Job Description P76017 Confidence 96.84% Date Thu Jan 5 12:17:29 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 164 % Identity 16% Template d2fgqx1 SCOP info Transmembrane beta-barrels Porins Porin Resolution 1.45

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		699	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	G	S	L	D	S	F	A	S	G	K	L	S	G	F	D	M	G	Y	S	G	I	Q	F	G	G	D	K	R	L	S	D	V	M	P	L	Y	V	G	L	Y	I	G	S	T	H	A	S	P	D	Y	S	G	G	D	G	T	A	R	S	D	Y	M	G	M	Y	A	S	Y	M	A	Q	N	G	F	Y	S	D	L
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template Sequence		A	G	F	G	Y	A	F	D	E	K	Q	T	I	G	T	A	D	S	V	G	R	Y	I	G	G	Y	V	A	Y	D	N	G	.	.	.	.	.	P	L	S	A	S	L	G	L	A	Q	Q	K	T	A	V	G	G	L	A	T	D	R	D	E	I	T	L	G	A	S	Y	N	F	.	.	.	G	V	A	K	L	S	G
Template Known Secondary structure										T	T			B	T	T	B	S	S	T	T												S	.	.	.	.	.	S															T	T																	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.																																		.	.	.
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.						.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.				.	.	.	.	.	220	.
		779	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	K	A	S	R	Q	K	N	S	F	H	V	L	D	S	Q	N	N	G	V	N	A	N	G	T	A	N	G	M	S	I	S	L	E	A	G	Q	R	F	N	L	S	P	T	G	Y	G	F	Y	I	E	P	Q	T	Q	L	T	Y	S	H	Q	N	E	M	T	M	K	A	S	N	G	L	N	I	H	L	N	H	Y
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	Q	Q	T	K	F	K	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	G	D	I	K	T	N	S	Y	.	.	.	.	.	.	M	L	G	A	S	A	P	V	G	G	V	.	.	.	.	.	G	E	V	K	L	Q	Y	A	L	Y	D	Q	K	A	I	D	S	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											T	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S									.	.	.	.	.	.									T	T	T	.	.	.	.	.													G	G	G	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.									.	.	.	.	.	.	.	.	240	.							.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.						.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		859	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	S	L	L	G	R	A	S	M	I	L	G	Y	D	I	T	A	G	N	S	Q	L	N	V	Y	V	K	T	G	A	I	R	E	F	S	G	D	T	E	Y	L	L	N	N	S	R	E	K	Y	S	F	K	G	N	G	W	N	N	G	V	G	V	S	A	Q	Y	N	K	Q	H	T	F	Y	L	E	A	D	Y	T	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Q	I	T	L	G	Y	V	H	N	L	S	K	R	T	A	L	Y	G	N	L	A	F	L	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																									272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		939	940	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	N	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	K	Q	V	N	G	G	Y	R	F	S	F
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	K	D	A	S	T	L	G	L	Q	A	K	G	V	Y	A	G	G	V	Q	A	G	E	S	Q	T	G	V	Q	V	G	I	R	H	A	F
Template Known Secondary structure				T	T							B	T	T	T	B		S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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