Job Description P37342 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:55:22 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 311 % Identity 16% Template d1qhma_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like Resolution 2.80

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		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	Q	K	R	H	F	L	A	L	E	A	E	N	N	L	P	Y	P	Q	L	P	A	E	A	R	R	A	L	D	E	G	V	I	C	D	M	F	E	G	H	A	P	Y	K	P	R	Y	V	L	P	D	Y	A	R	F	L	A	N	G	S	E	W	L	E	L	E	G	A	K	D	L	D	D	A	L	S	L	L	T
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	I	R	L	R	E	E	I	A	E	Q	H	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	G	Q	M	K	E	M	A	A	K	Y	G	Y	D	I	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	T	N	A	Q	E	A	I	Q	W	T	Y
Template Known Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T				S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1216	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.											.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.		.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.							.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.														.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure														.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	Y	H	H	V	P	S	V	T	S	M	.	P	V	Y	L	G	Q	L	D	A	L	L	Q	P	Y	V	R	I	.	.	.	.	.	.	L	T	Q	D	E	I	D	V	R	I	K	R	F	W	R	Y	L	D	R	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	A	F	M	H	A	N	I	G
Query Conservation														.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	Y	L	A	A	V	K	S	Q	N	G	A	A	M	S	F	G	R	T	S	T	F	L	D	V	Y	I	E	R	D	L	K	A	G	K	I	T	E	Q	E	A	Q	E	M	V	D	H	L	V	M	K	L	R	M	V	R	F	L	R	T	P	E	Y	D	E	L	F	S	G	D	P	I	W	A	T	E	S	I	G
Template Known Secondary structure														T	T				B	S														T	T	T	S	S																									G	G	G	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		164								.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.																	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.																	.
Query Sequence		P	.	.	.	.	.	.	.	S	D	S	P	I	T	R	A	I	L	R	A	D	A	E	L	.	K	Q	V	S	P	N	L	T	F	I	Y	D	P	E	I	T	P	D	D	L	L	L	E	V	A	K	N	I	C	E	C	S	K	P	H	I	A	N	G	P	V	H	D	K	I	F	T	K	G	G	Y	G	I	V	S
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.																	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																	.															.
Template Conservation																																									.
Template Sequence		G	M	G	L	D	G	R	T	L	V	T	K	N	S	F	R	F	L	N	T	L	Y	T	M	G	P	S	P	E	P	N	M	T	I	L	W	S	E	K	.	L	P	L	N	F	K	K	F	A	A	K	V	S	I	D	T	S	S	L	Q	Y	E	N	D	D	L	M	R	P	D	F	N	N	D	D	Y	A	I	A	C
Template Known Secondary structure			B		T	T	S		B																S				S	S	S								T	T	.	S																															T		S						T
Template Predicted Secondary structure																																									.
Template SS confidence
		1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																											.	.	.	.	.
Query SS confidence											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																											.	.	.	.	.
Query Sequence		C	Y	N	S	L	P	L	A	G	.	G	G	S	T	L	V	R	L	N	L	K	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	R	S	E	S	L	D	.	D	F	F	T	R	T	L	P	H	Y	C	Q	Q	Q	I	A	I	I	D	A	R	C	E	F	L	Y	.	.	.	.	.
Query Conservation											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																											.	.	.	.	.
Alig confidence											.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.			.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.
Template Sequence		C	V	S	P	M	I	V	G	K	Q	M	Q	F	F	G	A	R	A	N	L	A	K	T	M	L	Y	A	I	N	G	G	V	D	E	K	L	K	M	Q	V	G	P	K	S	E	P	I	K	G	D	V	.	.	L	N	Y	D	E	V	M	E	R	M	D	H	F	M	D	W	L	A	K	Q	Y	I	T	A	L	N	I
Template Known Secondary structure		T	S					T	T	T																				T	T	T			T	T	T	T				S								S	S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.
Template SS confidence
		1419	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.			1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.
								292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	340	.		.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	Q	Q	S	H	F	F	E	N	S	F	L	V	K	E	G	L	I	N	P	E	R	F	V	P	M	F	G	M	Y	G	L	A	E	A	V	N	L	L	C	E	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	A	A	R	Y	G	K	.	E	A	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation																							.	.	.	.
Template Sequence		I	H	Y	M	H	D	K	Y	S	Y	E	A	S	L	M	A	L	H	D	R	D	.	.	.	.	V	I	R	T	M	A	C	G	I	A	G	L	S	V	A	A	D	S	L	S	A	I	K	Y	A	K	V	K	P	I	R	D	E	D	G	L	A	I	D	F	E	I	E	G	E	Y	P	Q	F	G	N	N	D	P	R
Template Known Secondary structure																	T	T	S		S	S	.	.	.	.											S														S								T	T	S									S					S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.
Template SS confidence
		1497	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.					.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.										.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	N	E	V	G	Y	R	I	S	A	Q	L	A	E	F	V	A	N	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	Y	G	W	Q	K	R	A	M	L	H	A
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	D	D	L	A	V	D	L	V	E	R	F	M	K	K	I	Q	K	L	H	T	Y	R	D	A	I	P	T	Q	S	V	L	T	I	T	S	N	V	V	Y	G	K
Template Known Secondary structure																		T	T	S			G	G	G							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1573	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.