Job Description P77713 Confidence 99.88% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 416 % Identity 15% Template c3pijA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-fructofuranosidase; PDBTitle: beta-fructofuranosidase from bifidobacterium longum - complex with2 fructose Resolution 1.80 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.									40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure									.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	N	P	D	P	S	.	L	C	R	Q	G	E	D	Y	Y	I	A	T	S	T	F	E	W	F	P	G	V	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	L	D	M	K	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P	C	L	S	Y	A
Query Conservation									.																								.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.												.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	W	I	N	D	P	N	G	L	C	F	Y	K	G	R	W	H	V	F	.	.	.	Y	Q	L	H	P	Y	G	T	Q	W	G	P	M	H	W	G	H	V	S	S	T	D	M	L	N	W	K	R	E	P	I	M	F	A	P	S	L	E	Q	E	K	.	.	.	.	.	.	D	G	V	F	S	G	S	A	V	I	D
Template Known Secondary structure														T	T						.	.	.					T	T		S	S	S		S	B								S	S	S	S	S								B				B	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.																																										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.							110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
			81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.					.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.										.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.												.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.												.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	G	K	F	W	L	L	Y	T	D	V	.	.	.	.	K	I	V	D	S	P	W	K	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	P	W	S	E	P	I	P	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	G	G	F	D	P	S	L	F	H	D	D	D	G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W	G
Query Conservation		.												.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.												.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		D	N	G	D	L	R	F	Y	Y	T	G	H	R	W	A	N	G	H	D	N	T	G	G	D	W	Q	V	Q	M	T	A	L	P	D	N	D	E	L	T	S	A	T	K	Q	G	M	I	I	D	C	P	T	D	K	V	D	H	H	Y	R	D	P	K	V	W	K	T	.	G	D	T	W	Y	M	T	F	G	V	S	S
Template Known Secondary structure		T	T	S												T	T	S	S	S	G	G	G												S	S	T	T		S													G	G	G														.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.		.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.						.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210								.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	R	H	H	S	N	P	H	N	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y	T	E	G	A	H	L	Y	R	H	A	G	.	.	.	.	.	W	Y	Y	L	M	A	A	E	G	G	T	S	Y	E	H	.	.	.	.	.	.	.	A	V	V	V
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.																						.																							.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.																						.
Template Sequence		A	D	.	.	.	K	R	G	Q	M	W	L	F	S	S	K	D	M	V	R	W	E	Y	E	R	V	.	L	F	Q	H	P	D	P	D	V	F	M	L	E	C	P	D	F	S	P	I	K	D	K	D	G	N	E	K	W	V	I	G	F	S	A	M	G	S	K	P	S	G	F	M	N	R	N	V	S	N	A	G	Y
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	S										S	S	S	S	S							.					S		T	T															T	T	S												S				B	T	T	B	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.																						.
Template SS confidence
		200	.				.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.		.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	R	S	K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M	T	S	W	H	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H	G	S	L	L	Q	T	H	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L	T	S	R	P	L	R	L	P	G	V	P	L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T	G	I	A
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		M	I	G	T	W	E	P	G	G	E	F	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	E	F	R	L	W	D	C	G	H	N	Y	Y	A	P	Q	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	D	G	R	Q	I	V	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S					S			S	S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T					.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	310	.	.	.	.	.
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	E	W	R	D	G	W	P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L	T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E	L	Q	T	L	R	I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D	S	L	N
Query Conservation
Alig confidence		.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation		.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Sequence		.	Y	G	W	M	S	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	P	I	P	M	E	D	D	G	W	C	G	Q	L	T	L	P	R	E	I	T	L	G	D	.	D	G	D	V	V	T	A	P	V	A	E	M	E
Template Known Secondary structure		.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S			G	G	G	G	G	T															T	.	T	S	S							G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template SS confidence
			316	.	.	.	320	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.		.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		375	.	.	.	.	380													.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	T	F	T	Q	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	A	R	R	W	Q	H	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	F	S	P	V	H	F	Q	Q	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S	K	N	W	S	Y	C	F	V	D	Y	E	E	G	Q	G	R	T	I	K	V	I	Q	L	D	H	N
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.													.
Template Conservation																																													.													.
Template Sequence		G	L	R	E	D	T	L	D	H	G	S	V	T	L	D	M	D	G	E	Q	I	I	A	D	D	A	E	A	V	E	I	E	M	T	I	D	L	A	A	S	T	A	E	.	R	A	G	L	K	I	H	A	T	E	D	G	.	A	Y	T	Y	V	A	Y	D	G	Q	I	G	R	V	V	V	D	R	Q	A	M	A	N
Template Known Secondary structure		G	G	B	S												S	S							S			S	S									T	T	T				S	.										T	T	S	.									T	T	T	T							T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																													.													.
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.		.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	S	W	P	L	H	E	Q	P	I	P	V	P	E	H	A	E	S	V	W	L	R	V	D	V	D	T	L	V	Y	R	Y	S	Y	S	F	D	G	E	T	W	H	T	V	P	V	T	Y	E	A	W	K	L	S	D	D	Y	I	G	G	R	G	F	F	T	G	A	F	V	G	L	H	C	E	D	I	S	G	D
Query Conservation
Alig confidence																																			.												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	R	G	Y	R	A	A	P	L	T	D	A	E	L	A	S	G	K	L	D	L	R	V	F	V	D	R	G	S	V	E	V	.	Y	V	N	G	G	H	Q	V	L	S	S	.	.	.	.	.	.	Y	S	Y	A	S	E	G	P	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	I	K	L	V	A	E	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S																	S										S	S					.			T	T	T	T						.	.	.	.	.	.						S	S				.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.		.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.							.	.	.	.	.	.	.	490	.	.									.	.	.	.	.	.
		523	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	C	Y	A	D	F	D	Y	F	T	Y	E	P	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	G	S	L	K	V	D	S	L	K	L	H	H	M
Template Known Secondary structure		S	S												B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		499	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.