Job Description P05852 Confidence 98.86% Date Thu Jan 5 10:59:01 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 304 % Identity 22% Template c3ifrB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:carbohydrate kinase, fggy; PDBTitle: the crystal structure of xylulose kinase from rhodospirillum rubrum Resolution 2.30 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		R	V	L	G	I	E	T	S	C	D	E	T	G	I	A	I	Y	D	D	E	K	G	L	L	A	N	Q	L	Y	S	Q	V	K	L	H	A	D	Y	G	G	V	V	P	E	L	A	S	R	D	H	V	R	K	T	V	P	L	I	Q	A	A	L	K	E	S	G	L	T	A	K	D	I	D	A	V	A	Y	T	A	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																																		.	.																														.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		Q	V	I	G	L	D	I	G	T	T	S	T	I	A	I	L	V	R	L	P	D	T	V	V	A	V	A	S	R	P	T	T	L	S	S	P	H	P	G	W	A	E	E	D	P	A	Q	W	.	.	W	D	N	A	R	A	V	L	A	E	L	K	T	T	A	G	E	S	D	W	R	P	G	G	I	C	V	T	G	X
Template Known Secondary structure										S	S									T	T	T													B		S	S	T	T										.	.																T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	A	V	V	L	L	D	D	R	G	A	V	L	R	P	S	I	Q	Q	S	D	G	R	C	G	D	E	V	A	E	L	R	A	E	V	D	S	E	A	F	L	A	R	T	G	N	G	V	T	Q	Q	L	V	T	A	K	L	R	W	I	E	R	H	E	P	A	V	F	G	A	I	A	T	V	C	G	S	Y	D
Template Known Secondary structure		S	S		B					T	T	S		B		S					T	T			T	T											S										S	S		S	S	T	T	S																		T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
																																																			81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	G	L	V	G	A	L	L	V	G	A	T	V	G	R	S	L	A	F	A	W	D	V	P	A	I	P	V	H	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template Conservation																																																										.
Template Sequence		Y	I	N	X	L	L	T	G	E	R	V	V	D	R	N	W	A	L	E	G	G	F	I	D	L	A	S	G	T	V	E	A	D	L	V	A	L	A	H	I	P	P	S	A	V	P	P	A	H	P	T	H	R	V	L	G	.	A	V	T	A	E	A	A	A	L	T	G	L	P	T	G	L	P	V	Y	G	G	A	A
Template Known Secondary structure																						T				T	T	T	T										T	T	S		G	G	G	S						T	T	S				.														T	T
Template Predicted Secondary structure																																																										.
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.		.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		112	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160													.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	E	G	H	L	L	A	P	M	L	E	D	N	P	P	E	F	P	F	V	A	L	L	V	S	G	G	H	T	Q	L	I	S	V	T	G	I	G	Q	Y	E	L	L	G	E	S	I	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	G	E	A	F	D	K	T	A	K	L	L	G	L	D	Y	P	G
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.													.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.													.	.	.
Template Sequence		D	H	I	.	.	A	S	A	L	A	A	G	I	T	R	P	G	.	.	.	D	V	L	L	K	F	G	G	A	G	D	I	I	V	A	S	A	T	A	K	S	R	L	Y	L	D	Y	H	L	V	P	G	L	Y	A	P	N	G	C	X	A	A	T	G	S	A	L	N	W	L	A	K	L	L	A	P	E	A	G	E
Template Known Secondary structure					.	.						T	T			S	T	T	.	.	.							S	S	S							B	S	S						B			B		S	S	T	T		B							S		S	S											S	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.													.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.			.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.				260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		180	.			.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.			.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.														.	.
Query SS confidence				.	.														.	.
Query Sequence		G	P	.	.	L	L	S	K	M	A	A	Q	G	T	A	G	R	.	.	F	V	F	P	R	P	M	T	D	R	P	G	L	D	F	S	F	S	G	L	K	T	F	A	A	N	T	I	R	D	N	G	T	D	D	Q	T	R	A	D	I	A	R	A	F	E	D	A	V	V	D	T	L	M	I	K	C	K	R	A	L
Query Conservation				.	.														.	.
Alig confidence				.	.														.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	H	A	Q	L	D	A	L	A	A	E	V	P	A	G	A	D	G	L	V	C	L	P	Y	F	L	G	D	P	F	A	S	G	T	F	T	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	S	H	T	R	G	H	L	W	R	A	L	L	E	A	V	A	L	A	F	R	H	H	V	A	V	L	D
Template Known Secondary structure													T	S		T	T	G	G	G							T	T			T	T							S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360													.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		256	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
Predicted Secondary structure						.																																																																.
Query SS confidence						.																																																																.
Query Sequence		D	Q	T	G	.	F	K	R	L	V	M	A	G	G	V	S	A	N	R	T	L	R	A	K	L	A	E	M	M	K	K	R	R	G	E	V	F	Y	A	R	P	E	F	C	T	D	N	G	A	M	I	A	Y	A	G	M	V	R	F	K	A	G	A	T	A	D	L	G	.	V	S	V	R	P	R	W	P	L	A
Query Conservation						.																																																																.
Alig confidence						.																									.	.	.										.	.	.	.																								.
Template Conservation																															.	.	.										.	.	.	.
Template Sequence		D	I	G	H	A	P	Q	R	F	F	A	S	D	G	G	T	R	S	R	V	W	X	G	I	X	A	D	V	L	.	.	.	Q	R	P	V	Q	L	L	A	N	.	.	.	.	P	L	G	S	A	V	G	A	A	W	V	A	A	I	G	G	G	D	D	L	G	W	D	D	V	R	T	G	E	K	I	T	P	D
Template Known Secondary structure				T										S	G	G	G	G													.	.	.	T	S								.	.	.	.	T	T														T	T	S	S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.										.	.	.	.
Template SS confidence
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.				.	.	.	.	.	430	.	.	.					.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.