Job Description P56262 Confidence 99.87% Date Thu Jan 5 12:06:23 GMT 2012 Rank 97 Aligned Residues 232 % Identity 19% Template d1lnsa3 SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases PepX catalytic domain-like Resolution 2.20

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		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.							.	.	40	.			.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.					.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.					.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	T	I	V	Q	T	P	D	D	A	I	V	A	G	F	T	S	I	P	S	.	.	.	.	.	.	Q	G	D	N	.	.	M	P	A	Y	H	A	R	P	K	Q	S	D	G	P	L	P	V	V	I	V	V	Q	E	I	F	G	V	H	E	H	I	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.					.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.					.	.										.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.
Template Sequence		D	K	S	L	A	T	F	D	S	S	L	L	E	R	E	V	L	W	V	E	S	P	V	D	S	E	Q	R	G	E	N	D	L	I	K	I	Q	I	I	R	P	K	.	S	T	E	K	L	P	V	V	M	T	A	S	P	Y	H	L	G	I	N	D	K	A	N	D	L	A	L	H	D	M	N	V	E	L	E	E	K
Template Known Secondary structure		T				S		S		G	G	G											S			T	T		S	S	S													.		S	S										S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.		.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
																																									75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	C	R	R	L	A	L	E	G	Y	L	A	I	A	P	E	L	Y	F	R	E	G	D	P	N	D	F	A	D	I	P	T	L	L	S	G	L	V	A	K	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	S	H	E	I	H	V	E	Q	K	L	P	Q	K	L	S	A	K	A	K	E	L	P	I	V	D	K	A	P	Y	R	F	T	H	G	W	T	Y	S	L	N	D	Y	F	L	T	R	G	F	A	S	I	Y	V	A	G	V	G	T	R	S	S	D	G	F	Q	T	S	G	D	Y	Q	Q	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S																								S	S		S		B															T	T	T									T	T	S	T	T	S		S				T	T	S				.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.																.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Query Sequence		P	D	S	Q	V	L	A	D	L	D	H	V	A	S	W	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	G	G	D	V	H	R	L	M	I	T	G	F	C	W	G	G	R	I	T	W	L	Y	A	A	H	N	P	Q	L	K	A	A	V	A	W	Y	G	K	L	T	G	D	K	S	L	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Alig confidence		.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	I	Y	S	M	T	A	V	I	D	W	L	N	G	R	A	R	A	Y	T	S	R	K	K	T	H	E	I	K	A	S	W	A	N	G	K	V	A	M	T	G	K	S	Y	L	G	T	M	A	Y	G	A	A	T	T	G	V	E	G	L	E	L	I	L	A	E	A	G	I	S	S	W	Y	N	Y	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.												T	T	S	S				S	S	T	T								T	T											T											T	T	T		T	T								S			S	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
																																																																180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	P	K	Q	P	V	D	I	A	T	D	L	N	A	P	I	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	N	G	L	V	R	S	P	G	G	F	P	G	E	D	L	D	V	L	A	A	L	T	Y	S	R	N	L	D	G	A	D	F	L	K	G	N	A	E	Y	E	K	R	L	A	E	M	T	A	A	L	D	R	K	S	G	D	Y	N	Q	F	W	H	D	R	N	Y	L	I	N	T	D	K	V	K	A	D	V	L
Template Known Secondary structure		B	S	S	S	S	B				T	T		T	T												G	G	G	G	S																								T	T	T									T	T	B	G	G	G	G	G	G	G			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	Y	G	G	Q	D	N	S	I	P	Q	E	S	V	E	T	M	R	Q	A	L	R	A	A	N	A	K	A	E	I	I	V	Y	P	D	A	G	H	A	F	N	A	D	Y	R	P	S	Y	H	A	A	S	A	E	D	G	W	Q	R	M	L	E	W	F	K	Q	Y	G	G	K	K	S
Query Conservation
Alig confidence																								.														.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.														.													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	H	G	L	Q	D	W	N	V	T	P	E	Q	A	Y	N	F	W	K	A	L	.	P	E	G	H	A	K	H	A	F	L	H	R	G	.	A	H	I	Y	M	N	S	W	Q	S	I	D	.	.	.	.	.	.	.	F	S	E	T	I	N	A	Y	F	V	A	K	L	L	D	R	D
Template Known Secondary structure						T	T			S	S		T										S	.		T	T									S		.	S	S				T	T		S	S			.	.	.	.	.	.	.														T	T
Template Predicted Secondary structure																								.														.													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.		.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.		.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.								.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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