Job Description P37342 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:55:22 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 457 % Identity 18% Template c1hk8A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:anaerobic ribonucleotide-triphosphate reductase; PDBTitle: structural basis for allosteric substrate specificity2 regulation in class iii ribonucleotide reductases:3 nrdd in complex with dgtp Resolution 2.45 Å

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		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.			70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.			.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.																		.	.
Query SS confidence																																																				.	.																		.	.
Query Sequence		P	V	L	S	P	E	Q	K	R	H	F	L	A	L	E	A	E	N	N	L	P	Y	P	Q	L	P	A	E	A	R	R	A	L	D	E	G	V	I	C	D	M	F	E	G	H	A	P	Y	K	P	.	.	R	Y	V	L	P	D	Y	A	R	F	L	A	N	G	S	E	W	.	.	L	E	L	E	G	A	K	D	L
Query Conservation																																																				.	.																		.	.
Alig confidence																																																				.	.																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	S	R	V	F	P	T	Q	R	D	L	M	A	G	I	V	S	K	H	I	A	K	N	M	V	P	S	F	I	M	K	A	H	E	S	G	I	I	H	V	H	D	I	D	Y	S	P	A	L	P	F	T	N	C	C	L	V	D	L	K	G	M	L	E	N	G	F	K	L	G	N	A	Q	I	E	T	P	K	S	I
Template Known Secondary structure				S	S																					S											T	S				T	T	T	T	T	T	T	T	S																S					T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	A	L	S	L	L	T	I	L	Y	H	H	V	P	S	V	T	S	M	P	V	Y	L	G	Q	L	D	A	L	L	Q	P	Y	V	R	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Q	D	E	I	D	V	R	I	K	R	F	W	R	Y	L	D	R	T
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	A	T	A	I	M	A	Q	I	T	A	Q	V	A	S	H	Q	Y	G	G	T	T	F	A	N	V	D	K	V	L	S	P	Y	V	K	R	T	Y	A	K	H	I	E	D	A	E	K	W	Q	I	A	D	A	L	N	Y	A	Q	S	K	T	E	K	D	V	Y	D	A	F	Q	A	Y	E	Y	E	V	N	T	L
Template Known Secondary structure																	T	T	S	S	S					T	T																							T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		153	.	.	.					.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.											.	.	.	.	.	.	.	190	.							.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	D	A	.	.	.	.	F	M	H	A	N	I	G	P	S	D	S	P	I	T	R	A	I	L	R	A	D	A	E	L	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	P	N	L	T	F	I	Y	.	.	.	.	.	.	D	P	E	I	T	P	D	D	L	L	L	E	V	A	K	N	I	C	E	C	S
Query Conservation						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	S	S	N	G	Q	T	P	F	V	T	I	T	F	G	T	G	T	D	W	T	E	R	M	I	Q	K	A	I	L	K	N	R	I	K	G	L	G	R	D	G	I	T	P	I	F	P	K	L	V	M	F	V	E	E	G	V	N	L	Y	K	D	D	P	N	Y	D	I	K	Q	L	A	L	E	C	A	S	K	R	M
Template Known Secondary structure				T	T	S	S													S																		B	T	T	T	T	B			S		S								T	T	T	T	S	S	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240												.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.					.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Query SS confidence																.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Query Sequence		K	P	H	I	A	N	G	P	V	H	D	K	I	F	.	T	K	G	G	Y	G	I	V	S	C	Y	N	S	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	A	G	G	G	S	T	L	V	R	L	N	L	K	A	I	A	E	R	S	.	.	.	.	E	S	L	D	D	F	F	T	R	T	L	P	H	Y	C
Query Conservation																.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Alig confidence																.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	P	D	I	I	S	A	K	N	N	K	A	I	T	G	S	S	V	P	V	S	P	M	G	C	R	S	F	L	S	V	W	K	D	S	T	G	N	E	I	L	D	G	R	N	N	L	G	V	V	T	L	N	L	P	R	I	A	L	D	S	Y	I	G	T	Q	F	N	E	Q	K	F	V	E	L	F	N	E	R	M
Template Known Secondary structure																T		S	S					B	T	T	T	B						B		T	T	S		B			T	T		B															T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.															.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	Q	I	A	I	I	D	A	R	C	E	F	L	Y	Q	Q	S	H	F	F	E	N	S	F	L	V	K	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	N	P	E	R	F	V	P	M	F	G	M	Y	G	L	A	E	A	V	N	L	L	C	E	K	E	G	I	A	A	R	Y	G	K	E
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.																																																			.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	C	F	E	A	L	M	C	R	I	S	S	L	.	K	G	V	K	A	T	V	A	P	I	L	Y	Q	E	G	A	F	G	V	R	L	K	P	D	D	D	I	I	E	L	F	K	N	G	R	S	S	V	S	L	G	Y	I	G	I	H	E	L	N	I	.	L	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T	.	T	T		B	G	G	G						T	S	S	T	T	S	S				T	T	S	B	T					T	T	T	T	S															.			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																																																			.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.		410	.	.
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	A	N	E	V	G	Y	R	I	S	A	Q	L	A	E	F	V	A	N	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	Y	G	W	Q	K	R	A	M	L	H	A	Q	S	G	I	S	S	D	I	G	T	T	P	G	A	R	L	P	Y	G	D	E	P	D	P	I	T	H
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	R	D	I	G	R	E	I	L	T	K	M	N	A	H	L	K	Q	W	T	E	R	T	G	F	A	F	S	L	Y	S	T	P	A	E	N	L	C	Y	R	F	C	K	L	D	T	E	K	Y	G	S	V	K	D	V	T	D	K	G	W	Y	T	N	S	F	H	V	S	V	E	E	N	I	T	P	F	E	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	S																						S											T	T																	T	T	T	T	T	T	S					T	T				T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Q	T	V	A	P	H	H	A	Y	Y	Y	S	G	I	S	D	I	L	T	L	D	E	T	I	K	R	N	P	Q	A	L	V	Q	L	C	L	G	A	F	K	A	G	M	R	E	F	T	A	N	V	S	G	N	D	L	V	R	V	T	G	Y	M	V	R	L	S	D	L	E	K	Y	R	A	E	G	S	R	T	N
Query Conservation
Alig confidence																							.																				.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Conservation																							.																				.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template Sequence		I	S	R	E	A	P	Y	H	F	I	A	T	G	G	H	I	S	Y	V	E	L	.	P	D	M	K	N	N	L	K	G	L	E	A	V	W	D	Y	A	A	Q	.	H	L	D	Y	F	G	V	N	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	K	C	F	T	C	G	S	T	H	E	M	T	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T		T	T	B								.				T	T															.			S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T				S				.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.																				.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510		.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.												540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	T	W	L	G	E	E	A	A	R	N	T	R	I	L	E	R	Q	P	R	V	I	S	H
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	T	E	N	G	F	V	C	S	I	C	G	E	T	D	P	K	K	M	N	T	I	R	R
Template Known Secondary structure				S	S	S				S	S	S					G	G	G					B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.