Job Description P56262 Confidence 99.82% Date Thu Jan 5 12:06:23 GMT 2012 Rank 107 Aligned Residues 222 % Identity 17% Template c3i1iA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:homoserine o-acetyltransferase; PDBTitle: x-ray crystal structure of homoserine o-acetyltransferase from2 bacillus anthracis Resolution 2.44 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		34	.	.	.		.	.	40	.	.	.				.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure						.							.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.							.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	P	S	.	Q	G	D	N	M	P	.	.	.	A	Y	H	A	R	P	K	Q	S	D	G	P	L	P	V	V	I	V	V	Q	E	I	F	G	V	H	E	H	I	R	D	I	C	R	R	L	A	L	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	A	I	A	P	E	L	Y	F
Query Conservation						.							.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.							.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	Y	T	F	E	N	G	R	T	I	P	V	Q	X	G	Y	E	T	Y	G	T	L	N	R	E	R	S	N	V	I	L	I	C	H	Y	F	S	A	T	S	H	A	A	G	K	Y	T	A	H	D	E	E	S	G	W	W	D	G	L	I	G	P	G	K	A	I	D	T	N	Q	Y	F	V	I	C	T	D	N	L	C
Template Known Secondary structure						T	T	S													S				T	T											T	T			S			S	S		S	S	T	T		S	S			T	T	T	T	T			T	T	S	S			T	T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.											.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	G	D	P	N	D	F	A	D	I	P	T	L	L	S	G	L	V	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	D	S	Q	V	L	A	D	L	D	H	V	A	S	W	A	S	R	N	G	G	D	V	H	R	L	M	I	T	G	F	C	W	G	G	R	I	T	W	L	Y	A	A	H	N	P	Q	L
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.
Template Sequence		N	V	Q	V	K	N	P	H	V	I	T	T	G	P	K	S	I	N	P	K	T	G	D	E	Y	A	X	D	F	P	V	F	T	F	L	D	V	A	R	X	Q	C	E	L	I	K	D	X	G	I	A	R	L	.	.	.	.	H	A	V	X	G	P	S	A	G	G	X	I	A	Q	Q	W	A	V	H	Y	P	H	X
Template Known Secondary structure			S		T	T	S	T	T					S	T	T	S	B		T	T	T	S	S	B		G	G	G	S																			T	T				B	.	.	.	.	S						T														T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.					.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	A	V	A	W	Y	G	K	L	T	G	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	E	R	X	I	G	V	I	T	N	P	Q	N	P	I	I	T	S	V	N	V	A	Q	N	A	I	E	A	I	R	L	D	P	S	W	K	G	G	K	Y	G	E	E	Q	P	X	K	G	L	Q	L	A	N	R	X	X	F	X	N	A	F	D	E	H	F	Y	E	T	T	Y	P	R	N	S	I	E	V	E	P	Y
Template Known Secondary structure		B	S						S			S	B									T	T										S	G	G	G	G	G	G			T	T	S															T	T	S	S									S				S	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.
																																										178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	N	S	P	K	Q	P	V	D	I	A	T	D	L	N	A	P	I	L	G	L	Y	G	G	Q	D	N	S	I	P	Q	E	S	V	E	T	M	R	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	V	S	S	L	T	S	F	E	K	E	I	N	K	L	T	Y	R	S	I	E	L	V	D	A	N	S	W	X	Y	T	A	K	A	V	L	L	H	D	I	A	H	G	F	S	S	L	E	E	A	L	S	N	V	E	A	N	V	L	X	I	P	C	K	Q	D	L	L	Q	P	S	R	Y	N	Y	K	X	V	D
Template Known Secondary structure		T		T	T																T	T	T	T																	B	T	T	T	T	S	S								T			S							B	T	T		S	S	S		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.		.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.
Query SS confidence																		.
Query Sequence		A	L	R	A	A	N	A	K	A	E	I	I	V	Y	P	D	.	A	G	H	A	F	N	A	D	Y	R	P	S	Y	H	A	A	S	A	E	D	G	W	Q	R	M	L	E	W	F	K	Q	Y	G	G
Query Conservation																		.
Alig confidence																		.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	Q	K	Q	G	K	Y	A	E	V	Y	E	I	E	S	I	N	G	H	X	A	G	V	F	D	I	H	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	K	V	Y	E	F	L	N	R	K	V	S
Template Known Secondary structure						T	T								B			T	T	G	G	G						G	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.										S			S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.									.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions