Job Description P77713 Confidence 99.73% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 35 Aligned Residues 426 % Identity 14% Template c3ugfB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:sucrose:(sucrose/fructan) 6-fructosyltransferase; PDBTitle: crystal structure of a 6-sst/6-sft from pachysandra terminalis Resolution 1.70 Å

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		10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.									40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure									.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	N	P	D	P	S	.	L	C	R	Q	G	E	D	Y	Y	I	A	T	S	T	F	E	W	F	P	G	V	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	L	D	M	K	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P	C	L	S	Y	A
Query Conservation									.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.												.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	W	M	S	D	P	D	G	P	I	F	Y	K	G	W	Y	H	F	F	.	.	.	Y	Q	Y	N	P	D	N	P	V	W	G	N	N	T	W	G	H	T	V	S	R	D	L	I	H	W	L	Y	L	P	L	A	L	A	A	D	Q	W	Y	D	M	.	.	.	.	.	.	Q	G	V	F	S	G	S	A	T	C	L
Template Known Secondary structure														T	T						.	.	.					S	S		S	S	S		S									S	S	S	S	S										S		S	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.				.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.							.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
			81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.					.	.	.	.	.			.	120	.									.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																		.	.	.	.						.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																																		.	.	.	.						.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	G	K	F	W	L	L	Y	T	D	V	K	I	V	D	S	P	W	K	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	.	.	.	.	P	W	S	E	P	.	.	I	P	M	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	G	G	F	D	P	S	L	F	H	D	D	D	G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W
Query Conservation		.																																		.	.	.	.						.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.															.	.	.	.																.	.	.	.						.	.				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.
Template Sequence		P	D	G	R	I	M	M	L	Y	T	G	V	T	K	E	.	.	.	.	M	V	E	M	L	S	L	A	Y	P	A	D	L	S	D	P	L	L	V	E	W	V	K	Y	P	G	N	P	I	L	S	A	P	P	G	V	S	P	T	E	F	R	D	A	S	T	G	W	Y	V	S	N	G	T	W	R	I	A	I	G	A
Template Known Secondary structure		T	T	S											T	T	.	.	.	.											S		T	T		T	T								T	T				B				T	T	S		T	T	S				B							S	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.					.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.															.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	P	R	H	H	S	N	P	H	N	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y	T	E	G	A	H	L	Y	R	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	Y	Y	L	M	A	A	E	G	G	T	S	Y	E	H	A
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																								.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.																								.	.
Template Sequence		K	Y	.	.	.	N	T	T	G	I	A	M	V	Y	E	T	K	D	F	K	S	F	K	L	L	E	E	L	.	.	L	H	A	V	P	D	T	G	L	W	E	C	V	D	L	Y	P	V	S	T	T	G	E	K	G	L	E	T	S	V	N	G	P	K	V	K	H	V	L	K	A	S	I	D	E	Q	Q	R	D	Y
Template Known Secondary structure				.	.	.	T	T										S	S	S	S	S					S	S		.	.	S				T	T														S	S	S	S					T	T			S	T	T										T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.																								.	.
Template SS confidence
		176	.				.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200			.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	V	L	R	S	K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M	T	S	W	H	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H	G	S	L	L	Q	T	H	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L	T	S	R	P	L	R	L	P	G	V	P	L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T
Query Conservation
Alig confidence																																	.																																			.	.
Template Conservation																																	.																																			.	.
Template Sequence		Y	A	I	G	T	Y	D	L	G	T	N	K	W	T	P	D	N	P	E	E	D	V	G	I	G	L	R	Y	D	W	G	.	K	Y	Y	A	S	K	T	F	Y	D	P	K	K	Q	R	R	V	V	W	A	W	T	K	E	L	D	S	E	V	A	D	R	E	K	.	.	G	W	A	N	V	Q	T	I	P	R	T	V
Template Known Secondary structure									T	T	T	T					S		G	G	G		T	T	S	S		B	S		S	S	.	S										T	T	T	T												S									.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																	.																																			.	.
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.		.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.			.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
		292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	A	R	I	E	W	R	D	G	W	P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L	T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E	L	Q	T	L	R	I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	K	T	G	T	N	V	L	L	W	P	V	E
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T	S	S	S							G
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		328	.																																																																	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.														.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400														.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	N	S	T	F	T	Q	S	T	V	A	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	Q	H	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	H	F	Q	Q	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S	K	N	W	S	Y	C	F	V	D
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	E	S	L	R	L	S	S	K	E	F	S	K	V	K	A	G	A	G	S	V	V	P	L	D	V	G	T	A	T	Q	L	D	I	I	A	E	F	E	I	D	K	E	G	Y	N	C	T	T	S	G	G	A	A	E	R	G	V	L	G	P	F	G	L	L	V	S	A	T	E	N	L	S	E	Q	T	P	V	Y
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G														T	T								S			S																	G	G	G	S		G	G	G	S		B	T	T	B										T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
		426	.	.	.	430	.									.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	E	G	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	I	K	V	I	Q	L	D	H	N	V	P	S	W	P	L	H	E	Q	P	I	P	V	P	E	H	A	E	S	V	W	L	R	V	D	V	D	T	L	V	Y	R	Y	S	Y	S	F	D	G	E	T	W	H	T	V	P	V	T	Y	E	A	W	K	L	S
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.																																													.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Y	I	A	K	G	T	D	G	N	F	K	T	F	F	C	L	D	E	S	R	S	S	K	A	S	D	V	S	K	Q	V	K	G	F	T	V	P	V	L	D	G	E	K	F	T	M	R	L	L	V	D	H	S	I	V	E	S	.	F	A	Q	G	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	C	I	T
Template Known Secondary structure								T	T	S	S										T	T	S		S		S	S	S													T	T											T	T					.			T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																												.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.		.	.	.	.	.	.												.	.	500	.
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	D	Y	I	G	G	R	G	F	F	T	G	A	F	V	G	L	H	C	E	D	I	S	G	D	G	C	Y	A	D	F	D	Y	F	T	Y	E	P	V
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.
Template Sequence		S	R	V	Y	P	T	E	A	I	Y	G	A	A	K	L	F	L	F	N	N	A	.	.	.	.	T	G	A	S	I	T	A	S	L	K	I	W	E	M
Template Known Secondary structure							S	S	S		G	G	G										.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.
Template SS confidence
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.					.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.