Job Description P13036 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:31 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 593 % Identity 16% Template c3fhhA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:outer membrane heme receptor shua; PDBTitle: crystal structure of the heme/hemoglobin outer membrane2 transporter shua from shigella dysenteriae Resolution 2.60 Å

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		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	V	V	G	D	W	L	G	D	A	R	E	N	D	V	F	E	H	A	G	A	R	D	V	I	R	R	E	D	F	A	K	T	G	A	T	T	M	R	E	V	L	N	R	I	P	G	V	S	A	P	E	N	N	G	T	G	S	H	D	L	A	M	N	F	G	I	R	G	L	N	P	R	L	A	S	R	S	T	V
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		T	E	T	M	T	V	T	A	T	G	N	A	R	S	S	F	E	A	P	M	M	V	S	V	I	D	T	S	A	P	E	N	Q	T	A	T	S	A	T	D	L	L	R	H	V	P	G	I	T	L	D	G	T	G	R	T	N	G	Q	.	.	.	.	D	I	N	M	R	G	Y	D	H	.	.	.	R	G	V	L	V
Template Known Secondary structure							S	T	T	T	S	S				S	T	T	S	S	S							T	T	S	T	T	T	T	T			S	G	G	G	G	G	T	T	S	T	T					S		S	S	S	T	T		.	.	.	.					T	T	B		G	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.					60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	M	D	G	I	P	V	P	F	A	P	Y	G	Q	P	Q	L	S	L	A	P	V	S	L	G	N	M	D	A	I	D	V	V	R	G	G	G	A	V	R	Y	G	P	Q	S	V	G	G	V	V	N	F	V	T	R	A	I	P	Q	D	F	G	I	E	A	G	V	E	G	Q	L	S	P	T	S	S	Q	N	N	P
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.
Template Conservation															.	.	.
Template Sequence		L	V	D	G	I	R	Q	G	T	D	T	G	H	.	.	.	L	N	G	T	F	L	D	P	A	L	I	K	R	V	E	I	V	R	G	P	S	A	L	L	Y	G	S	G	A	L	G	G	V	I	S	Y	D	T	V	D	A	K	D	L	L	Q	E	G	Q	S	S	G	F	R	V	F	G	T	G	G	T	G	D	H
Template Known Secondary structure				T	T								S	S	.	.	.								G	G	G									S				T	T	T		T	T		S	S																	S	S	S											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.
Template SS confidence
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.				.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.						290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	T	H	N	L	M	V	G	G	T	A	D	N	.	.	.	.	.	G	F	G	T	A	L	L	Y	S	G	T	R	G	S	D	W	R	E	H	S	A	T	R	I	D	D	L	M	L	K	S	K	Y	A	P	D	E	V	H	T	F	N	S	L	L	Q	Y	Y	D	G	E	A	D	M	P	G	G	L	S	R	A
Query Conservation																.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	L	G	L	G	A	S	A	F	G	R	T	E	N	L	D	G	I	V	A	W	S	S	R	D	R	G	D	L	R	Q	S	N	G	E	T	A	P	N	D	E	S	I	N	N	M	L	A	K	G	T	W	Q	I	D	S	A	Q	S	L	S	G	L	V	R	Y	Y	N	N	D	A	R	E	P	K	N	P	Q	T	V
Template Known Secondary structure														S	S															B			S	S	S			B																	S	S	S	S																		S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	D	A	D	R	W	Q	S	T	R	P	Y	D	R	F	W	G	R	R	K	L	A	S	L	G	Y	Q	F	Q	P	D	S	Q	H	K	F	N	I	Q	G	F	Y	T	Q	T	L	R	S	G	Y	L	E	Q	G	K	R	I	T	L	S	P	R	N	Y	W	V	R	G	I	E	P	R	Y	S	Q	I	F	M	I
Query Conservation
Alig confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	A	S	E	S	S	N	P	M	V	D	R	S	T	I	Q	R	D	A	Q	L	S	Y	K	L	A	P	Q	G	N	D	W	L	N	A	D	A	K	I	Y	W	S	E	V	R	I	N	A	Q	E	Y	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	T	K	G	A	R	L	E	N	R	S	T	L	F	A	D
Template Known Secondary structure		S			S	S	S	S																					T	T		S	S																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															S		S
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.											.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	S	A	H	E	V	G	V	G	Y	R	Y	L	N	E	S	T	H	E	M	R	Y	Y	T	A	T	S	S	G	Q	L	P	S	G	S	S	P	Y	D	R	D	T	R	S	G	T	E	A	H	A	W	Y	L	D	D	K	I	D	I	G	N	W	T	I	T	P	G	M	R	F	E	H	I	E	S	Y	Q	N	N
Query Conservation
Alig confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	F	A	S	H	L	L	T	Y	G	G	E	Y	Y	R	Q	E	Q	G	S	H	T	T	G	F	P	Q	A	K	I	D	F	S	S	G	W	L	Q	D	E	I	T	L	R	D	L	P	I	T	L	L	G	G	T	R	Y	D	S	Y	R	G	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	S																						S																				S	S	S	S																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.															.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	T	G	T	H	E	E	V	S	Y	N	A	P	L	P	A	L	N	V	L	Y	H	L	T	D	S	W	N	L	Y	A	N	T	E	G	S	F	G	T	V	Q	Y	S	Q	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	V	Q	S	G	N	V	E	P	E	K	A	R	T	W	E	L	G
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	D	G	Y	K	D	V	D	A	D	K	W	S	S	R	A	G	M	T	I	N	P	T	N	W	L	M	L	F	G	S	Y	A	Q	A	F	R	A	P	T	M	G	E	M	Y	N	D	S	K	H	F	S	I	G	R	F	Y	T	N	Y	W	V	P	N	P	N	L	R	P	E	T	N	E	T	Q	E	Y	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	S	S	S																		S	S	S	S																							S					S	S	S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
		577	.	.	580								.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	R	Y	D	.	.	.	.	.	.	.	D	G	A	L	T	A	E	M	G	L	F	L	I	N	F	N	N	Q	Y	D	S	N	Q	T	N	D	T	V	T	A	R	G	K	T	R	H	T	G	L	E	T	Q	A	R	Y	D	L	G	T	L	T	P	T	L	D	N	V	S	I	Y	A	S	Y	A	Y	V	N	A	E
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.
Template Sequence		F	G	L	R	F	D	D	L	M	L	S	N	D	A	L	E	F	K	A	S	Y	F	D	T	K	A	K	D	Y	I	S	T	T	V	D	F	A	.	.	.	A	A	T	T	M	S	Y	N	V	P	N	A	K	I	W	G	W	D	V	M	T	K	Y	T	T	D	L	F	S	L	D	V	A	Y	N	R	T	R	G	K
Template Known Secondary structure								S		T	T																										G	G	.	.	.	G	T																								S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.
Template SS confidence
		457	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.				.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.			.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.
Query SS confidence																															.	.
Query Sequence		I	R	E	K	G	D	T	Y	G	N	L	V	P	F	S	P	K	H	K	G	T	L	G	V	D	Y	K	P	G	.	.	N	W	T	F	N	L	N	S	D	F	Q	S	S	Q	F	A	D	N	A	N	T	V	K	E	S	A	D	G	S	T	G	R	I	P	G	F	M	L	W	G	A	R	V	A	Y	D	F	G	P
Query Conservation																															.	.
Alig confidence						.	.	.	.																						.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	D	T	.	.	.	.	G	E	Y	I	S	S	I	N	P	D	T	V	T	S	T	L	N	I	P	I	A	H	S	G	F	S	V	G	W	V	G	T	F	A	D	R	S	T	H	I	S	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	G	Y	G	V	N	D	F	Y	V	S	Y	Q	G	Q	Q
Template Known Secondary structure			T	T	T	.	.	.	.			B		S	S															T	T	S	S																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		534	.	.	.					.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580													.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
		728	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	M	A	D	L	N	L	A	F	G	V	K	N	I	F	D	Q	D	Y	F	I	R	S	Y	D	D	N	N	K	G	I	Y	A	G	Q	P	R	T	L	Y	M	Q	G	S	L	K	F
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	K	G	M	T	T	T	L	V	L	G	N	A	F	D	K	E	Y	W	S	P	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	I	P	Q	D	G	R	N	G	K	I	F	V	S	Y	Q	W
Template Known Secondary structure		G	G	T	T									S	T	T					B		T	T	S	.	.	.	.	.	.	.		B				S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		601	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.								.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640