Job Description P13036 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:31 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 714 % Identity 15% Template c2iahA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:ferripyoverdine receptor; PDBTitle: crystal structure of the ferripyoverdine receptor of the outer2 membrane of pseudomonas aeruginosa bound to ferripyoverdine. Resolution 2.73 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	A	Q	V	N	I	A	P	G	S	L	D	K	A	L	N	Q	Y	A	A	H	S	G	F	T	L	S	V	D	A	S	L	T	R	G	K	Q	S	N	G	L	H	G	D	Y	D	V	E	S	G	L	Q	Q	L	L	D	G	S	G	L	Q	V	K	P	L	G	N	N	S	W	T	L	E	P	A	P	A	P	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	V	E	F	D	I	P	P	Q	A	L	G	S	A	L	Q	E	F	G	R	Q	A	D	I	Q	V	L	Y	R	P	E	E	V	R	N	K	R	S	S	A	I	K	G	K	L	E	P	N	Q	A	I	T	E	L	L	R	G	T	G	A	S	V	D	F	Q	G	N	A	I	T	I	S	V	A	T	I	T	E	D
Template Known Secondary structure										S													T	T	T							G	G	G	T	S	S																				T	T	T	T	T							T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	A	L	T	V	V	G	D	W	L	G	D	A	R	E	N	D	V	F	E	H	A	G	A	R	D	V	I	R	R	E	D	F	A	K	T	G	A	T	T	M	R	E	V	L	N	R	I	P	G	V	S	A	P	E	N	N	G	T	G	S	H	D	L	A	M	N	F	G	I	R	G	L	N	P	R	L	A	S
Query Conservation
Alig confidence																																																																.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.												.	.
Template Sequence		S	G	S	Y	T	P	G	T	I	A	T	A	T	R	L	V	L	T	P	R	E	T	P	Q	S	I	T	V	V	T	R	Q	N	M	D	D	F	G	L	N	N	I	D	D	V	M	R	H	T	P	G	I	T	V	S	A	Y	D	T	D	R	N	.	.	.	.	.	N	Y	Y	A	R	G	F	S	I	N	N	.	.
Template Known Secondary structure					S	S		S		B		S	S	S	S	S		B		G	G	G			S													T	T			B						T	T	S	T	T								T	T			.	.	.	.	.					T	T						.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.												.	.
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.						.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	S	T	V	L	M	D	G	I	P	V	P	F	A	P	Y	G	Q	P	Q	L	S	L	A	P	V	S	L	G	N	M	D	A	I	D	V	V	R	G	G	G	A	V	R	Y	G	P	Q	S	V	G	G	V	V	N	F	V	T	R	A	I	P	Q	D	F	G	I	E	A	G	V	E	G	Q	L	S	P	T	S	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																	.																																																						.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																	.																																																						.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	F	Q	Y	D	G	I	P	S	T	A	R	N	V	G	Y	S	.	A	G	N	T	L	S	D	M	A	I	Y	D	R	V	E	V	L	K	G	A	T	G	L	L	T	G	A	G	S	L	G	A	T	I	N	L	I	R	K	K	P	T	H	E	F	K	G	H	V	E	L	G	A	.	.	.	.	.	G	S
Template Known Secondary structure		.	.	.				T	T								G	G	G		.		S	T	T	S		B	G	G	G																	S			S													S	S										.	.	.	.	.		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																	.																																																						.	.	.	.	.
Template SS confidence
					217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.		.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.						.	.
		272	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	N	N	P	K	E	T	H	N	L	M	V	G	G	T	A	D	N	G	F	G	T	A	L	L	Y	S	G	T	R	G	S	D	W	R	E	H	S	A	T	R	I	D	D	L	M	L	K	S	K	Y	A	P	D	E	V	H	T	F	N	S	L	L	Q	Y	Y	D	G	E	A	D	M	P	G	G	L	S	R	A	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		W	D	N	Y	R	S	E	L	D	V	S	G	P	L	T	E	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	Q	D	K	H	S	F	M	D	H	Y	E	R	K	T	S	V	Y	Y	G	I	L	E	F	D	L	N	P	D	T	M	L	T	V	G	A	D	Y	Q	D	N	D	P	K	G	S	G	W	S	G	S	F	P
Template Known Secondary structure		T	T													S	S	S		S															S	S	T	T																		T	T																S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	A	D	R	W	Q	S	T	R	P	Y	D	R	F	W	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	K	L	A	S	L	G	Y	Q	F	Q	P	D	S	Q	H	K	F	N	I	Q	G	F	Y	T	Q	T	L	R	S	G	Y	L	E	Q	G	K	R	I	T	L
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	F	D	S	Q	G	N	R	N	D	V	S	R	S	F	N	N	G	A	K	W	S	S	W	E	Q	Y	T	R	T	V	F	A	N	L	E	H	N	F	A	N	G	W	V	G	K	V	Q	L	D	H	K	I	N	G	Y	H	A	P	L	G	A	I	M	G	D	W	P	A	P	D	N	S	A	K	I	V	A	Q	K
Template Known Secondary structure		S	S	B	T	T	B	S						T	T				B		T	T																			T	T	S																							S	S				T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		S	P	R	N	Y	W	V	R	G	I	E	P	R	Y	S	Q	I	F	M	I	G	P	S	A	H	E	V	G	V	G	Y	R	Y	L	N	E	S	T	H	E	M	R	Y	Y	T	A	T	S	S	G	Q	L	P	S	G	S	S	P	Y	D	R	D	T	R	S	G	T	E	A	H	A	W	Y	L	D	D	K	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																																																																															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	G	E	T	K	S	N	S	L	D	I	Y	L	T	G	P	F	Q	F	L	G	R	E	H	E	L	V	V	G	T	S	A	S	F	S	H	W	E	G	K	S	Y	W	N	L	R	N	Y	D	N	T	T	D	D	F	I	N	W	D	G	D	I	G	K	P	D	W	G	T	P	S	Q	Y	I	D	D	K	T	R
Template Known Secondary structure																					S	S	S																																S		S	T	T			S									S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
							488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	I	D	I	G	N	W	T	I	T	P	G	M	R	F	E	H	I	E	S	Y	Q	N	N	A	I	T	G	T	H	E	E	V	S	Y	N	A	P	L	P	A	L	N	V	L	Y	H	L	T	D	S	W	N	L	Y	A	N	T	E	G	S	F	G	T	V	Q	Y	S	Q	I	G	K	A	V	Q	S
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																																							.	.
Template Conservation																																																																													.	.
Template Sequence		Q	L	G	S	Y	M	T	A	R	F	N	V	T	D	D	L	N	L	F	L	G	G	R	V	V	D	Y	R	V	T	G	L	N	P	T	I	R	E	S	G	R	F	I	P	Y	V	G	A	V	Y	D	L	N	D	T	Y	S	V	Y	A	S	Y	T	D	I	F	M	P	Q	D	S	W	Y	R	D	.	.	S	S	N
Template Known Secondary structure														S	S	S																	S	S																			S	S	S	S																T	T		B		.	.	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Template SS confidence
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.			.	.	.
		563	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.			.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.				.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.																														.	.	.
Query SS confidence																		.	.																														.	.	.
Query Sequence		G	N	V	E	P	E	K	A	R	T	W	E	L	G	T	R	.	.	Y	D	D	G	A	L	T	A	E	M	G	L	F	L	I	N	F	N	N	Q	Y	D	S	N	Q	T	N	D	T	.	.	.	V	T	A	R	G	K	T	R	H	T	G	L	E	T	Q	A	R	Y	D	L	G	T	L	T	P	T	L	D	N	V
Query Conservation																		.	.																														.	.	.
Alig confidence																		.	.																														.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	L	E	P	D	E	G	Q	N	Y	E	I	G	I	K	G	E	Y	L	D	G	R	L	N	T	S	L	A	Y	F	E	I	H	E	E	N	R	A	E	E	D	A	L	Y	N	S	K	P	T	N	P	A	I	T	Y	A	Y	K	G	I	K	A	K	T	K	G	Y	E	A	E	I	S	G	E	L	A	P	G	W
Template Known Secondary structure			B																		G	G	G	T																								T	S				T	T		S	S																						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.
		638	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.					.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.
Query Sequence		S	I	Y	A	S	Y	A	Y	V	N	A	E	I	R	E	K	G	D	T	Y	G	N	L	V	P	F	S	P	K	H	K	G	T	L	G	V	D	Y	K	.	.	.	.	P	G	N	W	T	F	N	L	N	S	D	F	Q	S	S	Q	F	A	D	N	A	N	T	V	K	E	S	A	D	G	S	T	G	R	I	P	G
Query Conservation																																									.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.																				.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																		.	.	.	.																																															.	.
Template Sequence		Q	V	Q	A	G	Y	T	H	K	I	I	R	D	D	S	G	.	.	.	.	K	K	V	S	T	W	E	P	Q	D	Q	L	S	L	Y	T	S	Y	K	F	K	G	A	L	D	K	L	T	V	G	G	G	A	R	W	Q	G	K	S	W	Q	M	V	Y	N	N	.	.	P	R	S	R	W	E	K	F	S	Q	E	D
Template Known Secondary structure															S	S	S	.	.	.	.		B			T	T	S		S													G	G	G	T	T																				T	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.																																															.	.
Template SS confidence
		686	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.					.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.			.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		714	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	M	L	W	G	A	R	V	A	Y	D	F	G	P	Q	M	A	D	L	N	L	A	F	G	V	K	N	I	F	D	Q	D	Y	F	I	R	S	Y	D	D	N	N	K	G	I	Y	A	G	Q	P	R	T	L	Y	M	Q	G	S	L	K	F
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.																												.	.
Template Conservation															.	.	.																												.	.
Template Sequence		Y	W	L	V	D	L	M	A	R	Y	Q	I	T	.	.	.	D	K	L	S	A	S	V	N	V	N	N	V	F	D	K	T	Y	Y	T	N	I	G	F	Y	T	S	A	.	.	S	Y	G	D	P	R	N	L	M	F	S	T	R	W	D	F
Template Known Secondary structure														S	.	.	.	S	S									S	T	T									T	G	G	G			.	.						S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.																												.	.
Template SS confidence
		760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.				.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.			800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.