Job Description P37342 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:55:22 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 467 % Identity 17% Template d1r9da_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like Resolution 1.80

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	T	S	H	E	N	A	L	Q	Q	R	C	Q	Q	I	V	T	S	P	V	L	S	P	E	Q	K	R	H	F	L	A	L	E	A	E	N	N	L	P	Y	P	Q	L	P	A	E	A	R	R	A	L	D	E	G	V	I	C	D	M	F	E	G	H	A	P	Y	K	P	R	Y	V	L	P	D	Y	A	R	F	L	A
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	F	I	K	K	E	K	F	L	N	S	V	I	I	S	C	E	A	A	I	T	Y	V	N	R	.	.	.	Y	A	K	K	A	K	E	I	A	D	N	T	S	D	A	K	R	K	A	E	L	N	E	I	A	K	I	C	S	K	V	S	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T																										.	.	.										T	T																					T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.				.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.		.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.				.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.																	.	.	.																							.	.	.	.
Query SS confidence																																				.																	.	.	.																							.	.	.	.
Query Sequence		N	G	S	E	W	L	E	L	E	G	A	K	D	L	D	D	A	L	S	L	L	T	I	L	Y	H	H	V	P	S	V	T	S	M	.	P	V	Y	L	G	Q	L	D	A	L	L	Q	P	Y	V	R	.	.	.	I	L	T	Q	D	E	I	D	V	R	I	K	R	F	W	R	Y	L	D	R	T	L	.	.	.	.
Query Conservation																																				.																	.	.	.																							.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.																	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	K	S	F	Y	E	A	C	Q	L	F	W	F	I	H	A	I	I	N	I	E	S	N	G	H	S	I	S	P	A	R	F	D	Q	Y	M	Y	P	Y	Y	E	N	D	K	N	I	T	D	K	F	A	Q	E	L	I	D	C	I	W	I	K	L	N	D	I	N	K	V	R	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.				S																						S		B			B	S													S	S																	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
											154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.								.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.		210	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.																																												.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.																																												.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	A	F	M	H	A	N	I	G	P	S	D	.	.	.	.	.	.	.	S	P	I	T	R	A	I	L	R	A	D	A	E	L	K	Q	V	S	P	N	L	T	F	I	Y	D	P	E	I	T	P	D	D	L	L	L	E	V	A	K	N	I	C	.	E	C	S	K	P	H	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.																																												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.																													.															.
Template Conservation																																																											.
Template Sequence		E	I	S	T	K	H	F	G	G	Y	P	M	Y	Q	N	L	I	V	G	G	Q	N	S	E	G	K	D	A	T	N	K	V	S	Y	M	A	L	E	A	A	V	H	V	K	L	P	Q	P	S	L	S	V	R	I	W	N	K	.	T	P	D	E	F	L	L	R	A	A	E	L	T	R	E	G	L	G	L	P	A	Y
Template Known Secondary structure		T	T					S		S	S											B		T	T	S		B																			S		S								T	T	.															T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.		.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		217	.	.	220	.	.	.	.									.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.			.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.																.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	N	G	P	V	H	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	I	F	T	K	G	G	Y	G	I	V	S	C	Y	N	S	L	P	L	A	G	.	.	G	G	S	T	L	V	R	L	N	L	K	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	R	S	E	S	L	D	D	F	F	T	R	T
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation																																																																														.	.
Template Sequence		Y	N	D	E	V	I	I	P	A	L	V	S	R	G	L	T	L	E	D	A	R	D	Y	G	I	I	G	C	V	E	P	Q	K	P	G	K	T	E	G	W	H	D	S	A	F	F	N	L	A	R	I	V	E	L	T	I	N	S	G	F	D	K	N	K	Q	I	G	P	K	T	Q	N	F	E	E	M	.	.	K	S
Template Known Secondary structure														T	T								T					T	T	T					T	T	S					T	T	S														T	T	T	B		S	S	S	B		S						G	G	G		.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.			.	.
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.												.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.												.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	H	Y	C	Q	Q	Q	I	A	I	I	D	A	R	C	E	F	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	Q	S	H	F	F	E	N	S	F	L	V	K	E	G	L	I	N	P	E	R	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	M	F	G	M	Y	G	L	A	E	A	V	N	L	L
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	E	F	M	K	A	Y	K	A	Q	M	E	Y	F	V	K	H	M	C	C	A	D	N	C	I	D	I	A	H	A	E	R	A	P	L	P	F	L	S	S	M	V	D	N	C	I	G	K	G	K	S	L	Q	D	G	G	A	E	Y	N	F	S	G	P	Q	G	V	G	V	A	N	I	G	D	S	L	V	A	V
Template Known Secondary structure																																											T	S	T	T					T			T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		484	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
		330	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	340	.		.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.										370
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	E	K	E	G	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	Y	G	K	.	E	A	A	A	N	E	V	G	Y	R	I	S	A	Q	L	A	E	F	V	A	N	T	P	V	K	Y	G	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	K	I	V	F	D	E	N	K	I	T	P	S	E	L	K	K	T	L	N	N	D	F	K	N	S	E	E	I	Q	A	L	L	K	N	A	P	K	F	G	N	D	I	D	E	V	D	N	L	A	R	E	G	A	L	V	Y	C	R	E	V	N	K	Y	T	N	P	R	G	G	N	F	Q	P	G	L	Y	P	S	S
Template Known Secondary structure					T	T	T	S		S	S											T	T	T	T	T										T	S			T	T	S																					T	T		B		T	T	S						B	B			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.											.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.				.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Query Sequence		K	R	A	M	L	H	A	Q	S	G	I	S	S	D	I	G	T	T	P	G	A	R	L	P	Y	G	D	E	P	D	P	I	T	H	L	Q	T	V	A	P	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	A	Y	Y	Y	S	G	I	S	D	I	L	T	L	D	E	T	I	K	R	N	P	Q	A	.	.	.	L	V
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																						.	.	.
Template Sequence		I	N	V	Y	F	G	S	L	T	G	A	T	P	D	G	R	K	S	G	Q	.	.	.	P	L	A	D	G	V	S	P	S	R	G	C	D	V	S	G	P	T	A	A	C	N	S	V	S	K	L	D	H	F	I	A	S	N	G	T	L	F	N	Q	K	F	H	P	S	A	L	K	G	D	N	G	L	M	N	L	S
Template Known Secondary structure									T					T	T	S			T	T		.	.	.					T	T	S			T	T	T			S										T	T	S		T	T	T		T	T		B								G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.
Template SS confidence
		644	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.				.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	L	C	L	G	A	F	K	A	G	M	R	E	F	T	A	N	V	S	G	N	D	L	V	R	V	T	G	Y	M	V	R	L	S	D	L	E	K	Y	R	A	E	G	S	R	T	N	T	T	W	L	G	E	E	A	A	R	N	T	R	I	L	E	R	Q	P	R	V	I	S	H	E	Q	Q	M
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template Sequence		S	L	I	R	S	Y	F	D	Q	K	G	F	H	V	Q	F	N	V	I	D	K	K	I	L	L	.	.	.	.	.	A	A	Q	K	N	P	E	K	Y	Q	D	L	I	V	R	.	.	.	.	V	A	G	Y	S	A	Q	F	I	S	L	D	K	S	I	Q	N	D	I	I	A	R	T	E	H	V
Template Known Secondary structure										T	T																.	.	.	.	.						G	G	G	G	T	T					.	.	.	.		S	S	S				G	G	G	S											S			B
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																.	.	.	.
Template SS confidence
		721	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.						.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760					.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.