Job Description P13482 Confidence 99.77% Date Thu Jan 5 11:33:37 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 297 % Identity 12% Template d1lf6a1 SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases Bacterial glucoamylase C-terminal domain-like Resolution 2.10

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.					.	.	200	.	.	.	.	.			.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.									.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.									.	.
Query Sequence		E	P	Y	V	V	P	G	G	R	F	R	E	V	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	H	W	D	K	V	A	D	M	V	A	N	F	A	H	E	I	D	T	Y	G	H	I	P	N	G	.	.	.	.	N	R	S	Y	Y	L	S	R	.	.	S	Q	P	P	F	F	A	L	M	V	E	L
Query Conservation																																																								.	.	.	.									.	.
Alig confidence																																																								.	.	.	.									.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	R	D	D	N	T	G	G	Y	H	L	V	W	S	R	D	L	Y	H	V	A	N	A	F	I	A	A	G	D	V	D	S	A	N	R	S	L	D	Y	L	A	K	V	V	K	D	N	G	M	I	P	Q	N	T	W	I	S	G	K	P	Y	W	T	G	I	Q	L	D	E	Q	A	D	P	I	I	L	S	Y	R
Template Known Secondary structure		G	S		S	S	S			G	G	G	S	B																T																				S	S			S		B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.
Query SS confidence									.
Query Sequence		L	A	Q	H	E	G	D	.	A	A	L	K	Q	Y	L	P	Q	M	Q	K	E	Y	A	Y	W	M	D	G	V	E	N	L	Q	A	G	Q	Q	E	K	R	V	V	K	L	Q	D	G	T	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	P	E	S	W	V	E	D	I	A	T	A	K	S	N	P	N	R	P	A
Query Conservation									.
Alig confidence									.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	R	Y	D	L	Y	D	S	L	V	K	P	L	A	D	F	I	I	K	I	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T		G	G	G	T	T	T	T													S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	E	I	Y	R	D	L	R	S	A	A	A	S	G	W	D	F	S	S	R	W	M	D	N	P	Q	Q	L	N	T	L	R	T	T	S	I	V	P	V	D	L	N	S	L	M	F	K	M	E	K	I	L	A	R	A	S	K	A	A	G	D	N	A	M	A	N	Q	Y	E	T	L	A	N	A	R	Q	K	G	I	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	G	Q	E	R	W	E	E	I	G	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	A	T	M	A	A	E	V	A	G	L	T	C	A	A	Y	I	A	E	Q	N	K	D	Y	E	S	A	Q	K	Y	Q	E	K	A	D	N	W	Q	K	L	I	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B	S	S		T	T	S	S			B	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.											.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.			.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Query Sequence		K	Y	L	W	N	D	Q	Q	G	W	Y	A	D	Y	D	L	K	S	H	K	V	R	N	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	T	A	A	A	L	F	P	L	Y	V	N	A	A	A	K	.	.	D	R	A	N	K	M	A	T	A	T	K	T	H	L	L	Q	P
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	L	T	Y	T	E	N	G	P	L	G	N	G	Q	Y	Y	I	R	I	A	G	L	S	D	P	D	A	D	F	M	I	N	I	A	N	G	G	G	V	Y	D	Q	K	E	I	V	D	P	S	F	L	E	L	V	R	L	G	V	K	S	A	D	D	P	K	I	L	N	T	L	K	V	V	D	S	T	I	K	V	D
Template Known Secondary structure							S	S		S	S	T	T	S					S		B	S	S	S		T	T	S							T	T	T	T					G	G	G				G	G	G	G					T	T	S	S		T	T															S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
		434	.	.	.	.	.	440			.	.	.	.	.	.											.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure									.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	L	N	T	T	S	.	.	V	K	S	G	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	D	A	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	V	A	T	E	G	L	Q	N	Y	G	Q	K	E	V	A	M	D	I	S	W	H	F	L	T	N	V	Q	H	T	Y	D	R	E	K	K	L	V	E	K	Y	D	V	S
Query Conservation									.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.																																		.	.	.	.
Template Conservation																															.																																		.	.	.	.
Template Sequence		T	P	K	G	P	S	W	Y	R	Y	N	H	D	G	Y	G	E	P	S	K	T	E	L	Y	H	G	A	G	K	.	G	R	L	W	P	L	L	T	G	E	R	G	M	Y	E	I	A	A	G	K	D	A	T	P	Y	V	K	A	M	E	K	F	A	.	.	.	.	N	E	G	G	I	I	S	E	Q	V	W	E	D
Template Known Secondary structure			T	T						S	S	T	T				S		S	B	T	T	B			S	S	S	S		.			B	B														T	T														S	.	.	.	.		T	T	S				S		B		T	T
Template Predicted Secondary structure																															.																																		.	.	.	.
Template SS confidence
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.		.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.					.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	T	G	T	G	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	T	L	K	M	L	D	L	I
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	L	P	T	D	S	A	.	.	.	.	.	.	S	P	L	N	W	A	H	A	E	Y	V	I	L	F	A	S	N
Template Known Secondary structure		T			B		S	S		.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		642	.	.	.	.	.	.	.							650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions