Job Description P56262 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 12:06:23 GMT 2012 Rank 137 Aligned Residues 220 % Identity 21% Template c2rauA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative esterase; PDBTitle: crystal structure of a putative lipase (np_343859.1) from sulfolobus2 solfataricus at 1.85 a resolution Resolution 1.85 Å

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		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.															.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.																	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	V	A	G	F	T	S	I	P	S	Q	G	D	N	M	P	A	Y	H	A	R	P	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	G	P	L	P	V	V	I	V	V	Q	E	I	F	G	V	H	E	H	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	C
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	V	K	R	E	A	P	I	L	G	N	D	Q	L	I	E	N	I	W	K	X	K	R	E	D	S	P	Y	D	I	I	S	L	H	K	V	N	L	I	G	G	G	N	D	A	V	L	I	L	P	G	T	W	S	S	G	E	Q	L	V	T	I	S	W	N	G	V	H	Y	T	I	P	D	Y	R	K	S	I	V
Template Known Secondary structure											T	T														S	S	S	T	T											T	T												T	T									S			T	T				S				G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	R	L	A	L	E	G	Y	L	A	I	A	P	E	L	Y	F	R	E	G	D	P	N	D	F	A	D	I	P	T	L	L	S	G	L	V	A	K	V	P	D	S	Q	V	L	A	D	L	D	H	V	A	S	W	A	S	R	N	G	G	D	V	H	R	L	M	I	T	G	F	C	W	G	G	R	I	T	W	L	Y
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.																																	.
Template Conservation																											.	.	.	.																																	.
Template Sequence		L	Y	L	A	R	N	G	F	N	V	Y	T	I	D	Y	R	T	H	Y	V	P	P	F	L	K	.	.	.	.	D	R	Q	L	S	F	T	A	N	W	G	W	S	T	W	I	S	D	I	K	E	V	V	S	F	I	K	R	D	S	G	Q	.	E	R	I	Y	L	A	G	E	S	F	G	G	I	A	A	L	N	Y
Template Known Secondary structure							T	T									G	G	G	G			T	T			.	.	.	.	G	G	G	G	G	G	G	T	T		S																						.	S	S							T
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.																																	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110					.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.		.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		157	.	.			160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	H	.	.	N	P	Q	L	K	A	A	V	A	W	Y	G	K	L	T	G	D	K	S	L	N	S	P	K	Q	P	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	S	L	Y	W	K	N	D	I	K	G	L	I	L	L	D	G	G	P	T	K	H	G	I	R	F	Y	T	P	E	V	N	S	I	E	E	X	E	A	K	G	I	Y	V	I	P	S	R	G	G	P	N	N	P	I	W	S	Y	A	L	A	N	P	D	X	P	S	P	D	P	K	Y	K	S	I	S	D	F	L	X
Template Known Secondary structure																	S		S		B		T	T							S		S	S								T							S	S	S	T	T		T								S	T	T	S			S	S	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
																																															188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	T	D	L	N	A	P	I	L	G	L	Y	G	G	Q	D	N	S	I	P	Q	E	S	V	E	T	M	R	Q	A	L	R	A	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	S	L	Y	V	T	G	S	A	N	P	Y	D	Y	P	Y	S	K	K	E	D	X	F	P	I	L	A	S	F	D	P	Y	W	P	Y	R	L	S	L	E	R	D	L	K	F	D	Y	E	G	I	L	V	P	T	I	A	F	V	S	E	R	F	G	I	Q	I	F	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	L
Template Known Secondary structure							T	T	S			T	T	S	T	T													T	S		S									T	T	T						T	T											T	T	T					B		G	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.									.	.	.
		223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.		.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		N	A	K	A	E	I	I	V	Y	P	D	A	G	H	.	A	F	N	A	D	Y	R	P	S	Y	H	A	A	S	A	E	D	G	W	Q	R	M	L	E	W	F	K	Q	Y
Query Conservation																.
Alig confidence																.						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	N	S	E	I	I	L	L	K	G	Y	G	H	L	D	V	Y	T	G	.	.	.	.	.	.	E	N	S	E	K	D	V	N	S	V	V	L	K	W	L	S	Q	Q
Template Known Secondary structure			T	T							T	T			G	G	G	G	T	S	S	.	.	.	.	.	.	T	T					T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.							.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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