Job Description P13482 Confidence 98.03% Date Thu Jan 5 11:33:37 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 322 % Identity 20% Template d1gaia_ SCOP info alpha/alpha toroid Six-hairpin glycosidases Glucoamylase Resolution 1.70

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		156	.	.	.			160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.							.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200									.	.													.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.													.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.													.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Y	Y	W	.	.	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	.	.	.	.	.	.	G	H	W	D	K	V	A	D	M	V	A	N	F	A	H	E	I	D	T	Y	G	H	I	P	N	G	N	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	R	S	Q
Query Conservation						.	.													.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.													.	.	.	.	.	.																						.	.							.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		F	Y	T	W	T	R	D	S	G	L	V	I	K	T	L	V	D	L	F	R	N	G	D	T	D	L	L	S	T	I	E	H	Y	I	S	S	Q	A	I	I	Q	G	V	S	N	.	.	P	S	G	D	L	S	S	G	G	L	G	E	P	K	F	N	V	D	E	T	A	Y	T	G	S	W	G	R	P	Q	R	D	G
Template Known Secondary structure			S																			T	T		G	G	G																			B	.	.	T	T	B		T	T	T	T	G	G	G						T	T	S		B			S			S				T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230					.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure																			.							.	.	.	.
Query SS confidence																			.							.	.	.	.
Query Sequence		P	P	F	F	A	L	M	V	E	L	L	A	Q	H	E	G	D	.	A	A	L	K	Q	Y	.	.	.	.	L	P	Q	M	Q	K	E	Y	A	Y	W	M	D	G	V	E	N	L	Q	A	G	Q	Q	E	K	R	V	V	K	L	Q	D	G	T	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	P	E	S	W	V
Query Conservation																			.							.	.	.	.
Alig confidence																			.							.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	A	L	R	A	T	A	M	I	G	F	G	Q	W	L	L	D	N	G	Y	T	S	A	A	T	E	I	V	W	P	L	V	R	N	D	L	S	Y	V	A	Q	Y	W	N	Q	T	G	Y	D	L	W	E	E	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																			T	T								T																T	T	S					T	T	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	I	A	T	A	K	S	N	P	N	R	P	A	T	E	I	Y	R	D	L	R	S	A	A	A	S	G	W	D	F	S	S	R	W	M	D	N	P	Q	Q	L	N	T	L	R	T	T	S	I	V	P	V	D	L	N	S	L	M	F	K	M	E	K	I	L	A	R	A	S	K	A	A	G	D	N	A	M	A	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	S	S	F	F	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	Q	H	R	A	L	V	E	G	S	A	F	A	T	A	V	G	S	S	.	.	C	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	T	T			.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
																												182	.	.	.	.	.	.	.																							190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.			210	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.								.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Y	E	T	L	A	N	A	R	Q	K	G	I	E	K	Y	L	W	N	D	Q	Q	G	W	Y	A	D	Y	D	L	K	S	H	K	V	R	N	Q	L	T	A	A	.	.	.	.	.	.	.	A	L	F	P	L	Y	V	N	A	A	A	K	D	R	A	N	K	M	A	T	A	T	K	T	H	L	L	Q	P	G	G
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.
Template Sequence		W	C	D	S	Q	A	P	Q	I	L	C	Y	L	Q	S	.	F	W	T	G	S	Y	I	L	A	N	F	D	S	S	R	S	G	K	D	T	N	T	L	L	G	S	I	H	T	F	D	P	E	A	G	C	D	D	S	T	F	Q	P	C	S	P	R	A	L	A	N	H	K	E	V	V	D	S	F	R	S	I	Y	T
Template Known Secondary structure															G	G	.	G	B		S	S	S	B		S			S			S					T								T	T			T	T			S		T	T	T	T		T	T	S													T	T	T	T	T		G
Template Predicted Secondary structure																	.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		436											.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	T	S	V	K	S	G	Q	Q	W	D	A	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	V	A	T	E	G	L	Q	N	Y	G	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.
Template Sequence		L	N	D	G	L	S	D	S	E	A	V	A	V	G	R	Y	P	E	D	S	Y	Y	N	G	.	N	P	W	F	L	C	T	L	A	A	A	E	Q	L	Y	D	A	L	Y	Q	W	D	K	Q	G	S	L	E	I	T	D	V	S	L	D	F	F	K	A	L	Y	S	G	A	A	T	G	T	Y	S	S	S	S	S	T
Template Known Secondary structure		G	G	T	T			T	T	S						S		T	T			G	G	G	S	.			B																						T						T	T	T									T	T			S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																										.
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.		.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
							471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	E	V	A	M	D	I	S	W	H	F	L	T	N	V	Q	H	T	Y	D	R	E	K	K	L	V	E	K	Y	D	V	S	T	T	G	T	G	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	T	L	K	M	L	D	L	I	C	P	K	E	Q	P	C	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.																																																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	S	I	V	S	A	V	K	T	F	A	D	G	F	V	S	I	V	E	T	H	A	A	S	N	G	S	L	S	E	Q	F	D	K	S	D	.	.	.	.	.	.	.	G	D	E	L	S	A	R	D	L	T	W	S	Y	A	A	L	L	T	A	N	N	R	R	N	S	V	V	P	P	S	W	G	E	T	S	A
Template Known Secondary structure																								S		T	T					S				T	T	T	.	.	.	.	.	.	.					S	S	S	S																T	T							S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.								.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
		540	.	.	.	.	.		.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.
Query SS confidence								.
Query Sequence		D	N	V	P	A	T	.	R	P	T	V	K	S	A	T	T	Q	P	S	T	K	E	A	Q	P	T
Query Conservation								.
Alig confidence								.
Template Conservation
Template Sequence		S	S	V	P	G	T	C	A	A	T	S	A	S	G	T	Y	S	S	V	T	V	T	S	W	P	S
Template Known Secondary structure						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		443	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.