Job Description P45539 Confidence 98.20% Date Thu Jan 5 12:02:59 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 423 % Identity 10% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.				.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.
Query Sequence		G	F	W	A	V	L	A	I	A	V	G	T	T	V	G	S	G	I	F	V	S	V	G	E	V	A	K	A	A	G	T	P	W	L	T	V	.	.	.	L	A	F	V	I	G	G	L	I	V	I	P	Q	M	C	V	Y	A	E	L	S	T	A	Y	P	E	N	G	A	D	Y	V	Y	L	K	N	A	G	S	R	P
Query Conservation																																						.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.																												.
Template Conservation																																																																				.
Template Sequence		T	R	L	G	L	I	L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	Y	G	G	A	Q	G	H	G	.	T	T	P	A	I	F	Y	L	L	W	R	N	R
Template Known Secondary structure															S	S					T									T	T	T														T																	T	T	T			.	S									S		S
Template Predicted Secondary structure																																																																				.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.		.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	A	F	L	S	G	W	A	S	F	W	A	N	D	A	P	S	L	S	I	M	A	L	A	I	V	S	N	L	G	F	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	D	P	L	L	G	K	F
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	K	I	L	G	V	F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G	V	P	K	G	D	E	P	I	L	K	P	S	L	F	A	Y	I
Template Known Secondary structure								T																														T																										T			S	S	S	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.						.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																											.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.																											.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	A	G	L	I	I	A	F	M	L	L	H	L	R	S	V	E	G	.	G	A	A	F	Q	T	L	I	T	I	A	K	I	I	P	F	T	I	V	I	G	L	G	I	F	W	.	.	.	.	.	F	K	A	E	N	F	A	A	P	T	T	T	A	I	G	A	T	G	S	F	M	A	L	L	A	G	I	S	A
Query Conservation																					.																											.	.	.	.	.
Alig confidence																					.																											.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	F	L	I	T	M	F	I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P	D	F	E	K	L	K	D	P	G	V	W	I	A	A	V	G	Q
Template Known Secondary structure															T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S			T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		204	.	.	.	.		.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.									.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	S	W	S	Y	.	T	G	M	A	S	I	C	Y	M	T	G	E	I	K	N	P	G	K	T	M	P	R	A	L	I	G	S	C	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	V	L	Y	T	L	L	A	L	V	I	S	G	L	M	P	F	D	K	L	A	N	S	E	T	P	I	S	D	A	L	T	W	I	P
Query Conservation							.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	F	F	T	L	S	L	G	F	G	A	I	I	T	Y	A	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V	A	I	A	K	A	G	A	F	N	L	G	F	I	T	L	P	A	I
Template Known Secondary structure							T	T	T	S	S							T	T	S		T	T	S																			T	T																										S	S					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	G	S	T	A	G	I	F	V	A	I	T	A	M	I	V	I	L	G	S	L	S	S	C	V	M	Y	Q	P	R	L	E	Y	A	M	A	K	D	N	L	F	F	K	C	F	G	H	V	H	P	K	Y	N	T	P	D	V	S	I	I	L	Q	G	A	L	G	I	F	F	I	F	V	S	D	L	T	S	L	L
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	Q	T	A	G	G	T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	L	.	.	.	.	.	.	K	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A	I	V	F	F	S	A	H	L	V	M	F	L	N	K	S	L	D	E	M	D
Template Known Secondary structure			T	T	S	T	T																																		T	S	.	.	.	.	.	.																									B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.							.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.								.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.							.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.									410	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Y	F	T	L	V	M	C	F	K	N	T	L	T	F	G	S	I	I	.	.	.	.	.	.	.	W	C	R	K	R	D	D	Y	K	P	L	W	R	T	P	A	F	G	.	.	.	.	.	.	L	M	T	T	L	A	I	A	S	S	L	I	L	V	A	S	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	V	W	A	P
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G	L	T	E	L	I	I	F	F	W	I	F	G	A	D	K	A	W	E	E	I	N	R	G	G	I	I	K	V	P	R	I	Y	Y	Y	V	M	R	Y	I	T	P	A	F	L	A	V	L	L	V	V	W	A	R	E	Y	I	P	K	I	M	E	E	T	H	W	T	V	W
Template Known Secondary structure				T	T	T																T	T	S											T	T		S	S				T								T																	T							S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	G	L	I	C	A	V	I	V	I	A	T	G	L	P	A	Y	A	F	W	A	K	R	S	R	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	T	R	F	Y	I	I	G	L	F	L	F	L	T	F	L	V	F	L	A	E	R	R	R	N	H	E
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.