Job Description P13482 Confidence 99.31% Date Thu Jan 5 11:33:37 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 310 % Identity 15% Template d1ulva1 SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases Bacterial glucoamylase C-terminal domain-like Resolution 2.42

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		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.		.	.	.		.			160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.					.	.	.	200	.	.	.	.	.			.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure																.				.		.	.																																.							.	.	.	.										.	.
Query SS confidence																.				.		.	.																																.							.	.	.	.										.	.
Query Sequence		L	P	E	P	Y	V	V	P	G	G	R	F	R	E	.	V	Y	Y	.	W	.	.	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	H	W	D	K	V	A	D	M	V	A	N	F	A	H	E	I	D	T	.	Y	G	H	I	P	N	.	.	.	.	G	N	R	S	Y	Y	L	S	R	.	.	S	Q	P	P	F
Query Conservation																.				.		.	.																																.							.	.	.	.										.	.
Alig confidence																.				.		.	.																																.							.	.	.	.										.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	W	G	Q	A	A	S	A	E	T	H	R	E	G	Y	H	A	V	W	A	R	D	M	Y	Q	S	V	T	A	L	L	A	A	G	D	E	E	A	A	A	R	G	V	E	W	L	F	T	Y	Q	Q	Q	P	D	G	H	F	P	Q	T	S	R	V	D	G	T	I	G	Q	N	G	I	Q	L	D	E	T	A	F
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	G	S			S	S				T	T		S	B																T																T			T	T	S				S		B		T	T	S		B						B	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	L	M	V	E	L	L	A	Q	H	E	G	D	A	A	L	K	Q	Y	L	P	Q	M	Q	K	E	Y	A	Y	W	M	D	G	V	E	N	L	Q	A	G	Q	Q	E	K	R	V	V	K	L	Q	D	G	T	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	P	E	S	W	V	E	D	I	A	T	A	K	S
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	I	L	L	A	N	Q	I	G	R	T	D	A	G	.	.	.	.	F	Y	R	N	E	L	K	P	A	A	D	Y	L	V	A	A	G	P	K	T	P	Q	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T						.	.	.	.					T													S		B	S	B		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.					.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	P	N	R	P	A	T	E	I	Y	R	D	L	R	S	A	A	A	S	G	W	D	F	S	S	R	W	M	D	N	P	Q	Q	L	N	T	L	R	T	T	S	I	V	P	V	D	L	N	S	L	M	F	K	M	E	K	I	L	A	R	A	S	K	A	A	G	D	N	A	M	A	N	Q	Y	E	T	L	A	N	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	E	E	T	G	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	S	T	L	A	S	Q	I	A	A	L	A	A	A	A	D	I	A	G	K	N	G	D	A	G	S	A	A	V	Y	R	A	T	A	D	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S			B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						429	430	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.			.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Query Sequence		R	Q	K	G	I	E	K	Y	L	W	N	D	Q	Q	G	W	Y	A	D	Y	D	L	K	S	H	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R	N	Q	L	T	A	A	A	L	F	P	L	Y	V	N	A	A	A	K	.	.	D	R	A	N	K	M	A	T	A	T	K
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	Q	R	S	T	E	K	W	M	F	T	T	N	G	P	V	G	D	G	K	Y	Y	L	R	I	S	A	T	G	N	P	N	D	G	A	T	R	D	W	G	N	G	A	G	V	H	P	E	N	A	V	L	D	G	G	F	L	E	F	V	R	L	G	V	K	A	P	A	D	P	Y	V	A	D	S	L	A	E	T	D
Template Known Secondary structure					T								S	S		S	S	T	T	S					S			S	S	S		T	T	S							S	T	T						G	G	G			B	G	G	G	G					T	T	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
		428	.	430	.			.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.						.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure						.	.																						.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.																						.	.	.	.	.
Query Sequence		T	H	L	L	.	.	Q	P	G	G	L	N	T	T	S	V	K	S	G	Q	Q	W	D	A	P	N	G	.	.	.	.	.	W	A	P	L	Q	W	V	A	T	E	G	L	Q	N	Y	G	Q	K	E	V	A	M	D	I	S	W	H	F	L	T	N	V	Q	H	T	Y	D	R	E	K	K	L	V	E	K	Y	D	V
Query Conservation						.	.																						.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	I	S	Q	E	T	P	G	G	R	M	W	H	R	Y	T	Y	D	G	Y	G	E	K	A	D	G	S	P	W	D	G	T	G	I	G	R	L	W	P	L	L	S	G	E	R	G	E	Y	A	L	A	N	G	Q	D	A	L	P	Y	L	E	T	M	H	S	A	A	N	A	G	Y	M	I	P	E	Q	V	W	D
Template Known Secondary structure									T	T						S	B	T	T				S			T	T	S				S	S						B		T													T	T													T	S		T	T					S		B	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		553	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.				.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.
Query Sequence		S	T	T	G	T	G	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	.	.	.	F	G	W	T	N	G	V	T	L	K	M	L
Query Conservation																			.	.	.
Alig confidence																			.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	D	E	P	T	S	Y	G	H	E	L	G	R	S	T	G	S	A	S	P	L	S	W	A	M	A	Q	Y	V	R	L	A
Template Known Secondary structure			S	S			S	S				B	T	S	B		S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		633	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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