Job Description P05852 Confidence 98.65% Date Thu Jan 5 10:59:01 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 299 % Identity 15% Template c3g25B_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:glycerol kinase; PDBTitle: 1.9 angstrom crystal structure of glycerol kinase (glpk) from2 staphylococcus aureus in complex with glycerol. Resolution 1.90 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		R	V	L	G	I	E	T	S	C	D	E	T	G	I	A	I	Y	D	D	E	K	G	L	L	A	N	Q	L	Y	S	Q	V	K	L	H	A	D	Y	G	G	V	V	P	E	L	A	S	R	D	H	V	R	K	T	V	P	L	I	Q	A	A	L	K	E	S	G	L	T	A	K	D	I	D	A	V	A	Y	T	A	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence																																														.	.																																		.
Template Conservation																																														.	.
Template Sequence		Y	I	L	S	I	D	Q	G	T	T	S	S	R	A	I	L	F	N	Q	K	G	E	I	A	G	V	A	Q	R	E	F	K	Q	Y	F	P	Q	S	G	W	V	E	H	D	.	.	A	N	E	I	W	T	S	V	L	A	V	X	T	E	V	I	N	E	N	D	V	R	A	D	Q	I	A	G	I	G	I	T	N	Q
Template Known Secondary structure										S	S									T	T	S													B			S	T	T						.	.																			S	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																														.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.			.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	T	T	V	V	W	D	K	H	T	G	R	P	I	Y	H	A	I	V	W	Q	S	R	Q	T	Q	S	I	C	S	E	L	K	Q	Q	G	Y	E	Q	T	F	R	D	K	T	G	L	L	L	D	P	Y	F	A	G	T	K	V	K	W	I	L	D	N	V	E	G	A	R	E	K	A	E	N	G	D	L	L	F
Template Known Secondary structure		S	S							T	T	T			B	S	S					T	T			T	T										T	T										S			S	S	T	T	S												S	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
																																																										81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	G	L	V	G	A	L	L	V	G	A	T	V	G	R	S	L	A	F	A	W	D	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	I	D	T	W	L	V	W	K	L	S	G	K	A	A	H	I	T	D	Y	S	N	A	S	R	T	L	X	F	N	I	H	D	L	E	W	D	D	E	L	L	E	L	L	T	V	P	K	N	X	L	P	E	V	K	A	S	S	E	V	Y	G	.	.	.	.	.	K	T	I	D	Y	H	F	Y	G	Q	E	V
Template Known Secondary structure													T	T	T											T	T	S	S	S			T	T	T	T										T	T			G	G	G							S						.	.	.	.	.				G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.						.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	I	P	V	H	H	M	E	G	H	L	L	A	P	M	L	E	D	N	P	P	E	F	P	F	V	A	L	L	V	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	T	Q	L	I	S	V	T	G	I	G	Q	Y	E	L	L	G	E	S	I	D	D	A	A	G	E	A	F	D	K
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.
Template Sequence		P	I	A	G	V	A	G	D	Q	Q	.	.	A	A	L	F	G	Q	A	C	F	E	R	G	D	V	K	N	T	Y	G	T	G	G	F	X	L	X	N	T	G	D	K	A	V	K	S	E	S	G	L	L	T	T	I	A	Y	G	I	D	G	K	V	N	Y	A	L	E	G	S	I	F	V	S	G	S	A	I	Q	W
Template Known Secondary structure												.	.						T	T			S	T	T							S	S	S								T	T	S					S	S	S										T	T											S		S
Template Predicted Secondary structure												.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.			.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	K	L	L	G	L	D	Y	P	G	G	P	L	L	S	K	M	A	A	Q	G	T	A	G	R	F	V	F	P	R	P	M	T	D	R	P	G	L	D	F	S	F	S	G	L	K	T	F	A	A	N	T	I	R	D	N	G	T	D	D	Q	T	R	A	D	I	A	R	A	F	E	D	A	V	V	D	T	L	M
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	D	G	L	R	X	I	N	S	A	P	Q	S	E	S	Y	A	T	R	V	D	S	T	E	G	V	Y	V	V	P	A	F	V	G	L	G	T	P	Y	W	D	S	E	.	.	.	.	.	.	A	R	G	A	I	F	G	L	T	R	G	T	E	K	E	H	F	I	R	A	T	L	E	S	L	C	Y	Q	T	R
Template Known Secondary structure					T	S				S	S	G	G	G							T	S	S			T	T							T	T		B		T	T	T		B	T	T	.	.	.	.	.	.										T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.							.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.			260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure													.	.
Query SS confidence													.	.
Query Sequence		I	K	C	K	R	A	L	D	Q	T	G	.	.	F	K	R	L	V	M	A	G	G	V	S	A	N	R	T	L	R	A	K	L	A	E	M	M	K	K	R	R	G	E	V	F	Y	A	R	P	E	F	C	T	D	N	G	A	M	I	A	Y	A	G	M	V	R	F	K	A	G	A	T	A	D	L	G
Query Conservation													.	.
Alig confidence													.	.																									.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.										.	.	.	.
Template Sequence		D	V	X	E	A	X	S	K	D	S	G	I	D	V	Q	S	L	R	V	D	G	G	A	V	K	N	N	F	I	X	Q	F	Q	A	D	I	V	.	.	.	N	T	S	V	E	R	P	E	I	.	.	.	.	Q	E	T	T	A	L	G	A	A	F	L	A	G	L	A	V	G	F	W	E	S	K	D
Template Known Secondary structure																S						S	G	G	G	G													.	.	.	T	S						S		.	.	.	.																T	T	S	S	S		T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.										.	.	.	.
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.				.	.	.	.	430	.	.	.	.					.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.