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Summary |   |
Top model | |||||||||||||||||
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Sequence analysis |   |
Secondary structure and disorder prediction |   |
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  |   | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | M | S | L | A | K | D | N | I | W | K | L | L | A | P | L | V | V | M | G | V | M | F | L | I | P | V | P | D | G | M | P | P | Q | A | W | H | Y | F | A | V | F | V | A | M | I | V | G | M | I | L | E | P | I | P | A | T | A | I | S | F | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | I | A | V | T | I | C | V | I | G | S | N | Y | L | L | F | D | A | K | E | L | A | D | P | A | F | N | A | Q | K | Q | A | L | K | W | G | L | A | G | F | S | S | T | T | V | W | L | V | F | G | A | F | I | F | A | L | G | Y | E | V | S | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | G | L | G | R | R | I | A | L | F | L | V | K | F | M | G | K | R | T | L | T | L | G | Y | A | I | V | I | I | D | I | L | L | A | P | F | T | P | S | N | T | A | R | T | G | G | T | V | F | P | V | I | K | N | L | P | P | L | F | K | S | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | F | P | N | D | P | S | A | R | R | I | G | G | Y | L | M | W | M | M | V | I | S | T | S | L | S | S | S | M | F | V | T | G | A | A | P | N | V | L | G | L | E | F | V | S | K | I | A | G | I | Q | I | S | W | L | Q | W | F | L | C | F | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | L | P | V | G | V | I | L | L | I | I | A | P | W | L | S | Y | V | L | Y | K | P | E | I | T | H | S | E | E | V | A | T | W | A | G | D | E | L | K | T | M | G | A | L | T | R | R | E | W | T | L | I | G | L | V | L | L | S | L | G | L | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | W | V | F | G | S | E | V | I | N | A | T | A | V | G | L | L | A | V | S | L | M | L | A | L | H | V | V | P | W | K | D | I | T | R | Y | N | S | A | W | N | T | L | V | N | L | A | T | L | V | V | M | A | N | G | L | T | R | S | G | F | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | I | D | W | F | A | G | T | M | S | T | H | L | E | G | F | S | P | N | A | T | V | I | V | L | V | L | V | F | Y | F | A | H | Y | L | F | A | S | L | S | A | H | T | A | T | M | L | P | V | I | L | A | V | G | K | G | I | P | G | V | P | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 430 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 440 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 450 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 460 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 470 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 480 | |||||||||||||||||||
Sequence |   | M | E | Q | L | C | I | L | L | V | L | S | I | G | I | M | G | C | L | T | P | Y | A | T | G | P | G | V | I | I | Y | G | C | G | Y | V | K | S | K | D | Y | W | R | L | G | A | I | F | G | V | I | Y | I | S | M | L | L | L | V | G | W | |||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |   | P | I | L | A | M | W | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder |   | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Confidence Key | |||||||||||
High(9) |   |   |   |   |   |   |   |   |   |   | Low (0) |
? | Disordered |
![]() ![]() | Alpha helix |
![]() ![]() | Beta strand |
Domain analysis |   |
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Hover over an aligned region to see model and summary info
Please note, only up to the top 20 hits are modelled to reduce computer load
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Detailed template information |   |
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Binding site prediction |   |
Due to computational demand, binding site predictions are not run for batch jobs
If you want to predict binding sites, please manually submit your model of choice to 3DLigandSite
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||||||||
  | ||||||||||||||
If you use the binding site predictions from 3DLigandSite, please also cite: | ||||||||||||||
3DLigandSite: predicting ligand-binding sites using similar structures. | ||||||||||||||
Wass MN, Kelley LA and Sternberg MJ Nucleic Acids Research 38, W469-73 (2010) [PubMed] | ||||||||||||||
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