Job Description P77713 Confidence 99.84% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 31 Aligned Residues 443 % Identity 12% Template c3kf5A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:invertase; PDBTitle: structure of invertase from schwanniomyces occidentalis Resolution 2.90 Å

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		10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.			.	.	.	.	.					.	30	.	.	.	.	.			.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure									.								.	.						.	.	.	.								.	.
Query SS confidence									.								.	.						.	.	.	.								.	.
Query Sequence		G	F	N	P	D	P	S	.	L	C	R	Q	G	E	D	.	.	Y	Y	I	A	T	.	.	.	.	S	T	F	E	W	F	P	.	.	G	V	R	I	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	L	D	M	K	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P	C	L	S	Y	A
Query Conservation									.								.	.						.	.	.	.								.	.
Alig confidence									.								.	.						.	.	.	.								.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	W	M	N	D	P	N	G	L	F	Y	D	K	T	A	K	L	W	H	L	Y	F	Q	Y	N	P	N	A	T	A	W	G	Q	P	L	Y	W	G	H	A	T	S	N	D	L	V	H	W	D	E	H	E	I	A	I	G	P	E	H	.	.	.	.	.	.	.	.	D	N	E	G	I	F	S	G	S	I	V	V	D
Template Known Secondary structure														T	T	T	T										S	S	S	S	S			S	S									S	S	S	S	S					S		S	B			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.									.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.										.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.							.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	G	K	F	W	L	L	Y	T	D	V	K	I	V	D	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	K	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	P	W	S	E	P	I	P	M	G	.	.	.	.	.	.	N	G	G	F	D	P	S	L	F	H	D	D	D	G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	N	N	T	S	G	F	F	N	S	S	I	D	P	N	Q	R	I	V	A	I	Y	T	N	N	I	P	D	N	Q	T	Q	D	I	A	F	S	L	D	G	G	Y	T	F	T	K	Y	E	N	N	P	V	I	D	V	S	S	N	Q	F	R	D	P	K	V	F	W	H	E	D	S	N	Q	W	I	M	V	V	S	K
Template Known Secondary structure		T	T		S	S					S		S		T	T	S											T	T										S	S	S	S	S	S					T	T			S						S	S										T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.							.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.			210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.																	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.																	.	.
Query Sequence		G	P	R	H	H	S	N	P	H	N	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y	T	E	G	A	H	L	Y	R	H	.	.	.	.	.	.	A	G	W	Y	Y	L	M	A	A	E	G	G	T	S	Y	E	.	.	H	A	V	V	V	L	R	S
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.																	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.																			.	.	.																				.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.																			.	.	.
Template Sequence		S	Q	E	.	.	.	.	.	Y	K	I	Q	I	F	G	S	A	N	L	K	N	W	V	L	N	S	.	.	.	N	F	S	S	G	Y	Y	G	N	Q	Y	E	C	P	G	L	I	E	V	P	I	E	N	S	D	K	S	K	W	V	M	F	L	A	I	N	P	G	S	P	L	G	G	S	I	N	Q	Y	F	V	G
Template Known Secondary structure		G	G	G	.	.	.	.	.	T								S	S	S	S	S						.	.	.					S			S	S												B	S	S	S	S												S			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.																			.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200						.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M	T	S	W	H	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H	G	S	L	L	Q	T	H	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L	T	S	R	P	L	R	L	P	G	V	P	L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T	G	I	A	R	I	E
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.																											.	.																		.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.																											.	.																		.
Template Sequence		D	F	D	G	F	Q	F	V	P	D	D	S	Q	T	R	F	V	D	I	G	K	D	F	Y	A	F	Q	T	.	.	.	.	.	.	F	S	E	V	E	H	G	V	L	G	L	A	W	A	S	N	W	Q	Y	A	D	Q	V	P	T	N	.	.	P	W	R	S	S	T	S	L	A	R	N	Y	T	L	R	Y	V	.
Template Known Secondary structure					S	S					S							S	B		S	S	S							.	.	.	.	.	.		B	S		S	S	S								S		T	T	T	T	T	T	S	S		S	.	.	S					B												.
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.																											.	.																		.
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.							.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.			.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	R	D	G	W	P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L	T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E	L	Q	T	L	R	I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D	S	L	N	S	T	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	N	A	E	T	K	Q	L	T	L	I	Q	N	P	V	L	P	D	S	.	.	.	I	N	V	V	D	K	L	K	K	K	N	V	K	L	T	.	.	N	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	S														S		.	.	.	S															.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.																.	.
Template SS confidence
																																								341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360				.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.						.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.									.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	S	T	V	A	R	R	W	Q	H	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	.	.	.	.	.	F	S	P	V	H	F	Q	Q	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S	K	N	W	S	Y	C	F	V	D	Y	E	E	G	Q	G	R	T	I	K	V	I	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	L	D	H	N	V	P
Query Conservation																							.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	P	I	K	T	N	F	K	G	S	T	G	L	F	D	F	N	I	T	F	K	V	L	N	L	N	V	S	P	G	K	T	H	F	D	I	L	I	N	S	Q	E	L	N	S	S	V	D	S	I	K	I	G	F	D	S	S	Q	S	S	F	Y	I	D	R	H	I	P	N	V	E	F	P	R	K	Q	F	F	T	D
Template Known Secondary structure		S							S	S			S																	S		T	T	S										T	T	S											T	T	T	T									T	T				T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	W	P	L	H	E	Q	P	I	P	V	P	E	H	A	E	S	V	W	L	R	V	D	V	D	T	L	V	Y	R	Y	S	Y	S	F	D	G	E	T	W	H	T	V	P	V	T	Y	E	A	W	K	L	S	D	D	Y	I	G	G	R	G	F	F	T	G	A	F	V	G	L	H	C	E	D	I	S	G	D	G	C
Query Conservation
Alig confidence																																	.												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.								.	.	.
Template Conservation																																	.												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.								.	.	.
Template Sequence		K	L	A	A	Y	L	E	P	L	D	Y	D	Q	D	L	R	V	F	S	L	Y	G	I	V	D	K	N	I	I	E	L	.	Y	F	N	D	G	T	V	A	M	T	N	.	.	.	.	.	.	T	F	F	M	G	E	G	K	Y	P	.	.	.	.	.	.	H	D	I	Q	I	V	T	.	.	.	D	T	E	E	P
Template Known Secondary structure						B				S	B		S	S	S	S											S	S					.			T	T	T	T						.	.	.	.	.	.					S	T	T				.	.	.	.	.	.								.	.	.			S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.								.	.	.
Template SS confidence
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.		.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.							500	.	.	.	.	.	.	.	.	.							510	.	.	.	.	.	.				.	.	.	520	.
		525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	A	D	F	D	Y	F	T	Y	E	P	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	F	E	L	E	S	V	I	I	R	E	L
Template Known Secondary structure		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.