Job Description P0AD27 Confidence 98.89% Date Wed Jan 25 15:20:24 GMT 2012 Rank 33 Aligned Residues 247 % Identity 17% Template d1zeda1 SCOP info Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase Resolution 1.57

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.																.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.		.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		R	Y	R	D	M	G	T	G	Q	N	V	L	L	I	T	V	D	G	L	N	Y	S	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	Q	M	P	A	L	A	G	F	A	E	Q	N	I	S	F	T	R	H	M	.	S	S	G	N	T	T	D	N	G	I	F	G	L	F	Y	G	I	S	P
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation
Template Sequence		L	Q	P	A	Q	T	A	A	K	N	L	I	I	F	L	G	D	G	M	G	V	S	T	V	T	A	A	R	I	L	K	G	Q	K	K	D	K	L	G	P	E	I	P	L	A	M	D	R	F	P	Y	V	A	L	S	K	T	Y	N	V	D	K	H	V	P	D	S	G	A	T	A	T	A	Y	L	C	G	V	K	G
Template Known Secondary structure						S	B			S								T	T																	T	T	S		S	T	T	S			T	G	G	G		S										S	S		S	S													S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.													.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	M	D	G	I	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	T	P	A	A	L	I	T	A	L	N	Q	Q	G	Y	Q	L	G	L	F	S	S	D	G	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	F	Q	T	I	G	L	S	A	A	A	R	F	N	Q	C	N	T	T	R	G	N	E	V	I	S	V	M	N	R	A	K	K	A	G	K	S	V	G	V	V	T	T	T	R	V	Q	H	A	S	P	A	G	T	Y	A	H	T	V	N	R	N	W	Y	S	D	A	D	V	P	A	S	A	R	Q	E	G	C	Q	D
Template Known Secondary structure			T	T		B	S	B		T	T	S		T	T		G	G	G		T	T		B											T	T											T	T	S					T	T	T			B	S		T	T			S	G	G	G	S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
									351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380													.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	S	P	L	Y	R	Q	A	L	L	S	D	F	S	M	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	R	T	Q	S	D	E	Q	T	A	T	Q	W	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	W	L	G	R	Y	A	Q	E	D	N	R	W	F	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	A	T	Q	L	I	S	N	M	D	I	D	V	I	L	G	G	G	R	K	Y	M	F	R	M	G	T	P	D	P	E	Y	P	D	D	Y	S	Q	G	G	T	R	L	D	G	K	N	L	V	Q	E	W	L	A	K	R	Q	G	A	R	Y	V	W	N	R	T	E	L	M	Q	A	S	L	D	P	S	V	T	H	L
Template Known Secondary structure									T	S			S							G	G	G	G	S	B	T	T				S	S		T	T		G	G	G	S			B	S	S											T		T	T						S									T		T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		396	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	V	S	F	N	G	T	N	I	D	D	S	N	Q	Q	A	F	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	Y	S	R	A	A	G	N	V	D	D	Q	I	N	R	V	L	N	A	L
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	G	L	F	E	P	G	D	M	K	Y	E	I	H	R	D	S	T	L	D	P	S	L	M	E	M	T	E	A	A	L	R	L	L	S	R	N	P	R	G	F	F	L	F	V	E	G	G	R	I	D	H	G	H	H	E	S	R	A	Y	R	A	L	T	E	T	I	M	F	D	D	A	I	E	R	A	G	Q	L	T
Template Known Secondary structure						S	S	S	S				G	G	G			T	T	T																T	T		T	T									T	T							T	T																							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	D	S	G	K	L	D	N	T	V	V	I	I	T	A	G	R	G	I	P	L	S	E	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.
Template Sequence		S	E	.	.	.	.	E	D	T	L	S	L	V	T	A	D	H	S	H	V	F	S	F	G	G	Y	P	L	R	G	S	S	I	F	G	L	A	P	G	K	A	R	D	R	K	A	Y	T	V	L	L	Y	G	N	G	P	G	Y	V	L	K	D	G	A	R	P	D	V	T	E	S	E	S	G	S	P	E	Y	R	Q
Template Known Secondary structure			T	.	.	.	.	T	T								S				S					S				T	T			T	T	S	B		S	S			T	T	S	S			B	S						S	T	T				B	T	T	B										T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Template SS confidence
		346	.					.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
						460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	E	T	F	D	W	S	H	G	H	L	Q	V	P	L	V	I	H	W	P	G	T	P	A	Q	R	I	N	A	L	T	D	H	T	D	L	M	T	T	L	M	Q	R	L	L	H	V
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																								.	.																.
Template Conservation																													.	.																.
Template Sequence		Q	S	A	V	P	L	D	E	E	T	H	A	G	E	D	V	A	V	F	A	R	G	P	Q	A	H	L	.	.	V	H	G	V	Q	E	Q	T	F	I	A	H	V	M	A	.	F	A	A	C	L
Template Known Secondary structure								S	S						S								S	T	T	G	G	G	.	.			S				T	T								.			T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.																.
Template SS confidence
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.			.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.		.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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