Job Description P13036 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:33:31 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 632 % Identity 14% Template c1xkwA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:fe(iii)-pyochelin receptor; PDBTitle: pyochelin outer membrane receptor fpta from pseudomonas2 aeruginosa Resolution 2.00 Å

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		111	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	D	A	L	T	V	V	G	D	W	L	G	D	A	R	E	N	D	V	F	E	H	A	G	A	R	D	V	I	R	R	E	D	F	A	K	T	G	A	T	T	M	R	E	V	L	N	R	I	P	G	V	S	A	P	E	N	N	G	T	G	S	H	D	L	A	M	N	F	G	I	R	G	L	N	P	R	L	A
Query Conservation
Alig confidence																																																																	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		S	T	S	A	T	Q	P	P	G	V	T	T	L	G	K	V	P	L	K	P	R	E	L	P	Q	S	A	S	V	I	D	H	E	R	L	E	Q	Q	N	L	F	S	L	D	E	A	M	Q	Q	A	T	G	V	T	V	Q	P	F	Q	L	L	T	T	.	.	.	.	.	A	Y	Y	V	R	G	F	K	V	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T				T	T		B		T	T	S	S		B		G	G	G		S	S													T	T			B							T	S	T	T								T	T			.	.	.	.	.					T	T				.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.						120	.	.	.	.	.	.	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	S	T	V	L	M	D	G	I	P	V	P	F	A	P	Y	G	Q	P	Q	L	S	L	A	P	V	S	L	G	N	M	D	A	I	D	V	V	R	G	G	G	A	V	R	Y	G	P	Q	S	V	G	G	V	V	N	F	V	T	R	A	I	P	Q	D	F	G	I	E	A	G	V	E	G	Q	L	S	P	T	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.													.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.													.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	D	S	F	E	L	D	G	V	P	A	L	L	.	.	.	.	.	G	N	T	A	S	S	P	Q	D	M	A	I	Y	E	R	V	E	I	L	R	G	S	N	G	L	L	H	G	T	G	N	P	A	A	T	V	N	L	V	R	K	R	P	Q	R	E	F	A	A	S	T	T	L	S	A	.	.	.	.	.	G
Template Known Secondary structure		.	.						T	T						.	.	.	.	.	S	S	T	T					B		T	T									S			T	T	T	T		S			S	S												S	S										.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.													.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
				129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140						.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.						.
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Q	N	N	P	K	E	T	H	N	L	M	V	G	G	T	A	D	N	G	F	G	T	A	L	L	Y	S	G	T	R	G	S	D	W	R	E	H	S	A	T	R	I	D	D	L	M	L	K	S	K	Y	A	P	D	E	V	H	T	F	N	S	L	L	Q	Y	Y	D	G	E	A	D	M	P	G	G	L	S	R	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	W	D	R	Y	R	A	E	V	D	V	G	G	P	L	S	A	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	E	D	R	D	Y	F	Y	D	V	A	D	Q	G	T	R	L	L	Y	G	V	T	E	F	D	L	S	P	D	T	L	L	T	V	G	A	Q	Y	Q	H	I	D	S	I	T	N	M	A	G	V	P	M
Template Known Secondary structure		T	T	T												S	S	S	S	S	S															S	S	S	S																		T	T																		S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.														.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Y	D	A	D	R	W	Q	S	T	R	P	Y	D	R	F	W	G	R	R	K	L	A	S	L	G	Y	Q	F	Q	P	D	S	Q	H	K	F	N	I	Q	G	F	Y	T	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	S	G	Y	L	E	Q	G	K	R	I	T	L	S	P	R	N	Y	W	V
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	K	D	G	S	N	L	G	L	S	R	D	T	Y	L	D	V	D	W	D	R	F	K	W	D	T	Y	R	A	F	G	S	L	E	Q	Q	L	G	G	G	W	K	G	K	V	S	A	E	Y	Q	E	A	D	S	R	L	R	Y	A	G	S	F	G	A	I	D	P	Q	T	G	D	G	G	Q	L	M	G	A	A	Y
Template Known Secondary structure		B	T	T	S							T	T				B		T	T																				T	T																							S		B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	I	E	P	R	Y	S	Q	I	F	M	I	G	P	S	A	H	E	V	G	V	G	Y	R	Y	L	N	E	S	T	H	E	M	R	Y	Y	T	A	T	S	S	G	Q	L	P	S	G	S	S	P	Y	D	R	D	T	R	S	G	T	E	A	H	A	W	Y	L	D	D	K	I	D	I	G	N	W	T	I	T	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	F	K	S	I	Q	R	S	L	D	A	N	L	N	G	P	V	R	L	F	G	L	T	H	E	L	L	G	G	V	T	Y	A	Q	G	E	T	R	Q	D	T	A	R	F	L	N	L	P	N	T	P	V	N	V	Y	R	W	D	P	H	G	V	P	R	P	Q	I	G	Q	Y	T	S	P	G	T	T	T	T	T	Q
Template Known Secondary structure																					T	T																							B	S	S								T	T	T			S	S	S						B				B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.		.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		G	M	R	F	E	H	I	E	S	Y	Q	N	N	A	I	T	G	T	H	E	E	V	S	Y	N	A	P	L	P	A	L	N	V	L	Y	H	L	T	D	S	W	N	L	Y	A	N	T	E	G	S	F	G	T	V	Q	Y	S	Q	I	G	K	A	V	Q	.	S	G	N	V	E	P	E	K	A	R	T	W	E	L	G
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence																																																																		.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	L	Y	A	L	G	R	I	K	L	A	E	P	L	T	L	V	V	G	G	R	E	S	W	W	D	Q	D	T	P	A	T	R	F	K	P	G	R	Q	F	T	P	Y	G	G	L	I	W	D	F	A	R	D	W	S	W	Y	V	S	Y	A	E	V	Y	Q	P	P	L	S	P	V	E	G	K	T	Y	E	T	G
Template Known Secondary structure														T	T																	S	S																					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
		577	.	.	580			.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.																																																																										.
Query SS confidence						.	.																																																																										.
Query Sequence		T	R	Y	D	.	.	D	G	A	L	T	A	E	M	G	L	F	L	I	N	F	N	N	Q	Y	D	S	N	Q	T	N	D	T	V	T	A	R	G	K	T	R	H	T	G	L	E	T	Q	A	R	Y	D	L	G	T	L	T	P	T	L	D	N	V	S	I	Y	A	S	Y	A	Y	V	N	A	E	I	R	E	K	.
Query Conservation						.	.																																																																										.
Alig confidence						.	.																																																																										.
Template Conservation
Template Sequence		I	K	G	E	L	A	D	G	R	L	N	L	S	L	A	A	F	R	I	D	L	E	N	N	P	Q	E	D	P	D	H	P	G	P	P	N	N	P	F	Y	I	S	G	G	K	V	R	S	Q	G	F	E	L	E	G	T	G	Y	L	T	P	Y	W	S	L	S	A	G	Y	T	Y	T	S	T	E	Y	L	K	D	S
Template Known Secondary structure							G	G	G	T																				S	S	S			S	T	T																									T	T																		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
			654	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.					.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																									.	.	.	.
Query SS confidence		.																									.	.	.	.
Query Sequence		.	G	D	T	Y	G	N	L	V	P	F	S	P	K	H	K	G	T	L	G	V	D	Y	K	P	.	.	.	.	G	N	W	T	F	N	L	N	S	D	F	Q	S	S	Q	F	A	D	N	A	N	T	V	K	E	S	A	D	G	S	T	G	R	I	P	G	F	M	L	W	G	A	R	V	A	Y	D	F	G	P	Q
Query Conservation		.																									.	.	.	.
Alig confidence		.																									.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Sequence		Q	N	D	S	G	T	R	Y	S	T	F	T	P	R	H	L	L	R	L	W	S	N	Y	D	L	P	W	Q	D	R	R	W	S	V	G	G	G	L	Q	A	Q	S	D	Y	S	V	D	Y	R	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	S	M	R	Q	G	G	Y	A	L	V	N	M	R	L	G	Y	K	I	D	.	.
Template Known Secondary structure		T	S		T	T		B	S		T	T	S		S												S																							T	T		.	.	.	.	.	.	.	.																		S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template SS confidence
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.									.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
		729	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	D	L	N	L	A	F	G	V	K	N	I	F	D	Q	D	Y	F	I	R	S	Y	D	D	N	N	K	G	I	Y	A	G	Q	P	R	T	L	Y	M	Q	G	S	L	K	F
Query Conservation
Alig confidence		.																						.
Template Conservation		.																						.
Template Sequence		.	E	H	W	T	A	A	V	N	V	N	N	L	F	D	R	T	Y	Y	Q	S	L	.	S	N	P	N	W	N	N	R	Y	G	E	P	R	S	F	N	V	S	L	R	G	A	F
Template Known Secondary structure		.	S	S									S	T	T									.			T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure		.																						.
Template SS confidence
			677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.		.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720