Job Description P77713 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 362 % Identity 23% Template c3lv4B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:glycoside hydrolase yxia; PDBTitle: crystal structure of the glycoside hydrolase, family 43 yxia2 protein from bacillus licheniformis. northeast structural3 genomics consortium target bir14. Resolution 1.70 Å

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		6	.	.		.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.										.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	I	L	.	T	G	F	N	P	D	P	S	L	C	R	Q	G	E	D	Y	Y	I	A	T	S	T	F	E	W	F	P	G	V	R	I	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	L	D	M	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P
Query Conservation					.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.																						.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	V	F	S	E	V	T	V	H	D	P	S	I	I	K	A	N	G	T	Y	Y	V	F	G	S	.	.	.	.	.	.	H	L	A	S	A	K	S	T	D	L	X	N	W	T	Q	I	S	S	S	V	H	D	G	N	P	L	I	P	N	V	Y	E	E	L	K	E	T	F	E	W	A	E	S	D	T	L	W	A	P
Template Known Secondary structure					B					S	S							T	T							G	.	.	.	.	.	.	G	G						S	S	S	S	B							S			T	T		T	T	S	T	T					T								T		S	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		33	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.							.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		76	.	.	.	80		.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	L	S	Y	A	.	D	G	K	F	W	L	L	Y	T	D	V	K	I	V	D	S	P	W	K	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	P	W	S	E	P	I	P	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	G	G	F	D	P	S	L	F	H	D	D	D
Query Conservation							.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																						.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.
Template Sequence		D	V	T	Q	L	E	D	G	K	F	Y	X	Y	Y	N	A	C	R	G	D	S	P	R	S	A	L	G	.	.	.	L	A	V	A	D	D	I	E	G	P	Y	K	N	K	G	I	F	L	K	S	G	X	D	G	I	S	N	D	G	T	P	Y	D	A	T	K	H	P	N	V	V	D	P	H	T	F	F	D	Q	N
Template Known Secondary structure							T	T	S											S	S	S							.	.	.					S	S	T	T													S		S	S	B		T	T	S	S	B			T	T	T	S			S									T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.				.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.			.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.			.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.																		.	.																			.	.
Query SS confidence																																									.	.																		.	.																			.	.
Query Sequence		G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W	G	P	R	H	H	S	N	P	H	N	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	.	.	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y	T	E	G	A	H	L	Y	.	.	R	H	A	G	W	Y	Y	L	M	A	A	E	G	G	T	S	Y	E	.	.
Query Conservation																																									.	.																		.	.																			.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.																		.	.																			.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	K	L	W	X	V	Y	G	S	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	I	F	I	L	E	X	D	K	K	T	G	F	P	L	P	G	Q	G	Y	G	K	K	L	I	G	G	N	H	S	R	I	E	G	A	Y	I	L	Y	H	P	E	T	Q	Y	Y	Y	L	Y	X	S	F	G	G	L	A	A	D	G	G
Template Known Secondary structure		S								B	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T									T	T	T		S	B		T	T		T	T								T	T		S										T	T	T	T									S	B	S	S	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.									.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.		.	.	.	.	260	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		H	A	V	V	V	L	R	S	K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M	T	S	W	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H	G	S	L	L	Q	T	H	.	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		Y	N	I	R	V	A	R	S	K	N	P	D	G	P	Y	Y	D	A	E	G	H	A	X	I	D	V	R	G	K	E	G	T	L	F	D	D	R	S	I	E	P	Y	G	V	K	L	X	G	N	F	S	F	N	N	K	N	G	Y	V	S	P	G	H	N	S	A	F	Y	D	E	K	S	G	K	S	Y	L	I	F	H
Template Known Secondary structure										S	S	T	T				B		T	T			B	G	G	G					T	T		S	S						T	T	S	S						S				T	T																T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.		.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		T	S	R	P	L	R	L	P	G	V	P	L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T	G	I	A	R	I	E	W	.	R	D	G	W	P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L	T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E
Query Conservation																																				.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	F	P	G	R	G	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	V	R	V	H	Q	L	L	X	N	K	Q	G	W	P	V	V	A	P	H	R	Y	A	G	E	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	V	K	K	S	D	V	I	G	D
Template Known Secondary structure					T	T	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	S						S	S			S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		336	.	.	.	340	.	.	.	.																.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.								.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Q	T	L	R	I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D	S	L	N	S	.	.	.	.	.	.	.	T	F	T	Q	S	T	V	A	R	R	W	Q	H	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	F	S	P	V	H	F	Q	Q	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		Y	E	L	V	R	H	G	K	D	I	S	.	.	A	D	I	K	E	S	K	E	I	R	L	N	Q	N	G	K	I	T	G	A	V	A	G	T	W	K	N	T	G	H	N	K	I	E	L	K	I	D	G	K	T	Y	D	G	V	F	L	R	Q	W	D	A	A	S	E	R	K	V	X	T	F	S	A	L	S	R	E
Template Known Secondary structure									S	S			.	.													T	T	S					S	S								T	T	T							T	T													T	T	T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.			.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		417	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	D
Template Known Secondary structure		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		462	.