Job Description P75800 Confidence 99.85% Date Thu Jan 5 12:14:19 GMT 2012
Rank 23 Aligned Residues 149
% Identity 9% Template c3hvwA_
PDB info
PDB header: lyaseChain: A: PDB Molecule: diguanylate-cyclase (dgc);
PDBTitle: crystal structure of the ggdef domain of the pa2567 protein2 from pseudomonas aeruginosa, northeast structural genomics3 consortium target par365c
Resolution 1.70 Å
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371 . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420 . . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
I S Y D Q E S G F I K N M A I I E S N N N Q Y L A V G I I K L C G L E A V E A V F G V D E R N K I V R K L C Q R I A E K Y A Q C C D I V T F N A D L Y L L L C R
Query Conservation  
                                                                                                   
Alig confidence  
. .
Template Conservation  
                                .                                                           .                
Template Sequence  
Y N R L R L Q E D V S L R L Q R D G A L T .
V I A A D L L P L A L L N T I I R T L G Y P F S N D L X L E A R D R I R A E L P D F T .
L Y K I S P T R F G L L L P
Template Known Secondary structure  
S . S T T S . T T
Template Predicted Secondary structure  
. .
Template SS confidence  
   
175 . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . .
. . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . .
. 240 . . . . . . . . . 250 . .
 
   
451
. . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480 . . .
. . . . . . 490
. . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . .
Predicted Secondary structure  
. . . . . . .
Query SS confidence  
.
.
.
.
.
.
.
Query Sequence  
E .
.
.
.
N V Q T F T R K I A M V N D F D S S F G Y R N L R I H K S A I C .
.
E P L Q G E N .
A W S Y A E K L K L A I S S I R D H M F S E F I F C D D A K L N
Query Conservation  
  . . . .                                                                 . .               .                                                      
Alig confidence  
. . . . . . . .
Template Conservation  
                                                                                                              .                  
Template Sequence  
R Q Q Q E E T E S V C L R L L R A F E S P V V C R G I P I K A N V G L G V L P L A D D T L D G D Q D W L R L V V S A A D D A R D R G V G .
W A R Y N P P L D Q
Template Known Secondary structure  
G G G G G G T T S T T G G G T G G G S T S . S S T
Template Predicted Secondary structure  
.
Template SS confidence  
   
253 . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300 . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320
. . . . . . . . . 330
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]