Job Description P77713 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 412 % Identity 20% Template c3c7hA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:endo-1,4-beta-xylanase; PDBTitle: crystal structure of glycoside hydrolase family 43 arabinoxylan2 arabinofuranohydrolase from bacillus subtilis in complex with axos-4-3 0.5. Resolution 2.00 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.		.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.																30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60				.	.	.
Predicted Secondary structure												.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Query SS confidence												.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Query Sequence		I	T	N	P	I	L	T	G	F	N	.	P	D	P	S	L	C	R	Q	G	E	D	Y	Y	I	A	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	E	W	F	P	G	V	R	I	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	.	.	.	L	D	M
Query Conservation												.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Alig confidence												.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	S	N	P	L	I	D	H	H	L	G	A	D	P	V	A	L	T	Y	N	G	R	V	Y	I	Y	M	S	S	D	D	Y	E	Y	N	S	N	G	T	I	K	D	N	S	F	A	N	L	N	R	V	F	V	I	S	S	A	D	M	V	N	W	T	D	H	G	A	I	P	V	A	G	A	N	G	A	N	G	G	R
Template Known Secondary structure					S	S			S	S											T	T															T	T	S							S	T	T			S							S	S	S	S	S										B		S	T	T	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80					.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.													.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P	C	L	S	Y	A	.	.	.	.	D	G	K	F	W	L	L	Y	T	D	V	K	I	V	D	S	P	W	K	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	P	W	S	E	P	I	P	M	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	G	F	D
Query Conservation																			.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	A	K	W	A	G	A	S	W	A	P	S	I	A	V	K	K	I	N	G	K	D	K	F	F	L	Y	F	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	I	G	V	L	T	A	D	S	P	I	G	P	W	T	D	P	I	G	K	P	L	V	T	P	S	T	P	G	M	S	G	V	V	W	L	F	D
Template Known Secondary structure			S	B	T	T		S													T	T										S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	B								S	S	T	T				B		S	S	S	S		S	B		T	T	S	T	T		T	T		S	S	B
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.									.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.							.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	S	L	F	H	D	D	D	G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W	G	P	R	H	H	S	N	P	H	N	.	.	.	.	.	.	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y	T	E	G	A	H	L	Y	R	H	A	G	W	Y	Y	L	M	A
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.
Template Sequence		P	A	V	F	V	D	D	D	G	T	G	Y	L	Y	A	G	G	G	V	P	G	V	S	N	P	T	Q	G	Q	W	A	N	P	K	T	A	R	V	I	K	L	G	P	D	M	T	S	V	V	G	S	A	S	T	I	.	.	.	D	A	P	F	M	F	E	D	S	G	L	H	K	Y	N	G	T	Y	Y	Y	S	Y
Template Known Secondary structure								T	T	S											S	S	T	T	S																			T	T	S	S	S									.	.	.			T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.				.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		202	.	.	.							.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	G	G	.	.	.	.	.	.	T	S	Y	E	H	A	V	V	V	L	R	S	K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M	T	S	W	H	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H	G	S	L	L	Q	T	H	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L	T	S	R	P	L	R	L	P	G	V	P
Query Conservation						.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.																							.	.													.														.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.													.														.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	I	N	F	G	G	T	H	P	A	D	K	P	P	G	E	I	G	Y	M	T	S	S	S	P	M	G	P	F	T	Y	R	.	.	G	H	F	L	K	N	P	G	A	F	F	G	.	G	G	G	N	N	H	H	A	V	F	N	F	K	.	N	E	W	Y	V	V	Y	H	A	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S	S				T	T	S		T	T	S							S	S	T	T							.	.							G	G	G	T	T		.													T	.	T											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.													.														.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.			.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.		.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.		.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.							.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T	G	I	A	R	I	E	W	.	R	D	G	W	P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L	T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	.	.	.	.	.	.	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E	L	Q	T	L	R
Query Conservation																									.																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																							.																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	V	S	S	A	L	F	G	A	G	K	G	Y	R	S	P	H	I	N	K	L	V	H	N	A	D	G	S	I	Q	E	V	A	A	N	Y	A	G	V	T	Q	I	S	N	L	N	P	Y	N	R	V	E	A	E	T	F	A	W	N	G	R	I	L	T	E	K	S	T	A	P	G	G	P	V	N	N	Q	H	V	T
Template Known Secondary structure		.							S	S		T	T											B		T	T	S		B							S	S						S		B		T	T	S				T	T			S				S									S	S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D	S	L	N	S	T	F	T	Q	S	T	V	A	R	R	W	Q	H	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	F	S	P	V	H	F	Q	Q	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S	K	N	W	S	Y	C	F	V	D	Y	E	E
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		S	I	Q	N	G	D	W	I	A	V	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	F	G	A	G	G	A	R	.	.	.	S	F	K	A	N	V	A	S	T	L	G	G	K	I	E	V	R	L	D	S
Template Known Secondary structure					T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T				.	.	.									S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					400	.	.	.	.	.	.	.	.				.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.					.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.
Query Sequence		G	Q	G	R	T	I	K	V	I	Q	L	D	H	N	V	P	S	W	P	L	H	E	Q	P	I	P	V	P	E	H	A	E	S	V	W	L	R	V	D	V	D	T	L	V	.	.	.	.	Y	R	Y	S	Y
Query Conservation																																														.	.	.	.
Alig confidence																																														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	G	K	L	V	G	T	L	N	V	P	S	T	G	G	A	Q	T	W	R	E	I	E	T	A	V	S	G	A	T	G	V	H	K	V	F	F	V	F	T	G	T	G	T	G	N	L	F	N	F	D	Y
Template Known Secondary structure		T	T	S												S	S	T	T											S			S											S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.