Job Description P77713 Confidence 99.71% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 36 Aligned Residues 403 % Identity 12% Template c2ac1A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:invertase; PDBTitle: crystal structure of a cell-wall invertase from arabidopsis thaliana Resolution 2.15 Å

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		10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.						.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.		80	.	.
Predicted Secondary structure									.																					.	.	.	.	.																																												.
Query SS confidence									.																					.	.	.	.	.																																												.
Query Sequence		G	F	N	P	D	P	S	.	L	C	R	Q	G	E	D	Y	Y	I	A	T	S	T	F	E	W	F	P	G	.	.	.	.	.	V	R	I	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	L	D	M	K	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P	C	L	S	Y	.	A	D	G
Query Conservation									.																					.	.	.	.	.																																												.
Alig confidence									.																					.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	W	M	N	D	P	N	G	P	M	I	Y	K	G	I	Y	H	L	F	Y	Q	W	N	P	K	G	A	V	W	G	N	I	V	W	A	H	S	T	S	T	D	L	I	N	W	D	P	H	P	P	A	I	F	P	S	A	P	F	D	I	.	.	.	.	.	.	N	G	C	W	S	G	S	A	T	I	L	P	N	G
Template Known Secondary structure														T	T										T	T		S	S	S		S									S	S	S	S	S	B											S	G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	T											T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.							.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.													.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	F	W	L	L	Y	T	D	V	K	I	V	D	S	P	W	K	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	P	W	S	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	M	G	N	G	G	F	D	P	S	L	F	H	D	D	D	G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W	G	P	R	H	H
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		K	P	V	I	L	Y	T	G	I	D	P	K	N	Q	Q	V	Q	N	I	A	E	P	K	N	L	S	D	P	Y	L	R	E	W	K	K	S	P	L	N	P	L	M	A	P	D	A	V	N	G	I	N	A	S	S	F	R	D	P	T	T	A	W	L	G	Q	D	K	K	W	R	V	I	I	G	S	K	I	H	R	.
Template Known Secondary structure												T	T	S										S		T	T		T	T								T	T			S	B				T	T	T				T	T	S											T	T	S											T	T	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.																		.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	N	P	H	N	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y	T	E	G	A	H	L	Y	R	H	A	G	W	Y	Y	L	M	A	A	E	G	G	T	S	Y	E	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																						.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																						.	.
Template Sequence		.	.	R	G	L	A	I	T	Y	T	S	K	D	F	L	K	W	E	K	S	P	E	P	.	.	L	H	Y	D	D	G	S	G	M	W	E	C	P	D	F	F	P	V	T	R	F	G	S	N	G	V	E	T	S	S	F	G	E	P	N	E	I	L	K	H	V	L	K	I	S	L	D	D	T	K	H	D	Y	Y	T
Template Known Secondary structure		.	.										S	S	S	S	S					S	S		.	.	S					T	S													S	S		S					T	T				B	T	T	B											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.																						.	.
Template SS confidence
				172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.			.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	R	S	K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M	T	S	W	H	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H	G	S	L	L	Q	T	H	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L	T	S	R	P	L	R	L	P	G	V	P	L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T	G	I
Query Conservation
Alig confidence																															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	G	T	Y	D	R	V	K	D	K	F	V	P	D	N	G	F	K	M	D	G	T	A	P	R	Y	D	Y	G	.	K	Y	Y	A	S	K	T	F	F	D	S	A	K	N	R	R	I	L	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	T						T	T			S	S	T	T	S		B	S		S	S	.	S										T	T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																															.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	I	E	W	R	D	G	W	P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L	T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E	L	Q	T	L	R	I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D	S	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.							.	.	.	.	.	.																										.	.						.	.	.	.	.	.										.							.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.							.	.	.	.	.	.																										.	.						.	.	.	.	.	.										.							.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	G	W	T	N	E	S	.	.	.	.	.	.	S	S	V	E	D	D	V	E	K	G	W	S	G	I	Q	T	I	P	R	K	I	W	L	D	R	.	.	S	G	K	Q	L	.	.	.	.	.	.	I	Q	W	P	V	R	E	V	E	.	R	L	R	T	K	Q	.	.	.	.	V	K	N	L	R	N	K
Template Known Secondary structure		.	.	.						S	.	.	.	.	.	.	S									T															T	.	.	T	S	S	S		.	.	.	.	.	.						G	G	G	G	.	G	G	B		S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.							.	.	.	.	.	.																										.	.						.	.	.	.	.	.										.							.	.	.	.
Template SS confidence
					296	.	.	.	300	.							.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.							.	.	.	.	.	.	.	.	340		.	.	.	.	.	.					.	.	.	350	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	S	T	F	T	Q	S	T	V	A	R	R	W	Q	H	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	F	S	P	V	H	F	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S	K	N	W	S	Y	C	F	V	D	Y	E	E
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	L	K	S	G	S	R	L	E	V	Y	G	V	T	A	A	Q	A	D	V	E	V	L	F	K	V	R	D	L	E	K	A	D	V	I	E	P	S	W	T	D	P	Q	L	I	C	S	K	M	N	V	S	V	K	S	G	L	G	P	F	G	L	M	V	L	A	S	K	N	L	E	E	Y	T	S	V	Y	F	R	I
Template Known Secondary structure					T	T							S	S		T	T											S		G	G	G	S					T	T											T		T	T	S			S												T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
		429	430	.											.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	I	K	V	I	Q	L	D	H	N	V	P	S	W	P	L	H	E	Q	P	I	P	V	P	E	H	A	E	S	V	W	L	R	V	D	V	D	T	L	V	Y	R	Y	S	Y
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	K	A	R	Q	N	S	N	K	Y	V	V	L	M	C	S	D	Q	S	R	S	S	L	K	E	D	N	D	K	T	T	Y	G	A	F	V	D	I	N	P	H	Q	P	L	S	L	R	A	L	I	D	H	S	V	V	E	S	F	G
Template Known Secondary structure				S	S	T	T		S											T	T	S		S		T	T	S													T	T	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.