Job Description P77713 Confidence 99.57% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 38 Aligned Residues 467 % Identity 15% Template c3lemA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:fructosyltransferase; PDBTitle: crystal structure of fructosyltransferase (d191a) from a. japonicus in2 complex with nystose Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		10	.	.	.	.	.	.		.	.	.			20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.		.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.			.	.
Predicted Secondary structure									.				.	.																	.																																															.	.
Query SS confidence									.				.	.																	.																																															.	.
Query Sequence		G	F	N	P	D	P	S	.	L	C	R	.	.	Q	G	E	D	Y	Y	I	A	T	S	T	F	E	W	F	P	.	G	V	R	I	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	L	D	M	K	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P	C	L	S	Y	A	D	.	.	G	K
Query Conservation									.				.	.																	.																																															.	.
Alig confidence									.				.	.									.	.	.						.																			.	.																											.	.
Template Conservation																							.	.	.																									.	.
Template Sequence		G	Q	I	G	D	P	C	A	H	Y	T	D	P	S	T	G	L	F	H	V	G	.	.	.	F	L	H	D	G	D	G	I	A	G	A	T	T	A	N	L	A	T	Y	T	D	T	S	D	.	.	N	G	S	F	L	I	Q	P	G	G	K	N	D	P	V	A	V	F	D	G	A	V	I	P	V	G	V	N	N	T
Template Known Secondary structure														T	T	T							.	.	.				T	T	S								S	S	S	S					S	S	S	.	.	T	T						S		S	S	S		S	S									S	S		G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.																									.	.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.				.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100			.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.							100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.					.	.	120								.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	W	L	L	Y	T	D	V	K	I	V	D	S	P	W	K	.	.	.	.	.	.	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	P	W	S	E	.	.	.	.	P	I	P	.	.	.	.	.	.	.	M	G	N	G	G	F	D	P	S	L	F	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	T	L	L	Y	T	S	V	S	F	L	P	I	H	W	S	I	P	Y	T	R	G	S	E	T	Q	S	L	A	V	A	R	D	G	G	R	R	F	D	K	L	D	Q	G	P	V	I	A	D	H	P	F	A	V	D	V	T	A	F	R	A	P	F	V	F	R	S	A	R	L	D	V	L	L	S	L	D	E	E	V
Template Known Secondary structure											S					T	T	S				T	T	S										G	G	G	T						S	S			S	B		S	S	S	T	T																							S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
																	133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.														150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	D	G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W	G	P	R	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	S	N	P	H	N	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	N	E	T	A	V	Q	Q	A	V	D	G	W	T	E	K	N	A	P	W	Y	V	A	V	S	G	G	V	H	G	V	G	P	A	Q	F	L	Y	R	Q	N	G	G	N	A	S	E	F	Q	Y	W	E	Y	L	G	E	W	W	Q	E	A	T	N	S	S	W	G	D	E	G	T	W	A	G	R	W	G	F	N
Template Known Secondary structure		T	S	S									T	T			G	G	G												T	T	T										G	G	G		T	T			S													T	T			S	S	S	S			S	S					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.									.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.									.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	E	G	A	H	L	Y	R	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	Y	Y	L	M	A	A	E	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	Y	E	H	A	V	V	V	L	R	S	K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M	T	S	W	H	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	T	G	N	V	L	F	L	T	E	E	G	H	D	P	Q	T	G	E	V	F	V	T	L	G	T	E	G	S	G	L	P	I	V	P	Q	V	S	S	I	H	D	M	L	W	A	A	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	V	G	S	E	Q	E	G	A	K	V	E	F	S	P	S	M
Template Known Secondary structure												S	S	S	B		T	T	T	S													S	S			T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340													.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		249	250	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.			.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Query Sequence		G	S	L	L	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L	T	S	R	P	L	R	L	.	.	P	G	V	P	L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T	G	I	A	R	I	E	W	R	D	G	W
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	F	L	D	W	G	F	S	A	Y	A	A	A	G	K	V	L	P	A	S	S	A	V	S	K	T	S	G	V	E	V	D	R	Y	V	S	F	V	W	L	T	G	D	Q	Y	E	Q	A	D	G	F	P	T	A	Q	Q	G	W	T	G	S	L	L	L	P	R	E	L	K	V	Q	T	V	E	N	V	V	D	N
Template Known Secondary structure									T	T											T	T	S							T			S											S	S	T	T	T	T		S	S																													S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
		303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L	T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E	L	Q	T	L	R	I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D	S	L	N	S	T	F	T	Q	S	T	V
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Sequence		E	L	V	R	E	E	G	V	S	W	V	V	G	E	S	D	N	Q	T	A	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	L	G	I	T	I	A	R	E	T	K	A	A	L	L	A	N	G	S	V	T	A	E	E	D	R	T	L	Q	T	A	.	A	V	V	P	F
Template Known Secondary structure							S	S		S								S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																T	S	S													S		.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.		.	.	.	.	.
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	R	R	W	Q	H	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	F	S	P	V	H	F	Q	Q	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S	K	N	W	S	Y	C	F	V	D	Y	E	E	G	Q	G	R	T	I	K	V	I	Q	L	D	H	N	V	P	S	W	P	L	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	Q	S	P	S	S	K	F	F	V	L	T	A	Q	L	E	F	P	A	S	A	R	S	S	P	L	Q	S	G	F	E	I	L	A	S	E	L	E	R	T	A	I	Y	Y	Q	F	S	N	E	S	L	V	V	D	R	S	Q	T	S	A	A	A	P	T	N	P	G	L	D	S	F	T	E	S	G	K	L	R	L	F
Template Known Secondary structure		S	S			S	S	S												G	G	G	S	S	S											S	S	S									T	T	T	T							T	T	T		T	T	T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	P	I	P	V	P	E	H	A	E	S	V	W	L	R	V	D	V	D	T	L	V	Y	R	Y	S	Y	S	F	D	G	E	T	W	H	T	V	P	V	T	Y	E	A	W	K	L	S	D	D	Y	I	G	G	R	G	F	F	T	G	A	F	V	G	L	H	C	E	D	I	S	G	D	G	C	Y	A	D	F	D
Query Conservation
Alig confidence																															.									.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template Conservation																															.									.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template Sequence		D	V	I	E	N	G	Q	E	Q	V	E	T	L	D	L	T	V	V	V	D	N	A	V	V	E	V	Y	A	N	.	G	R	F	A	L	S	T	W	.	.	.	.	.	.	A	R	S	W	Y	D	N	S	T	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	F	F	H	N	G	.	.	.	.	E	G	E	V	Q	F	R
Template Known Secondary structure					S	S	S	S														T	T							T	.	T	T							.	.	.	.	.	.						T	T				.	.	.	.	.	.	.	.							S	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																															.									.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Template SS confidence
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.		.	.	.	610	.	.	.	.							.	.	.	.	.	620	.	.	.	.									.	.	.	.	.	630	.					.	.	.	.	.	.	.
		530	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	F	T	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	V	S	V
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		639	640	.	.