Job Description P77713 Confidence 99.92% Date Wed Jan 25 15:21:12 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 358 % Identity 15% Template c1w2tE_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: E: PDB Molecule:beta fructosidase; PDBTitle: beta-fructosidase from thermotoga maritima in complex with2 raffinose Resolution 1.87 Å

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		10	.	.	.	.	.	.		.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.						.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure									.												.	.	.	.	.
Query SS confidence									.												.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	N	P	D	P	S	.	L	C	R	Q	G	E	D	Y	Y	I	A	.	.	.	.	.	T	S	T	F	E	W	F	P	G	V	R	I	Y	H	S	R	D	L	K	N	W	S	L	V	S	T	P	L	D	R	V	S	M	L	D	M	K	G	N	P	D	S	G	G	I	W	A	P	C	L	S	Y	A	D	G	K
Query Conservation									.												.	.	.	.	.
Alig confidence									.												.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	W	M	N	D	P	N	G	L	I	F	W	K	G	K	Y	H	M	F	Y	Q	Y	N	P	R	K	P	E	W	G	N	I	C	W	G	H	A	V	S	D	D	L	V	H	W	R	H	L	P	V	A	L	Y	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	T	H	G	V	F	S	G	S	A	V	E	K	D	G	K
Template Known Secondary structure														T	T										T	T	S	S	S			S									S	S	S	S	S											S	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.									.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.					.	.	120	.	.	.	.	.							.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	W	L	L	Y	T	D	V	K	I	V	D	S	P	W	K	N	G	R	N	F	L	V	T	A	P	S	I	E	G	P	W	S	E	.	.	.	.	P	I	P	M	G	N	G	G	.	.	.	.	.	.	F	D	P	S	L	F	H	D	D	D	G	R	K	Y	Y	I	Y	R	P	W	G	P	R	H	H	S	N	P
Query Conservation																																				.	.	.	.									.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.									.	.	.	.	.	.									.												.	.	.
Template Conservation																																																														.												.	.	.
Template Sequence		M	F	L	V	Y	T	Y	Y	R	D	P	T	H	N	K	G	E	K	E	T	Q	C	V	V	M	S	E	N	G	L	D	F	V	K	Y	D	G	N	P	V	I	S	K	P	P	E	E	G	T	H	A	F	R	D	P	K	V	N	R	S	.	N	G	E	W	R	M	V	L	G	S	G	.	.	.	K	D	E	K	I
Template Known Secondary structure														S	S													S	S	S	S						T	T			S	B		S		S	S	S	S													.	T	T										.	.	.		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.												.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.		.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.				.	.	.	.	160
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	N	T	I	V	L	Q	A	F	D	P	Q	T	G	T	L	S	P	E	R	K	T	L	F	T	G	T	P	L	C	Y	T	E	G	A	H	L	Y	R	H	A	G	W	Y	Y	L	M	A	A	E	G	G	T	S	Y	E	H	A	V	V	V	L	R	S	K	N	I	D	G	P	Y	E	L	H	P	D	V	T	M	M
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.																																		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.																																		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	V	L	L	Y	T	S	D	D	L	F	H	W	K	Y	E	G	.	.	.	A	I	F	E	D	E	T	T	K	E	I	D	C	P	D	L	V	R	I	G	E	K	D	I	L	I	Y	S	I	T	S	T	N	.	.	.	S	V	L	F	S	M	G	E	L	K	E	G	K	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S	S	S	S	S						.	.	.						T	T		S											T	T									T	T	T	T	.	.	.											T	T				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.																																		.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.				.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.				.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	S	W	H	L	P	E	N	P	L	Q	K	S	G	H	G	S	L	L	Q	T	H	T	G	E	W	Y	M	A	Y	L	T	S	R	P	L	R	L	P	G	V	P	L	L	A	S	G	G	R	G	Y	C	P	L	G	R	E	T	G	I	A	R	I	E	W	R	D	G	W	P	Y	V	E	G	G	K	H	A	Q	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	K	R	G	L	L	D	H	G	T	D	F	Y	A	A	Q	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	G	T	D	R	V	V	V	.	.	.	I	G	W	L	Q	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S			S	S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B	S		S	S				.	.	.				S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	250	.	.	.				.	.	.	.	.	.	260
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		T	V	K	G	P	Q	V	A	E	Q	P	A	A	V	P	G	N	W	R	D	D	F	D	A	S	S	L	D	P	E	L	Q	T	L	R	I	P	F	D	D	T	L	G	S	L	T	A	R	P	G	F	L	R	L	Y	G	N	D	S	L	N	S	T	F	T	Q	S	T	V	A	R	R	W	Q	H	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.																																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	T	G	L	Y	P	T	K	R	E	G	W	N	G	V	M	S	L	P	R	.	.	.	.	E	L	Y	V	E	N	N	E	L	K	V	K	P	V	D	E	L	L	A	L	R	K	R	K	V	F	E	T	A	K	S	G	T	F	L	L	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	G	G	G		S	G	G	G	G	T					B					.	.	.	.						T	T								G	G	G	G	G	G									S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Template SS confidence
																				261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.					.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
					389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	F	A	F	R	A	E	T	R	M	E	F	S	P	V	H	F	Q	Q	S	A	G	L	T	C	Y	Y	N	S	K	N	W	S	Y	C	F	V	D	Y	E	E	G	Q	G	R	T	I	K	V	I	Q	L	D	H	N	V	P	S	W	P	L	H	E	Q	P	I	P	V	P	E	H	A	E	S	V	W	L	R
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.													.											.	.	.																							.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.													.											.	.	.																							.	.	.
Template Sequence		V	K	E	N	S	Y	E	I	V	C	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	E	I	E	L	R	M	G	N	E	S	.	E	E	V	V	I	T	K	S	R	D	.	.	.	E	L	I	V	D	T	T	R	S	G	V	S	G	G	E	V	R	K	S	T	V	E	.	.	.	D	E	A	T	N	R	I	R
Template Known Secondary structure			S	S	S									.	.	.	.	.	.	.	.	.		S									S	S	.									T	T	.	.	.							T	T	S	S	T	T											.	.	.			S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.													.											.	.	.																							.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330										.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.				.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.				.	.	.	.	.	380	.	.
		466	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	D	V	D	T	L	V	Y	R	Y	S	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	F	L	D	S	C	S	V	E	F	F	F
Template Known Secondary structure						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.