Job Description P0ADT5 Confidence 96.75% Date Thu Jan 5 11:21:48 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 234 % Identity 17% Template d1m0wa2 SCOP info ATP-grasp Glutathione synthetase ATP-binding domain-like Eukaryotic glutathione synthetase ATP-binding domain Resolution 1.80

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		37	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.										.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.							.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	Y	K	L	T	L	A	Q	V	E	K	L	E	E	V	T	A	E	L	H	Q	M	C	L	K	V	V	E	K	V	I	A	S	D	E	L	M	T	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	I	P	K	H	T	W	S	F	V	R	Q	S	W	L	T	H	Q	P	.	.	.	.	.	.	S	L	Y	S	R	L
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	T	P	I	P	R	K	C	F	D	E	A	V	Q	I	Q	P	V	F	N	E	L	Y	A	R	I	T	Q	D	M	A	Q	P	D	S	Y	L	H	K	T	T	E	A	L	A	L	S	D	S	E	F	T	G	K	L	W	S	L	Y	L	A	T	L	K	S	A	Q	Y	K	K	Q	N	F	R	L	G	I	F	R	S
Template Known Secondary structure																																T		T	T	S													T	T	T	T												T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.				.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.
Query SS confidence												.	.	.
Query Sequence		D	L	A	W	D	G	T	G	E	P	.	.	.	K	L	L	E	N	N	A	D	T	P	T	S	L	Y	E	A	A	F	F	Q	W	I	W	L	E	D	Q	L	N	A	G	N	L	P	E	G	S	D	Q	F	N	S	L	Q	E	K	L	I	D	R	F	V	E	L	R	E	Q	Y	G	F	Q	L	L	H	L	T	C
Query Conservation												.	.	.
Alig confidence												.	.	.																					.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	L	I	D	K	K	K	G	T	E	Q	I	K	Q	V	E	F	N	T	V	S	V	S	F	A	G	L	S	E	K	V	D	.	R	L	H	S	Y	L	N	R	A	N	K	Y	D	P	K	G	P	I	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T												S	S												.									T	T	S	S		T	T	S		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.		.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	R	D	T	V	E	D	R	G	T	I	Q	Y	L	Q	D	C	A	T	E	A	E	I	A	T	E	F	L	Y	I	D	D	I	G	L	G	E	K	G	Q	F	T	D	L	Q	D	Q	V	I	S	N	L	F	K	L	Y	P	W	E	F	M	L	R	E	M	F	S	T	K	L	E	D	A	G	V	R	W	L	E	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	N	M	V	I	S	D	S	G	Y	L	L	S	K	A	L	A	K	A	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	B																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																			183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	W	K	S	I	I	S	N	K	A	L	L	P	L	L	W	E	M	F	P	N	H	P	N	L	L	P	A	Y	F	A	E	D	D	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	E	K	Y	V	V	K	P	I	F	S	R	E	G	A
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.														.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.														.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	S	Y	K	S	Q	Q	K	K	I	Q	Q	L	L	.	.	.	.	.	T	D	E	G	V	L	G	K	Y	I	S	D	A	E	K	K	S	S	L	L	K	T	F	V	K	I	Y	P	L	D	D	T	K	L	G	R	E	G	K	R	L	A	L	S	E	P	S	K	Y	V	L	K	P	Q	R	E	G	G	G	N
Template Known Secondary structure		.	.					T								T	.	.	.	.	.	T	S					T	T	T												T	T								S	S	S														G	G	G						S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
				205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.						.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330				.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	350	.	.	.	.	.	.	.	.							.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	V	S	I	I	E	N	G	K	T	I	E	A	A	E	G	P	Y	G	E	.	.	.	E	G	M	I	V	Q	Q	F	H	P	L	P	K	F	G	D	S	Y	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	G	S	W	L	V	N	D	.	.	.	.	.	.	Q	P	A	G	I	G	I
Query Conservation																						.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.															.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.
Template Sequence		N	V	.	.	.	.	Y	K	E	N	I	P	N	F	L	K	G	I	E	E	R	H	W	D	A	Y	I	L	M	E	L	I	E	P	E	L	N	E	N	N	I	I	L	R	D	N	K	S	Y	N	E	P	I	I	S	E	L	G	I	Y	G	C	V	L	F	N	D	E	Q	V	L	S	N	E	F	S	G	S	L	L
Template Known Secondary structure				.	.	.	.		G	G	G							T	S		G	G	G	G	G	G												B		S						T	T							B														S	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Template SS confidence
		391	.					.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
		366
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		467

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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