Job Description P0ADT5 Confidence 99.25% Date Thu Jan 5 11:21:48 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 353 % Identity 17% Template c2wyoC_ PDB info PDB header:ligase Chain: C: PDB Molecule:glutathione synthetase; PDBTitle: trypanosoma brucei glutathione synthetase Resolution 3.15 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.				.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.				.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.			.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.																																				.	.	.															.	.
Query SS confidence																				.	.	.																																				.	.	.															.	.
Query Sequence		D	W	R	E	K	A	H	E	Y	G	F	N	F	H	T	M	Y	G	.	.	.	E	P	Y	W	C	E	D	A	Y	Y	K	L	T	L	A	Q	V	E	K	L	E	E	V	T	A	E	L	H	Q	M	C	L	K	V	V	.	.	.	E	K	V	I	A	S	D	E	L	M	T	K	F	R	.	.	I	P	K	H	T
Query Conservation																				.	.	.																																				.	.	.															.	.
Alig confidence																				.	.	.																																				.	.	.															.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	F	A	A	K	C	H	E	L	G	M	V	M	K	E	S	A	G	P	G	R	V	P	V	P	V	T	L	Q	P	S	M	I	S	R	G	E	F	G	T	L	C	C	M	Q	P	L	W	N	E	A	V	D	N	T	A	R	N	F	T	F	L	R	D	A	L	Q	E	T	A	A	S	D	V	N	F	T	G	K	L
Template Known Secondary structure											T						S	S	S	S									S	S																												T								T	T							S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		17	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.						90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110				.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.																						.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.																						.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	S	F	V	R	Q	S	.	.	.	.	.	W	L	T	H	Q	P	S	L	Y	S	R	L	D	L	A	W	D	G	T	G	E	.	.	.	P	K	L	L	E	N	N	A	D	T	P	T	S	L	Y	E	A	A	F	F	Q	W	I	W	L	E	D	Q	L	N	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation									.	.	.	.	.																						.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.																						.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	M	L	Q	E	V	Y	L	S	G	G	P	F	Q	Q	L	M	L	G	I	F	R	T	D	Y	M	R	E	G	V	T	T	A	S	R	W	K	N	V	E	I	N	T	I	S	C	S	F	A	G	L	S	P	L	I	T	E	F	H	Q	H	I	A	A	Y	L	Q	V	L	Q	K	A	R	G	K	E	D	E	N
Template Known Secondary structure										T	S	S																		B							S									S	S				T	T	T																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
										142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	L	P	E	G	S	D	Q	F	N	S	L	Q	E	K	L	I	D	R	F	V	E	L	R	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	F	Q	L	L	H	L	T	C	C	R	D	T	V	E	D	R	G	T	I	Q	Y	L	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	S	W	I	W	G	K	G	N	C	R	L	E	R	S	V	S	G	D	V	V	P	K	A	I	A	D	A	V	R	A	W	V	E	Q	Q	K	F	A	S	L	R	A	S	W	E	Q	F	Q	Q	N	L	G	V	L	D	T	A	P	V	V	L	V	V	V	Q	E	N	E	R	N	T	A	D	Q	Y	A	L	L	M
Template Known Secondary structure			T	T	S	S		S	S	S							T																					T												T								S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.										.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.			.	.	.	.	.	.	240	.	.				.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.										.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.										.	.	.
Query Sequence		D	C	A	T	E	A	E	I	A	T	E	F	L	Y	I	D	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	G	E	K	G	Q	F	T	D	L	Q	D	Q	V	I	S	N	L	F	K	L	.	.	Y	P	W	E	F	M	L	R	E	.	.	.	M	F	S	T	K	L	E	D	A	G	V	R	W	L	E	P	A
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.										.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.										.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	L	E	E	H	R	I	R	F	I	F	R	T	L	Q	E	L	H	L	S	L	K	L	H	S	I	S	P	E	Q	P	P	L	A	V	V	D	G	H	Y	P	I	A	V	A	Y	F	R	S	T	Y	V	P	E	D	F	P	T	D	A	T	W	A	A	R	L	S	L	E	R	S	S	A	I	K	C	P	S	I
Template Known Secondary structure						T	T																					S	S	T	T	S							T	T	T										S		S	S	G	G	G			S													S	S	S				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	K	S	I	I	S	N	K	A	L	L	P	L	L	W	E	M	F	P	N	H	P	N	L	L	P	A	Y	F	A	E	D	D	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	E	K	Y	V	V	K	P	I	F	S	R	E	G	A	N	V	S	I	I	E	N	G
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.																																																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Y	H	L	L	T	F	K	K	L	Q	Q	L	L	C	D	.	.	V	D	R	V	L	V	P	V	A	F	C	G	D	S	D	K	A	G	L	L	Q	R	H	F	V	P	Q	Y	S	L	N	P	K	E	V	G	E	E	A	V	E	K	D	V	L	Q	R	P	L	E	G	G	G	N	L	L	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	S							T	T		.	.	T	T	T	T	T	T	T	T	S	S	T	T										T	T								S	S	S	S	T	T	S								S								S	S	T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.																																																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.			.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		350	.	.	.	.	.	.	.																.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	T	I	E	A	A	E	G	P	Y	G	E	E	G	M	I	V	Q	Q	F	H	P	L	P	K	F	G	D	S	Y	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	I	G	S	W	L	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	P	A	G	I	G	I	R
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	E	.	.	Y	V	V	M	S	R	I	Q	F	H	V	S	T	G	S	L	L	A	R	G	D	V	V	Q	L	E	R	N	M	C	S	E	V	G	I	F	G	V	I	L	S	A	A	K	G	S	S	V	G	T	N	G	S	S	V	L	F	N	T	F	A	G	Y	T	V	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		.	.									B										T	T	T																							T	T				S	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.				.	.
Template SS confidence
											439	440	.			.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	R	A	L	I	T	Q	D	M	S	R	F	Y	P	H	I	F
Query Conservation
Alig confidence				.	.
Template Conservation				.	.
Template Sequence		S	K	.	.	P	A	D	G	V	A	A	L	D	S	L	A	V	V
Template Known Secondary structure				.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.
Template SS confidence
		531	.			.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.