Job Description P05852 Confidence 98.61% Date Thu Jan 5 10:59:01 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 301 % Identity 17% Template c3gbtA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:gluconate kinase; PDBTitle: crystal structure of gluconate kinase from lactobacillus acidophilus Resolution 2.40 Å

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		1	.		.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		M	R	.	V	L	G	I	E	T	S	C	D	E	T	G	I	A	I	Y	D	D	E	K	G	L	L	A	N	Q	L	Y	S	Q	V	K	L	H	A	D	Y	G	G	V	V	P	E	L	A	S	R	D	H	V	R	K	T	V	P	L	I	Q	A	A	L	K	E	S	G	L	T	A	K	D	I	D	A	V	A	Y	T
Query Conservation				.
Alig confidence				.																																																.	.																	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.																	.	.	.
Template Sequence		L	K	Y	I	I	G	X	D	V	G	T	T	A	T	K	G	V	L	Y	D	I	N	G	K	A	V	A	S	V	S	K	G	Y	P	L	I	Q	T	K	V	G	Q	A	E	E	D	P	K	L	I	.	.	F	D	A	V	Q	E	I	I	F	D	L	T	Q	K	I	D	.	.	.	G	K	I	A	A	I	S	W	S
Template Known Secondary structure												S	S									T	T	S													B		S	S	T	T										.	.														T		S	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50			.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.				.	.	.	70	.	.	.	.	.
		80
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	X	H	S	L	I	G	L	G	S	D	D	E	L	L	T	N	S	I	T	W	A	D	N	C	A	K	S	I	V	Q	D	A	K	N	R	G	F	A	Q	Q	I	Y	R	K	T	G	X	P	X	H	P	X	A	P	I	Y	K	L	L	W	L	K	N	K	K	T	E	V	F	S	Q	A	Q	K	W	I	G	I
Template Known Secondary structure				S	S		B					T	T	S		B	S	S					T	T			T	T										T	T													S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
																																																					81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	G	L	V	G	A	L	L	V	G	A	T	V	G	R	S	L	A	F	A	W	D	V	P	A	I	P	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Template Conservation																																																														.
Template Sequence		K	E	Y	I	I	F	R	L	T	G	K	L	V	T	D	T	T	X	A	A	G	T	G	I	L	N	L	K	T	L	T	W	D	Q	E	L	L	D	I	L	K	I	K	K	E	Q	L	P	K	I	A	Q	P	T	K	V	I	F	P	I	.	K	T	E	Y	V	K	K	L	G	I	D	S	D	T	K	I	I	L	G
Template Known Secondary structure											S										T	T	T	T		B		T	T	T	S	S	B									T			G	G	G	S						T	T							.								T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																														.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.		.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.															.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	H	M	E	G	H	L	L	A	P	M	L	E	D	N	P	P	E	F	P	F	V	A	L	L	V	S	G	G	H	T	Q	L	I	S	V	T	G	I	G	Q	Y	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	E	S	I	D	D	A	A	G	E	A	F	D	K	T	A	K	L	L	G	L
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.													.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.													.	.
Template Sequence		A	S	D	G	Y	.	.	L	S	T	I	G	V	N	A	I	D	S	D	.	.	H	C	A	L	N	V	G	T	S	G	A	I	R	T	I	V	D	Q	P	K	I	D	P	S	A	S	Y	F	C	Y	P	A	D	K	T	H	Y	L	L	G	G	P	V	N	N	G	G	I	V	F	N	W	A	R	Q	T	L	F	D
Template Known Secondary structure							.	.					T	T	T			S	T	T	.	.							S	S	S								S	S					T	T			S							T	T									S		S												T
Template Predicted Secondary structure							.	.													.	.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.			240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.			.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	P	G	G	P	L	L	S	K	M	A	A	Q	G	T	A	G	R	F	V	F	P	R	P	M	T	D	R	P	G	L	D	F	S	F	S	G	L	K	T	F	A	A	N	T	I	R	D	N	G	T	D	D	Q	T	R	A	D	I	A	R	A	F	E	D	A	V	V	D	T	L	M	I	K	C	K	R	A	L
Query Conservation
Alig confidence																																		.	.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.
Template Sequence		A	D	E	T	P	Q	D	F	L	D	V	A	Q	T	A	P	A	G	S	R	N	L	I	F	L	P	Y	L	G	G	E	R	.	.	.	.	A	P	I	W	D	A	N	A	R	G	S	F	V	G	L	T	R	X	H	Q	K	P	E	X	A	R	A	V	I	E	G	I	I	F	N	L	Y	D	A	A	S	N	L	I
Template Known Secondary structure		T	T												T	S		T	T	G	G	G							T	T		B		.	.	.	.	T	T	T		B	T	T							S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.					.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		256	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		D	Q	T	G	.	F	K	R	L	V	M	A	G	G	V	S	A	N	R	T	L	R	A	K	L	A	E	M	M	K	K	R	R	G	E	V	F	Y	A	R	P	E	F	C	T	D	N	G	A	M	I	A	Y	A	G	M	V	R	F	K	A	G	A	T	A	D	L	G
Query Conservation						.
Alig confidence						.																									.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.										.	.	.	.
Template Sequence		K	N	T	K	K	P	V	A	I	N	A	T	G	G	F	L	K	S	D	F	V	R	Q	L	C	A	N	I	F	.	.	.	N	V	P	I	V	T	X	K	E	.	.	.	.	Q	Q	S	G	T	L	A	A	X	F	L	A	R	Q	A	L	G	L	N	Q	D	L	S
Template Known Secondary structure		T	T	S				S						S	G	G	G		S												.	.	.	T	S						S		.	.	.	.	S															T	T	S			S	G	G
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.										.	.	.	.
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.				.	.	.	.	420	.	.	.	.					.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.