Job Description P0AD27 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:24 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 326 % Identity 23% Template c3ed4A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:arylsulfatase; PDBTitle: crystal structure of putative arylsulfatase from escherichia coli Resolution 1.70 Å

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		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.							.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.										.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Q	N	V	L	L	I	T	V	D	G	L	N	Y	S	R	F	E	K	Q	.	.	.	.	.	.	M	P	A	L	A	G	F	A	E	Q	N	I	S	F	T	R	H	M	S	S	G	N	T	T	D	N	G	I	F	G	L	F	Y	G	I	S	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	M	D	G	I	L	S
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	P	N	L	V	I	I	M	A	D	D	L	G	Y	G	D	L	A	T	Y	G	H	Q	I	V	K	T	P	N	I	D	R	L	A	Q	E	G	V	K	F	T	D	Y	Y	A	P	A	P	L	S	S	P	S	R	A	G	L	L	T	G	R	M	P	F	R	T	G	I	R	S	W	I	P	S	G	K	D	V	A	L
Template Known Secondary structure											S	S			T	T	S	S	G	G	G	T		S	S												T	S				S	S				S	S	S	S											T	S		G	G	G	G	T		S	S				T	T	S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	R	T	P	A	A	L	I	T	A	L	N	Q	Q	G	Y	Q	L	G	L	F	S	S	D	G	F	T	S	P	L	Y	R	Q	A	L	L	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	R	N	E	L	T	I	A	N	L	L	K	A	Q	G	Y	D	T	A	M	M	G	K	L	H	L	N	A	G	G	D	R	T	D	Q	P	Q	A	Q	D	M	G	F	D	Y	S	L	A	N	T	A	G	F	V	T	D	A	T	L	D	N	A	K	E	R	P	R	Y	G	M	V	Y	P	T	G	W	L	R	N	G
Template Known Secondary structure			T	T										T	T	T											S	S	S		T	T		T	T	S			T	T	T	T	T		S							S	S	S								T			S	S	S		B							S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	S	M	P	S	V	R	T	Q	S	D	E	Q	T	A	T	Q	W	I	N	W	L	G	R	Y	A	Q	E	D	N	R	W	F	S	W	V	S	F	N	G	T	N	I	D	D	S	N	Q	Q	A	F	A	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.
Template Sequence		Q	P	T	P	R	A	D	K	M	S	G	E	Y	V	S	S	E	V	V	N	W	L	D	N	K	.	K	D	S	K	P	F	F	L	Y	V	A	F	T	E	V	H	S	P	L	A	S	P	K	K	Y	L	D	M	Y	S	Q	Y	M	S	A	Y	Q	K	Q	H	P	D	L	F	Y	G	D	W	A	D	K	P	W	R
Template Known Secondary structure								S	S																T		.		S	S											T	T	S	S	S										T	T	G	G	G	B							S	T	T	B		G	G	G		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.		.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
						416	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	Y	S	R	A	A	G	N	V	D	D	Q	I	N	R	V	L	N	A	L	R	D	S	G	K	L	D	N	T	V	V	I	I	T	A	G	R	G	I	P	L	S	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	T	F	D	W	S	H	G	H	L	Q	V	P	L	V	I
Query Conservation		.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	G	E	Y	Y	A	N	I	S	Y	L	D	A	Q	V	G	K	V	L	D	K	I	K	A	M	G	E	E	D	N	T	I	V	I	F	T	S	D	N	G	P	V	T	R	E	A	R	K	V	Y	E	L	N	L	A	G	E	T	D	G	L	R	G	R	K	D	N	L	W	E	G	G	I	R	V	P	A	I	I
Template Known Secondary structure		B	S																								T	T		G	G	G								S	S					S				S	G	G	G	T	T						T	T		S			T	T			S					B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		476	.	.	.	480			.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.							520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530								.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure							.	.																																								.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.																																								.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	W	P	G	T	.	.	P	A	Q	R	I	N	A	L	T	D	H	T	D	L	M	T	T	L	M	Q	R	L	L	H	V	S	T	P	A	S	E	Y	S	Q	G	Q	D	L	F	.	.	.	.	.	.	N	P	Q	R	R	H	Y	W	V	T	A	.	.	.	.	.	.	.	A	D	N	D	T	L	A	I	T	T
Query Conservation							.	.																																								.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.																				.																				.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.
Template Sequence		K	Y	G	K	H	L	P	Q	G	M	V	S	D	T	P	V	Y	G	L	D	W	M	P	T	L	A	.	K	M	M	N	F	K	L	P	T	D	R	T	F	D	G	E	S	L	V	P	V	L	E	Q	K	A	L	K	R	E	K	P	L	I	F	G	I	D	M	P	F	Q	D	D	P	T	D	E	W	A	I	R	D
Template Known Secondary structure				T	T	S	S		T	T					S				G	G	G							.				T					S	S	S												T	T						S	S										S		S	S
Template Predicted Secondary structure																												.
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.		.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		541	.	.	.	.	.	.	.		.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.				.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																					.	.	.
Query SS confidence										.																					.	.	.
Query Sequence		P	K	K	T	L	V	L	N	.	N	N	G	K	Y	R	T	Y	N	L	R	G	E	R	V	K	D	E	K	P	.	.	.	Q	L	S	L	L	L	Q	V	L	T	D	E	K	R	F	I	A	N
Query Conservation										.																					.	.	.
Alig confidence										.																					.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	W	K	M	I	I	D	R	N	N	K	P	K	Y	L	Y	N	L	K	S	D	R	Y	E	T	L	N	L	I	G	K	K	P	D	I	E	K	Q	M	Y	G	K	F	L	K	Y	K	T	D
Template Known Secondary structure		T	T							T	T	S								T	T	T		T	T	S		S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.