Job Description P37342 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:55:22 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 435 % Identity 18% Template d1h16a_ SCOP info PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like glycyl radical enzymes PFL-like Resolution 1.53

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		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	R	H	F	L	A	L	E	A	E	N	N	L	P	Y	P	Q	L	P	A	E	A	R	R	A	L	D	E	G	V	I	C	D	M	F	E	G	H	A	P	Y	K	P	R	Y	V	L	P	D	Y	A	R	F	L	A	N	G	S	E	W	L	E	L	E	G	A	K	D	L	D	D	A	L	S	L	L	T	I	L	Y
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	T	I	R	L	R	E	E	I	A	E	Q	H	.	.	.	.	.	.	R	A	L	G	Q	M	K	E	M	A	A	K	Y	G	Y	D	I	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	T	N	A	Q	E	A	I	Q	W	T	Y	F	G	Y
Template Known Secondary structure															.	.	.	.	.	.													T	T				S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.							.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		107	.	.	110	.	.	.	.	.		.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.							.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.														.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query SS confidence											.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Query Sequence		H	H	V	P	S	V	T	S	M	.	P	V	Y	L	G	Q	L	D	A	L	L	Q	P	Y	V	R	I	.	.	.	.	.	.	L	T	Q	D	E	I	D	V	R	I	K	R	F	W	R	Y	L	D	R	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	A	F	M	H	A	N	I	G	P	.	.
Query Conservation											.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Alig confidence											.																		.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	A	V	K	S	Q	N	G	A	A	M	S	F	G	R	T	S	T	F	L	D	V	Y	I	E	R	D	L	K	A	G	K	I	T	E	Q	E	A	Q	E	M	V	D	H	L	V	M	K	L	R	M	V	R	F	L	R	T	P	E	Y	D	E	L	F	S	G	D	P	I	W	A	T	E	S	I	G	G	M	G
Template Known Secondary structure										B	S					B	S															T	T	S	S																	T	T													S		S	S											B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
							165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	S	D	S	P	I	T	R	A	I	L	R	A	D	A	E	L	.	K	Q	V	S	P	N	L	T	F	I	Y	D	P	E	I	T	P	D	D	L	L	L	E	V	A	K	N	I	C	E	C	S	K	P	H	I	A	N	G	P	V	H	D	K	I	F	T	K	G	G	Y	G	I	V	S	C	Y	N
Query Conservation		.	.	.	.	.																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																	.															.
Template Conservation																																						.
Template Sequence		L	D	G	R	T	L	V	T	K	N	S	F	R	F	L	N	T	L	Y	T	M	G	P	S	P	E	P	N	M	T	I	L	W	S	E	K	.	L	P	L	N	F	K	K	F	A	A	K	V	S	I	D	T	S	S	L	Q	Y	E	N	D	D	L	M	R	P	D	F	N	N	D	D	Y	A	I	A	C	C	V	S
Template Known Secondary structure		T	T	S		B																S				S		S								T	T	.	S																															T		S						T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																						.
Template SS confidence
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
		239	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure								.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	P	L	A	G	.	G	G	S	T	L	V	R	L	N	L	K	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	R	S	E	S	L	D	.	D	F	F	T	R	T	L	P	H	Y	C	Q	Q	Q	I	A	I	I	D	A	R	C	E	F	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation								.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.			.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		P	M	I	V	G	K	Q	M	Q	F	F	G	A	R	A	N	L	A	K	T	M	L	Y	A	I	N	G	G	V	D	E	K	L	K	M	Q	V	G	P	K	S	E	P	I	K	G	D	V	.	.	L	N	Y	D	E	V	M	E	R	M	D	H	F	M	D	W	L	A	K	Q	Y	I	T	A	L	N	I	I	H	Y
Template Known Secondary structure					T	T	T																				T	T	T	B		T	T	T			B		S								S	S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.			470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
					292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	340	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Query SS confidence		.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Query Sequence		.	.	.	Q	Q	S	H	F	F	E	N	S	F	L	V	K	E	G	L	I	N	P	E	R	F	V	P	M	F	G	M	Y	G	L	A	E	A	V	N	L	L	C	E	K	E	G	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	Y	G	K	.	E	A	A	A	N	E
Query Conservation		.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Alig confidence		.	.	.																	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Template Conservation																					.	.	.	.
Template Sequence		M	H	D	K	Y	S	Y	E	A	S	L	M	A	L	H	D	R	D	V	.	.	.	.	I	R	T	M	A	C	G	I	A	G	L	S	V	A	A	D	S	L	S	A	I	K	Y	A	K	V	K	P	I	R	D	E	D	G	L	A	I	D	F	E	I	E	G	E	Y	P	Q	F	G	N	N	D	P	R	V	D	D
Template Known Secondary structure							S							T	T	S		S	S		.	.	.	.																								S								T	T	S									S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.
Template SS confidence
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.					.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.										.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	Y	R	I	S	A	Q	L	A	E	F	V	A	N	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	Y	G	W	Q	K	R	A	M	L	H	A	Q	S	G	I	S	S	D	I	G	T	T	P	G	A	R	L	P	Y	G	D	E	P	D	P	I	T	H	L	Q	T	V	A	P	H	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.
Template Sequence		L	A	V	D	L	V	E	R	F	M	K	K	I	Q	K	L	H	T	Y	R	D	A	I	P	T	Q	S	V	L	T	I	T	S	N	V	V	Y	G	K	K	T	G	N	T	P	D	G	R	R	A	G	A	.	.	.	P	F	G	P	G	A	N	P	M	H	G	R	D	Q	K	G	A	V	A	S	L	T	S	V	A
Template Known Secondary structure																T	S			G	G	G										T	T								T					T	T	S			T	T		.	.	.				S	T	T			S	T	T				S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.
Template SS confidence
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.				.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
					412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430						.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.						.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																				.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	H	A	Y	Y	Y	S	G	I	S	D	I	L	T	L	D	E	T	I	K	.	.	.	.	.	R	N	P	Q	A	L	V	Q	L	C	L	G	A	F	K	.	.	.	.	.	A	G	M	R	E	F	T	A	N	V	S	G	N	D	L	V	R	V	T	G	Y	M	V	R	L	S	D	L	E	K	Y	R	A
Query Conservation		.	.	.																				.	.	.	.	.																.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.																.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	P	F	A	Y	A	K	D	G	I	S	Y	T	F	S	I	V	P	N	A	L	G	K	D	D	E	V	R	K	T	N	L	A	G	L	M	D	G	Y	F	H	H	E	A	S	I	E	G	G	Q	H	L	N	V	N	V	M	N	R	E	M	L	L	.	.	.	.	.	D	A	M	E	N	P	E	K	Y	P	Q
Template Known Secondary structure		T	S		G	G	G		T	T															S	S																			B	T	T	B																		.	.	.	.	.						G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		653	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.						.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	S	R	T	N	T	T	W	L	G	E	E	A	A	R	N	T	R	I	L	E	R	Q	P	R	V	I	S	H	E	Q	Q	M
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.
Template Sequence		L	T	I	R	.	.	.	.	V	S	G	Y	A	V	R	F	N	S	L	T	K	E	Q	Q	Q	D	V	I	T	R	T	F	T	Q
Template Known Secondary structure						.	.	.	.		S	S	S				G	G	G	S										T	S			B
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.
Template SS confidence
		728	.	730	.					.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.