Y	G	E	G	L	E	W	G	V	L	L	G	F	G	P	G	I	T	V	E	T	I	L	L	H	S	L	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	B	T	T	T	T		S									T	T	T											B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.